Summary
Molecular Ab Initio Calculations
calcoli molecolari ab initio per DebiChem
Questo metapacchetto installa i pacchetti che eseguono calcoli molecolari
ab initio che possono essere utili per i chimici.
Description
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the DebiChem mailing list
Links to other tasks
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DebiChem Molecular Ab Initio Calculations packages
Official Debian packages with high relevance
aces3
concetti avanzati in strutture elettroniche III
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Versions of package aces3 |
Release | Version | Architectures |
jessie | 3.0.8-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 3.0.8-5.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 3.0.8-6 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 3.0.8-7 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 3.0.8-9 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package aces3: |
role | program |
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License: DFSG free
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ACESIII è un programma di calcoli per strutture elettroniche che si
focalizza sui metodi correlati. È il successore parallelo di ACESII, e
utilizza SIAL (Super Instruction Assembly Language) come infrastruttura di
parallelizzazione. Tra le funzionalità sono incluse:
Energie, gradienti analitici e hessiani analitici per i seguenti metodi:
- spin limitato/illimitato o metodo Hartree-Fock open-shell ristretto;
- teoria di perturbazione Moeller-Plesset di secondo ordine (MP2).
Energie e gradienti analitici per i seguenti metodi:
- Coupled-Cluster con singole e doppie eccitazioni (CCSD).
In aggiunta può elaborare energie per i seguenti metodi:
- Coupled-Cluster con singole e doppie eccitazioni e perturbazioni con
triple eccitazioni (CCSD(T));
- interazioni di configurazioni quadratiche con singole e doppie
eccitazioni (QCISD).
Gli stati eccitati possono essere calcolati dai seguenti metodi:
- interazioni di configurazioni quadratiche con singole e doppie
eccitazioni;
- equazioni di movimento per Coupled Cluster (EOM-CC).
Include anche un ottimizzatore interno per geometria di coordinate. Se non
sono disponibili gradienti analitici, sono usati gradienti numerici tramite
differenze finite.
Please register by following this link if you are using aces3.
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bagel
pacchetto di chimica computazionale
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Versions of package bagel |
Release | Version | Architectures |
stretch | 0.0~git20170109-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
buster | 1.2.2-1 | amd64,arm64 |
bullseye | 1.2.2-2 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.2.2-6 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
trixie | 1.2.2-8 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 1.2.2-8 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
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License: DFSG free
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BAGEL (Brilliantly Advanced General Electronic-structure Library) è un
pacchetto di chimica computazionale orientato a calcoli paralleli su larga
scala. Si specializza su metodi altamente accurati e include fit di densità
ed effetti relativistici per la maggior parte dei metodi che implementa.
Può calcolare energie e gradienti per i seguenti metodi:
- Hartree-Fock (HF);
- teoria del funzionale della densità (DFT);
- teoria della perturbazione di secondo ordine di Moeller-Plesset (MP2);
- spazio attivo completo SCF (CASSCF);
- teoria della perturbazione di secondo ordine dello spazio attivo
completo (CASPT2);
- CASPT2 multistato estesa (XMS-CASPT2).
Inoltre può calcolare energie per i seguenti metodi:
- CIS (Configuration-Interaction Singles);
- FCI (Full Configuration-Interaction);
- multireference configuration-interaction multistato internamente
contratta (ic-MRCI);
- teoria della perturbazione di secondo ordine N-electron valence-state
(NEVPT2);
- active-space decomposition (ASD) per dimeri e per siti multipli tramite
gruppo di rinormalizzazione della matrice di densità (ASD-DMRG).
BAGEL è in grado di ottimizzare le geometrie stazionarie e le intersezioni
coniche e di calcolare le frequenze vibrazionali.
BAGEL non include un'interfaccia verso il disco, per cui è necessario che
tutti i calcoli entrino in memoria.
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chemps2
eseguibile per richiamare libchemps2-3t64 dalla riga di comando
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Versions of package chemps2 |
Release | Version | Architectures |
stretch | 1.8.3-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.8.9-1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 1.8.10-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.8.12-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 1.8.12-3.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
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License: DFSG free
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chemps2 è una libreria scientifica che contiene un'implementazione
spin-adapted di DMRG (Density Matrix Renormalization Group) per chimica
quantistica ab initio. Questo metodo di funzione d'onda permette di
ottenere accuratezza numerica in spazi attivi al di là delle possibilità di
FCI (Full Configuration Interaction) e permette di estrarre le matrici di
densità ridotta a 2, 3 e 4 particelle (2-, 3- e 4-RDM) dello spazio attivo.
Per gli spazi generali attivi possono essere gestiti con DRMG fino a 40
elettroni in 40 orbitali e per spazi monodimensionali attivi fino a 100
elettroni in 100 orbitali. Anche le 2-RDM di tali spazi attivi possono
essere facilmente estratte, mentre le 3- e le 4-RDM sono limitate a circa
28 orbitali.
Quando la dimensione dello spazio attivo diventa costosa in maniera
proibitiva per FCI, DMRG può essere usato per sostituire il risolutore FCI
nel metodo CASSCF (Complete Active Space Self Consistent Field) nel
corrispondente CASPT2 (Complete Active Space Second Order Perturbation
Theory). I metodi corrispondenti sono chiamati rispettivamente DMRG-SCF e
DMRG-CASPT2. Per DMRG-SCF, è necessaria la 2-RDM dello spazio attivo e per
DMRG-CASPT2 la 4-RDM dello spazio attivo.
Questo pacchetto installa l'eseguibile che analizza gli hamiltoniani nel
formato di fcidump ed esegue calcoli DMRG-SCF e DMRG-CASPT2 come
specificati dall'utente.
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cp2k
dinamica molecolare ab initio
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Versions of package cp2k |
Release | Version | Architectures |
jessie | 2.5.1-3 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 4.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 6.1-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 8.1-9 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2023.1-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 2023.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
upstream | 2024.3 |
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License: DFSG free
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CP2K è un programma per fare simulazioni di sistemi allo stato solido,
liquido, sistemi molecolari e biologici. È espressamente pensato per metodi
per strutture elettroniche massivamente paralleli e scalabili linearmente e
per simulazioni di dinamica molecolare ab-initio (AIMD) allo stato
dell'arte. Le sue caratteristiche comprendono:
CP2K è ottimizzato per il metodo misto GPW (gaussiane e onde piane) basato
su pseudopotenziali, ma è in grado di eseguire anche i calcoli a tutti gli
elettroni oppure puramente su onde piane/gaussiane. Le sue funzionalità
includono:
Metodi della teoria della struttura elettronica ab-initio usando il modulo
QUICKSTEP:
- energie e forze della teoria del funzionale della densità (DFT);
- energie e forze Hartree-Fock (HF);
- energie e forze della teoria della perturbazione di secondo ordine di
Moeller-Plesset (MP2);
- energie RPA (Random Phase Approximation);
- fase gassosa e condizioni periodiche al contorno (PBC, Periodic
Boundary Conditions);
- gli insiemi base includono vari orbitali di tipo gaussiano (GTO)
standard, onde piane (PW) pseudopotenziali e un approccio misto
gaussiano e con onde piane (aumentate) (GPW / GAPW);
- pseudo potenziali a norma conservata separabili GTH (Goedecker-Teter-
Hutter) e NLCC (Non-Linear Core Corrected) o calcolo a tutti gli
elettroni;
- pseudopotenziali (PP) incluso il PP a norma conservata separabile
Goedecker-Teter-Hutter (GTH);
- funzionali XC di approssimazione della densità locale (LDA) inclusi
SVWN3, SVWN5, PW92 e PADE;
- funzionali XC a gradiente corretto (GGA) inclusi BLYP, BP86, PW91, PBE e
HCTH120, così come il funzionale XC meta-GCA TPSS;
- funzionali XC ibridi con scambio Hartree-Fock (HFX) esatto inclusi
B3LYP, PBE0 e MCY3;
- funzionali XC doppio-ibrido XC inclusi B2PLYP e B2GPPLYP;
- funzionali XC aggiuntivi attraverso LibXC;
- correzioni di dispersione attraverso modelli di potenziale di coppia
DFT-D2 e DFT-D3;
- correzioni van der Waals non locali per funzionali XC inclusi B88-vdW,
PBE-vdW e B97X-D;
- correzione DFT+U (Hubbard);
- fitting della densità per DFT con Bloechl o DDAPC (Density Derived
Atomic Point Charges), per HFX con metodi ADMM (Auxiliary Density
Matrix Methods) e per MP2/RPA con RI (risoluzione all'identità);
- tecniche per matrici sparse e prescreening per calcolo di matrici
Kohn-Sham (KS) per scalamento lineare;
- minimizzatore del campo autoconsistente (SCF) per trasformazioni di
orbitale (OT) o inversione diretta del sottospazio
iterativo (DIIS);
- metodo LRIGPW (Local Resolution-of-Identity Projector Augmented Wave);
- energie ALMO-SCF (Absolutely Localized Molecular Orbitals SCF) per
scalamento lineare di sistemi molecolari;
- stati eccitati attraverso TDDFPT (teoria della perturbazione della
funzione di densità dipendente dal tempo).
Dinamica molecolare ab-initio:
- dinamica molecolare Born-Oppenheimer (BOMD);
- dinamica molecolare Ehrenfest (EMD);
- estrapolazione PS di funzione d'onda iniziale;
- integratore ASPC (Always Stable Predictor-Corrector) reversibile nel
tempo;
- dinamica molecolare approssimata Car-Parinello stile Langevin
Born-Oppenheimer (dinamica molecolare Car-Parrinello di seconda
generazione, SGCP).
Simulazioni miste quantistiche/classiche (QM/MM):
- approccio multigriglia in spazio reale per la valutazione delle
interazioni di Coulomb tra la parte QM e quella MM;
- trattamento con accoppiamento elettrostatico con scalamento lineare
delle condizioni periodiche al contorno;
- QM/MM adattivo.
Ulteriori funzionalità includono:
- calcoli di energie di singolo punto, ottimizzazioni geometriche e
frequenze;
- svariati algoritmi per NEB (Nudged-Elastic Band) (B-NEB, IT-NEB,
CI-NEB, D-NEB) per calcoli del percorso a energia minima (MEP);
- ottimizzazione globale delle geometrie;
- solvatazione con il modello SCCS (Solvation via the Self-Consistent
Continuum);
- calcoli semi-empirici incluse le parametrizzazioni AM1, RM1, PM3, MNDO,
MNDO-d, PNNL e PM6, DFTB (Density-Functional Tight-Binding) e SCP-TB
(Self-Consistent Polarization Tight-Binding) con o senza condizioni
periodiche al contorno;
- simulazioni di dinamica molecolare (MD) classica in insiemi
microcanonici (NVE) o insiemi canonici (NVT) con campionamento
Nose-Hover e canonico attraverso termostati a riscalamento di velocità
(CSVR);
- metadinamiche inclusa la metadinamica ben-temperata per calcoli
dell'energia libera;
- simulazioni classiche del campo di forza (MM);
- simulazioni KS-DFT Monte-Carlo (MC);
- proprietà statiche (es. spettri) e dinamiche (es. diffusione);
- codice ATOM per generazione di pseudopotenziali;
- ottimizzazione integrata dell'insieme di base molecolare.
CP2K non implementa la dinamica molecolare convenzionale di Car-Parrinello
(CPMD).
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elk-lapw
codice di struttura elettronica con funzionale della densità per tutti elettroni
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Versions of package elk-lapw |
Release | Version | Architectures |
jessie | 2.3.22-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 4.0.15-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 5.4.24-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 6.3.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 8.4.30-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 9.6.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
upstream | 10.1.15 |
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License: DFSG free
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Elk è un codice FP-LAPW (Full-Potential Linearised Augmented-Plane Wave) a
tutti gli elettroni. Non includendo pseudo-potenziali, Elk può fornire
risultati affidabili di alta precisione e funziona per ogni elemento
chimico. Le funzionalità includono:
- basi FP-LAPW con orbitali locali,
- derivata APW radiale corrispondente a ordini arbitrari sulla superficie
muffin-tin (super-LAPW, ecc.),
- è permesso un numero arbitrario di orbitali locali (tutti gli stati
fondamentali possono essere fatti valenza, per esempio),
- energie totali risolte in componenti,
- forze, inclusi IBS (Incomplete Basis Set) e lavoro di correzioni di
core con accoppiamento spin-orbitale, magnetismo non collineare e LDA+U,
- sono disponibili funzionali LSDA, GGA e meta-GGA (solo potenziali),
- LDA+U: FLL (Fully Localised Limit), AFM (Around Mean Field) e
interpolazione tra i due; funziona con SOC, NCM e spin-spirali,
- molecole isolate o sistemi periodici,
- stati fondamentali trattati con l'equazione radiale di Dirac,
- SOC (Spin-Orbit Coupling) incluso in modello secondo variazionale,
- NCM (Non Collinear Magnetism) con campi magnetici sul posto arbitrari,
- calcoli di momento di spin fisso (con SOC e NCM),
- TDDFT (Time-Dependent Density Functional Theory) per calcoli su
risposte ottiche lineari,
- risposte ottiche di primo ordine,
- generazione di seconde armoniche NLO (Non-Linear Optical).
Elk è parallelizzato tramite OpenMP/OpenMPI.
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ergo
programma di chimica quantistica per calcoli su larga scala
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Versions of package ergo |
Release | Version | Architectures |
jessie | 3.4.0-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 3.5-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
buster | 3.5-1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 3.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 3.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 3.8.2-1.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 3.8.2-1.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
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License: DFSG free
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ErgoSCF è un programma di chimica quantistica per calcoli su larga scala di
campi autocoerenti. Impiega moderne tecniche di scalatura lineare come i
metodi multipolari rapidi, l'algebra su matrici gerarchiche sparse, la
purificazione di matrici di densità e lo screening efficiente degli
integrali. La scalatura lineare è raggiunta non solo in termini di utilizzo
della CPU, ma anche di utilizzo della memoria. Usa insiemi di basi gaussiane.
Può calcolare energie single-point per i seguenti metodi:
- teoria Hartree-Fock (HF) ristretta e non ristretta,
- teoria del funzionale della densità (DFT) Kohn-Sham ristretta e non
ristretta,
- Full Configuration-Interaction (FCI).
I seguenti funzionali della densità Exchange-Correlational (XC) sono inclusi:
- approssimazione di densità locale (LDA),
- funzionali XC di gradiente corretto (GGA) BLYP, BP86, PW91 e PBE,
- funzionali XC ibridi B3LYP, BHandHLYP, PBE0 e CAMB3LYP.
Ulteriori funzionalità comprendono:
- calcoli di risposta lineare (polarizzabilità ed energie di eccitazione
per densità di riferimento ristretto,
- campi elettrici esterni,
- dinamica degli elettroni attraverso Time-Dependent Hartree-Fock (TDHF).
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mpqc
programma MPQC (Massively Parallel Quantum Chemistry)
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Versions of package mpqc |
Release | Version | Architectures |
jessie | 2.3.1-16 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 2.3.1-18+deb9u1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 2.3.1-19 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 2.3.1-21 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.3.1-22 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 2.3.1-22 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
Debtags of package mpqc: |
field | chemistry, physics |
interface | commandline, x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | gtk |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
MPQC è un programma di chimica quantistica ab-initio. È specificamente
progettato per elaborare molecole in modo altamente parallelo.
Può calcolare energie e gradienti per i seguenti metodi:
- Hartree-Fock (HF) closed shell e Hartree-Fock open shell ristretto;
- teoria del funzionale della densità (DFT);
- teoria perturbativa closed shell di Moeller-Plesset del secondo
ordine (MP2).
In aggiunta può calcolare le energie per i seguenti metodi:
- teoria open shell MP2 e closed shell MP2 esplicitamente correlate
(MP2-R12);
- teoria perturbativa open shell di secondo ordine (OPT2[2]);
- ZAPT2 (Z-averaged pertubation theory).
Include anche un ottimizzatore interno di coordinate geometriche.
MPQC è costruito sulla base del toolkit SC (Scientific Computing).
Please cite:
The Massively Parallel Quantum Chemistry Program (MPQC), Version 2.3.1, Curtis L. Janssen, Ida B. Nielsen, Matt L. Leininger, Edward F. Valeev, Joseph P. Kenny, Edward T. Seidl, Sandia National Laboratories, Livermore, CA.
(2008)
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mpqc3
programma MPQC (Massively Parallel Quantum Chemistry)
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Versions of package mpqc3 |
Release | Version | Architectures |
stretch | 0.0~git20170114-4 | amd64,arm64,i386,mips64el,ppc64el |
buster | 0.0~git20170114-4.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
|
License: DFSG free
|
MPQC3 è un programma di chimica quantistica ab-initio. È specificamente
progettato per elaborare molecole in modo esplicitamente correlato.
Può calcolare energie e gradienti per i seguenti metodi:
- Hartree-Fock (HF);
- teoria del funzionale della densità (DFT);
- teoria di perturbazione Moeller-Plesset di secondo ordine (MP2).
In aggiunta può elaborare energie per i seguenti metodi:
- MP2 locale (LMP2)
- MP2 density-fitted esplicitamente correlata (DF-MP2-F12)
- coupled-cluster con singole e doppie density-fitted esplicitamente
correlata (DF-CCSD-F12)
- coupled-cluster con singole e doppie density-fitted esplicitamente
correlata con triple perturbative (DF-CCSD(T)-F12)
- SCF completa active space density-fitted esplicitamente correlata
(DF-CASSCF-F12)
- interazione di configurazione multi-reference density-fitted
esplicitamente correlata (DF-MRCI-F12)
Include anche un ottimizzatore interno di coordinate geometriche.
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nwchem
??? missing short description for package nwchem :-(
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Versions of package nwchem |
Release | Version | Architectures |
jessie | 6.5+r26243-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 6.8.1-5 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 7.0.2-1 | amd64,arm64,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 7.0.2-4 | all |
sid | 7.2.3-6 | all |
Debtags of package nwchem: |
field | chemistry |
role | program |
|
License: DFSG free
|
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openmolcas
Quantum chemistry software package
|
Versions of package openmolcas |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 20.10-2 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 22.10-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
sid | 23.10-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
The key feature of OpenMolcas is the multiconfigurational approach to the
electronic structure.
It can compute energies, gradients and hessians for the following methods:
- Hartree-Fock SCF (HF)
- Complete active space SCF (CASSCF)
It can compute energies and gradients for the following methods:
- Hartree-Fock (HF)
- Density-Functional Theory (DFT)
- Second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
- Complete and restricted active space SCF (CASSCF/RASSCF)
Additionally, it can compute energies for the following methods:
- Closed shell Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
- Complete active space second order perturbation theory (CASPT2)
- Coupled-cluster singles doubles (CCSD), optionally wihth
Cholesky-Decomposition (CD)/Resolution-of-the Identity (RI)
- CD/RI Coupled-cluster singles doubles with perturbative
triples (CCSD(T))
- Density Matrix Renormalization Group SCF (DMRG-SCF)
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psi3
insieme di programmi di chimica quantistica
|
Versions of package psi3 |
Release | Version | Architectures |
jessie | 3.4.0-5 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
Debtags of package psi3: |
field | chemistry, physics |
interface | commandline |
role | program |
science | calculation |
scope | suite |
use | calculating |
|
License: DFSG free
|
PSI3 è un programma di chimica quantistica ab-initio. È progettato
specialmente per calcolare accuratamente le proprietà di molecole piccole o
medie usando tecniche ad alta correlazione.
Può calcolare energie e gradienti con i seguenti metodi:
- Hartree-Fock closed shell e open shell ristretto (RHF/ROHF)
(inclusi gli hessiani per RHF);
- teoria perturbativa di Møller-Plesset (MP2) per closed shell;
- Complete Active Space SCF (CASSCF);
- Coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni (CCSD);
- Coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni e triple eccitazioni
perturbative (CCSD(T))
(solo con funzioni d'onda di riferimento non-ristrette (UHF)).
Inoltre può calcolare le energie con i seguenti metodi:
- Hartree-Fock open shell non ristretto (UHF);
- Teoria perturbativa di Møller-Plesset closed/open shell (MP2);
- Teoria MP2 correlata esplicitamente (MP2-R12) per closed shell e teoria
MP2 scalata per componente di spin (SCS-MP2);
- Multireference configuration-interaction (MRCI);
- Coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni e triple eccitazioni
perturbative (CCSD(T));
- Coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni con approssimazione
del secondo e terzo ordine (CC2/CC3);
- Multireference coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni
(MRCCSD);
- Equazione coupled-cluster del moto con singole e doppie eccitazioni
closed shell e open shell ristretto (EOM-CCSD).
Le altre funzionalità:
- formato di input flessibile, modulare e personalizzabile;
- calcolo degli stati d'eccitamento con i metodi CC2/CC3, EOM-CCSD,
CASSCF, MRCI e MRCCSD;
- ottimizzatore delle coordinate geometriche interne;
- calcoli delle frequenze armoniche;
- proprietà di un elettrone quali momento del dipolo/quadripolo, orbitali
naturali, potenziale elettrostatico, costanti di accoppiamento iperfine
- densità di spin;
- utilizzo della simmetria molecolare punto-gruppo per aumentare
l'efficienza.
|
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psi4
insieme di programmi di chimica quantistica
|
Versions of package psi4 |
Release | Version | Architectures |
stretch | 1.0-1 | amd64,arm64,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
buster | 1.2.1-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 1.3.2+dfsg-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.3.2+dfsg-5 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 1.3.2+dfsg-5 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
jessie | 4.0~beta5+dfsg-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
upstream | 1.9.1 |
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License: DFSG free
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PSI4 è un programma di chimica quantistica ab-initio. È progettato
specialmente per calcolare in modo accurato le proprietà di molecole
piccole o medie usando tecniche ad alta correlazione. PSI4 è il successore
parallelizzato di PSI3 e include molti metodi teorici all'avanguardia.
Può calcolare energie, gradienti ed hessiane per i seguenti metodi:
- Hartree-Fock ristretto (RHF).
Può calcolare energie e gradienti per i seguenti metodi:
- Hartree-Fock open shell ristretto, non ristretto e generale ristretto
(RHF/ROHF);
- teoria del funzionale di densità open shell ristretto, non ristretto e
generale ristretto, incluso density-fitting (DF-DFT);
- teoria del funzionale cumulante di densità (DCFT);
- teoria perturbativa density-fitted di Møller-Plesset (DF-MP2);
- teoria DF-OMP2 (Density-fitted Orbital-Optimized MP2);
- teoria MP3 (orbital-optimized) (OMP3/MP3);
- coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni (CCSD);
- coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni density-fitted
(DF-CCSD) e con triple eccitazioni perturbative (DF-CCSD(T));
- coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni approssimate al
secondo ordine (CC2);
- equazione coupled-cluster del moto con singole e doppie eccitazioni
(EOM-CCSD).
Inoltre può calcolare le energie per i seguenti metodi:
- teoria MP2 scalata per componente di spin (SCS-MP2);
- teoria perturbativa del quarto ordine di Møller-Plesset (MP4);
- teoria perturbativa symmetry-adapted density-fitted (DF-SAPT);
- DF-CASSCF (Density-fitted complete active space SCF);
- CISD (Configuration-interaction singles doubles);
- FCI (Full configuration-interaction (FCI);
- coupled-cluster density-fitted closed-shell con singole e doppie
eccitazioni (DF-CCSD);
- coupled-cluster density-fitted closed-shell con singole e doppie
eccitazioni e triple eccitazioni perturbative (DF-CCSD(T));
- coupled-cluster con singole e doppie eccitazioni con approssimazione
del secondo e terzo ordine (CC2/CC3);
- teoria multireference coupled-cluster di Mukherjee con singole e doppie
eccitazioni (mk-MRCCSD);
- teoria multireference coupled-cluster di Mukherjee con singole e doppie
eccitazioni e triple eccitazioni perturbative (mk-MRCCSD(T));
- teoria della costruzione algebrica diagrammatica del secondo ordine
(ADC(2));
- interazione quadratica di configurazione con singole e doppie
eccitazioni (QCISD);
- interazione quadratica di configurazione con singole e doppie
eccitazioni e triple eccitazioni perturbative (QCISD(T));
- gruppo di rinormalizzazione della matrice di densità SCF (DMRG-SCF),
CASPT2 (DMRG-CASPT2) e CI (DRMG-CI).
Ulteriori funzionalità includono:
- formato di input flessibile, modulare e personalizzabile tramite Python;
- calcolo degli stati d'eccitamento con i metodi EOM-CC2/CC3, EOM-CCSD,
ADC(2), MRCI e mk-MRCC;
- utilizzo della simmetria molecolare punto-gruppo per aumentare
l'efficienza;
- ottimizzatore delle coordinate geometriche interne;
- calcoli delle frequenze armoniche (tramite differenze finite);
- scansioni delle superfici del potenziale;
- correzione del controbilanciamento;
- proprietà di un elettrone quali momento del dipolo/quadripolo, momento
del dipolo di transizione, occupazione degli orbitali naturali o
potenziale elettrostatico;
- metodi compositi come estrapolazione dell'insieme di base o G2/G3;
- correzioni scalari-relativistiche con approccio a due componenti (X2C).
Please cite:
Robert M. Parrish, Lori A. Burns, Daniel G. A. Smith, Andrew C. Simmonett, A. Eugene DePrince, Edward G. Hohenstein, Uğur Bozkaya, Alexander Yu. Sokolov, Roberto Di Remigio, Ryan M. Richard, Jérôme F. Gonthier, Andrew M. James, Harley R. McAlexander, Ashutosh Kumar, Masaaki Saitow, Xiao Wang, Benjamin P. Pritchard, Prakash Verma, Henry F. Schaefer, Konrad Patkowski, Rollin A. King, Edward F. Valeev, Francesco A. Evangelista, Justin M. Turney, T. Daniel Crawford and C. David Sherrill:
Psi4 1.1: An Open-Source Electronic Structure Program Emphasizing Automation, Advanced Libraries, and Interoperability.
(eprint)
J. Chem. Theory Comput.
13(7):3185-3197
(2017)
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