DebiChem Project
Summary
Chemical formula/structure editors
éditeurs de modèles ou structures chimiques de DebiChem

Ce métapaquet installe des logiciels de dessin, pouvant être utiles aux chimistes, pour des structures chimiques.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the DebiChem mailing list

Links to other tasks

DebiChem Chemical formula/structure editors packages

Official Debian packages with high relevance

Bkchem
éditeur de structures chimiques
Versions of package bkchem
ReleaseVersionArchitectures
sid0.13.0-6all
buster0.13.0-6all
squeeze0.13.0-2all
wheezy0.13.0-4all
jessie0.13.0-4all
stretch0.13.0-5all
Debtags of package bkchem:
fieldchemistry
roleprogram
Popcon: 17 users (4 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

BKchem est un logiciel libre de dessin de structures chimiques écrit en Python.

Quelques fonctionnalités disponibles :

 − dessin : lien par lien, patrons pour les anneaux courants, expansion
    de groupes, dessin des radicaux, charges, flèches, gestion des
    couleurs, etc. ;
 − édition : possibilité d'annuler les actions et vice versa sans limite,
    alignement, mise à l'échelle, rotation 2D et 3D, etc. ;
 − import/export : gestion complète des formats SVG et Open Office Draw,
    export en EPS, import/export basique en CML1 et CML2.
Screenshots of package bkchem
Chemtool
programme de dessin de structures chimiques
Versions of package chemtool
ReleaseVersionArchitectures
sid1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
squeeze1.6.12-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy1.6.13-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie1.6.14-1amd64,armel,armhf,i386
stretch1.6.14-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster1.6.14-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package chemtool:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitgtk
useediting, learning
works-withimage, image:vector
works-with-formatsvg
x11application
Popcon: 34 users (20 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Chemtool est un éditeur de structure chimique 2D en GTK+ pour X11. Il prend en charge plusieurs types de liaisons, la plupart des formats de texte nécessaires à l'écriture en chimie et les flèches en forme de cerce, d'arc ou courbées.

Les dessins peuvent être exportés dans les formats MOL et PDB, SVG ou XFig pour des annotations ultérieures, en tant que dessin PiCTex ou comme fichier bitmap ou Postscript (plusieurs de ces formats grâce au programme fig2dev, pendant de XFig).

Le paquet contient également un programme d'aide, cht, pour calculer des formules et des masses moléculaires exactes à partir d'un fichier de dessin chemtool. Cht peut être appelé directement depuis Chemtool ou bien depuis la ligne de commande.

Please cite: Matthias Brüstle: Chemtool - Moleküle zeichnen mit dem Pinguin. (eprint) Nachr. Chem. 49(11):1310-1313 (2001)
Screenshots of package chemtool
Easychem
trace des molécules et des formules chimiques 2D de haute qualité
Versions of package easychem
ReleaseVersionArchitectures
jessie0.6-8amd64,armel,armhf,i386
wheezy0.6-7amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
stretch0.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster0.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
squeeze0.6-6amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
bullseye0.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
sid0.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package easychem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitgtk
useediting, learning, viewing
x11application
Popcon: 28 users (14 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

EasyChem vous permet de créer des diagrammes de haute qualité de molécules et de formules chimiques 2D, qui peuvent être exportées en PDF, PS, LaTex et fig.

EasyChem a été développé pour créer des diagrammes pour des livres de chimie ; il est maintenant fréquemment utilisé dans des livres relatifs à la chimie, commerciaux ou non.

Screenshots of package easychem
Gchempaint
éditeur 2D de structures chimiques pour le bureau GNOME2
Versions of package gchempaint
ReleaseVersionArchitectures
buster0.14.17-1.1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
squeeze0.12.4-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.12.12-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie0.14.9-1amd64,armel,armhf,i386
stretch0.14.15-1+deb9u1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye0.14.17-5amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
sid0.14.17-5amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package gchempaint:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
suitegnome
uitoolkitgtk
useediting, learning
x11application
Popcon: 29 users (32 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

GChemPaint est un éditeur 2D de structures chimiques avec une interface multidocument. Vous pouvez retrouver les molécules tracées dans NIST Webbook et PubChem.

Other screenshots of package gchempaint
VersionURL
0.14.17-3+b1https://screenshots.debian.net/screenshots/000/019/283/large.png
Screenshots of package gchempaint
Xdrawchem
éditeur de structures chimiques et de réactions
Maintainer: Georges Khaznadar
Versions of package xdrawchem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.9.9-4.1amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
buster1.10.2.1-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye1.11.0-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
sid1.11.0-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
wheezy2.0-2amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie2.0-3amd64,armel,armhf,i386
stretch2.0-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package xdrawchem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitqt
useediting, learning, viewing
x11application
Popcon: 16 users (3 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Xdrawchem est un éditeur 2D de structures chimiques et de réactions. Il possède des fonctionnalités similaires à la suite propriétaire ChemDraw et possède une compatibilité de fichier avec ce logiciel, ainsi que d'autres formats grâce à OpenBabel.

Screenshots of package xdrawchem

Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS

Osra
optical structure recognition application
Versions of package osra
ReleaseVersionArchitectures
VCS2.0.1-1all
Versions and Archs
License: GPL-2+
Debian package not available
Git
Version: 2.0.1-1

OSRA (Optical Structure Recognition Application) is a utility designed to convert graphical representations of chemical structures, as they appear in journal articles, patent documents, textbooks, trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification) or SD files - computer recognizable molecular structure formats. OSRA can read a document in any of the over 90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG, PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES or SDF representation of the molecular structure images encountered within that document.

Remark of DebiChem team: Packaging was discussed at

http://lists.alioth.debian.org/pipermail/debichem-devel/2009-November/002236.html

*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 200793