Debian Science Meteorology packages

CDFTools er en diagnostisk pakke skrevet i fortran 90 for analyse af uddata fra NEMO-modellen i ramme af DRAKKAR-projektet. NEMO (Nucleus for European Modelling of the Ocean) er en meget moderne modelleringsramme for oceanografisk forskning, operationel oceanografi, sæsonforudsigelser og klimastudier.

Climate Data Operators er en samling af kommandolinjeoperatører til at manipulere og analysere data for klimamodeller. Understøttede dataformater er GRIB, netCDF, SERVICE, EXTRA og IEG. Der er mere end 400 operatører tilgængelige.

Denne pakke indeholder tabeller for brug med CMOR, som beskriver variablerne og formatet for krævede data.

CMOR-programmer bruger disse tabeller til at verificere at resultatet er gyldigt.

Rammen Common Data Access gør det muligt at læse videnskabelige data til at manipulere og analysere klimamodeldata. Understøttede dataformater er GRIB, netCDF, SERVICE, EXTRA og IEG. Der er mere end 400 operatører tilgængelige.

Cylc (»silk«) er en programpakkemotor og metaplanlægger, som specialiserer sig i programpakker med cykliske opgaver til vejrudsigter, klimamodeller og relateret arbejde (kan også bruges til enkelte arbejdsforløb for ikkecykliske opgaver, som er et mere simpelt problem).

DB-All.e er en hurtig, på disken, database hvor meteorologiske observerede og forudsagte data kan lagres, søges, hentes og opdateres.

Denne ramme giver mulighed for at håndtere store mængder af data med dens simple programgrænseflade, og rammen tilbyder værktøjer til at visualisere, importere og eksportere i standardformaterne BUFR, AOF og CREX.

Hovedkarakteristika for DB-ALL.e er:

• API'er for Fortran, C, C++ og Python er indeholdt
• For at gøre beregning nemmere gemmes data i fysiske kvantiteter, det vil sige som en måling af variabler i et specifikt punkt af sted og tid, frem for som en rapportsekvens.
• Intern repræsentation ligner BUFR- og CREX WMO-standarden (tabelkodedrevet) og et redskab for import og eksport er inkluderet generisk og ECMWF-skabelon).
• Repræsentation er i 7 dimensioner: koordinater for breddegrad og længdegrad, tabeldreven lodret koordinat, referencetid, tabeldreven observations- og vejrudsigtsspecifikation, tabeldreven datatype.
• Den giver mulighed for at lagre ekstra information lænket til dataene, såsom tillidsintervaller for kvalitetskontrol.
• Den giver mulighed for at lagre ekstra information lænket til stationerne.
• Variabler kan repræsenteres som virkelige, heltal og tegn, med passende præcision for typen for den målte værdi.
• Den er baseret på fysiske principper, det vil sige, dataene den indeholder er definerede i form af homogene og konsistente fysiske data. For eksempel er det umuligt for to ej kompatible værdier at findes i det samme rum og tid.
• Den kan håndtere faste stationer og flytte stationer såsom fly eller skibe.
• Den kan håndtere både observerede og forudsagte data.
• Den kan håndtere data sammen med alle tre dimensioner i rummet, såsom data fra sonderinger og fly.
• Rapportinformation bevares. Den kan fungere baseret på fysiske parametre eller på rapporttyper.

Ferret er et miljø til computervisualisering og analyse, som er designet til at møde behovene for havforskere og meteorologer, der analyserer store og komplekse gitterdatasæt. Miljøet kan gennemsigtig tilgå omfattende eksterne internetdatabaser, der bruger OPeNDAP (tidligere kendt som DODS).

Ferret har en Mathematica-lignende fleksibilitet, geofysisk formatering, »intelligent« forbindelse til sin database, hukommelseshåndtering for meget store beregninger og symmetrisk behandling i fire dimensioner. Den kan fungere på både gitteropdelte og ikke-gitteropdelte datasæt.

FLEXPART-modellen er en Lagrangian Particle Dispersion Model udviklet på det norske institut for luftfartforskning i afdelingen for atmosfære- og klimaforskning. Modellens udviklingshold består af Andreas Stohl (som oprindelig skrev FLEXPART), Sabine Eckhardt, Harald Sodemann og John Burkhart.

Banemodeller er vigtige redskaber til at studere transportfænomener i atmosfæren. I miljøvidenskaberne, er de ofte brugt til at etablere kilde og modtager-relationer for luftforurenende stoffer.

FLEXTRA kan anvendes til at beregne forskellige typer af frem eller tilbage-baner, og har faciliteter til at estimere usikkerheden for baner. Det er specielt designet til at beregne langtidssekvenser af baner for mange receptorsteder.

FLEXTRA kan anvendes med Metviews meteorologiske arbejdsstation til at visualisere baner.

Fpzip er et bibliotek og kommandolinjeredskab til kompression med og uden kvalitetstab for 2D- og 3D-kommatals tabeller. Fpzip antager rumligt korrelerede scalar-værdisatte data, såsom regulære samplede sammenhængende funktioner, og er ikke egnet for kompression af ustrukturerede strømme af kommatal. Denne pakke tilbyder redskaberne for kommandolinjen.

The Grid Analysis and Display System (GrADS) er et interaktivt skrivebordsværktøj, som bruges for nem adgang, manipulation og visualisering af videnskabelige data om jorden. Dataformatet kan være enten binært, GRIB, NetCDF eller HDF-SDS (videnskabeligt datasæt). GrADS er blevet implementeret over hele verden i en række af almindeligt udbredte operativsystemer og kan frit distribueres over internettet.

GrADS bruger et 4-dimensionelt datamiljø: længdegrad, breddegrad, lodret niveau og tid. Datasæt placeres indenfor 4D-rummet med hjælp fra en databeskrivelsesfil. GrADS fortolker stationsdata samt data i gitter, og gitrene kan være regulære, ikkelineært adskilt, gaussisk eller med variabel opløsning. Data fra forskellige datasæt kan lægges grafisk over hinanden, med korrekt opdeling og tidsregistrering. Handlinger udføres interaktivt ved at indtaste FORTRAN-lignende udtryk på kommandolinjen. Et omfattende sæt af indbyggede funktioner tilbydes, men brugere kan også tilføje deres egne funktioner som eksterne rutiner skrevet i ethvert programmeringssprog.

Data kan vises med brug af en række grafiske teknikker: Linje- og bjælkegrafer, plotningsgrafer, udjævnede konturer, skyggelagte konturer, strømlinjer, vindvektorer, gitterbokse, skyggelagte gitterbokse og modelplotninger for station. Grafik kan være i PostScript eller billedformater. GrADS tilbyder intuitive geofysiske standarder, men brugeren kan muligheden for at kontrollere alle aspekter af den grafiske visning.

GrADS har en brugerflade, der kan programmeres (skriptsprog), som tillader sofistikerede analyse- og visningsprogrammer. Brug skripter til at vise knapper og rullemenuer samt grafik og udfør så opgaver baseret på brugerens peg-og-klik. GrADS kan køres i køtilstand og skriptsprogets understøtter brug af GrADS til lange køjob, der kører hele natten.

HARP er et værktøjssæt for indsættelse, bearbejdning og sammenligning af satellit- eller modeldata mod korrelative data. Værktøjssættet består af et sæt af kommandolinjeværktøjer, et C-bibliotek med analysefunktioner og import/eksport-grænseflader for Python. Hovedformålet med HARP er at assistere i indbyrdes sammenligning af datasæt. Ved passende at kæde kald til HARP-kommandolinjeværktøjer så kan man forbehandle satellit, model og/eller korrelative data så at to datasæt, der skal sammenlignes ender op med at have det samme tidsmæssigt/rumlig gitter, samme dataformat og struktur og samme fysiske enheder.

Denne pakke tilbyder HARPs binære redskaber.

Libaec tilbyder hurtig komprimering uden kvalitetstab for 1- op til 32-bit bredt underskrevne eller ej underskrevne heltal (prøver).

Denne pakke tilbyder komprimeringsredskabet aec.

Atlas is an ECMWF library for parallel data-structures supporting unstructured grids and function spaces, with the aim to investigate alternative more scalable dynamical core options for Earth System models, and to support modern interpolation and product generation software.

Atlas is predominantly C++ code, with main features available to Fortran codes through a F2003 interface. ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

OPeNDAP tilbyder programmer, der gør, at du kan tilgå data over internettet, fra programmer som ikke oprindeligt blev designet til det formål, samt nogle som var. Mens OPeNDAP er den oprindelige udviklet af Data Access-protokollen, som programmet anvender, så har mange andre grupper adopteret DAP og tilbyder kompatible klienter, servere og programudviklingssæt.

Denne pakke indeholder den binære klientfil »getdap«.

OPeNDAP tilbyder programmer, der gør, at du kan tilgå data over internettet, fra programmer som ikke oprindeligt blev designet til det formål, samt nogle som var. Mens OPeNDAP er den oprindelige udviklet af Data Access-protokollen, som programmet anvender, så har mange andre grupper adopteret DAP og tilbyder kompatible klienter, servere og programudviklingssæt.

EcCodes er ECMWF-kodnings/afkodningsprogrammet for GRIB og BUFR.

Dette er et nyttigt sæt af kommandolinjeværktøjer til hurtig adgang for grib-beskeder.

ECMWF er European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (det europæiske center for vejrudsigter på mellemlangt sigt).

EcKit er et C++-værktøjssæt for flere platforme, der understøtter udvikling af værktøjer og programmer på ECMWF. Det er baseret på kode udviklet over de seneste 20 år indenfor MARS-programmerne og blev omdannet til genbrug for andre programmer. Hovedfokus er UNIX/POSIX-systemer og det er blevet omhyggeligt testet på AIX, Linux og Mac OSX. Historisk er kodegrundlaget før og på nogle måder en pænere erstatning for nogle »Boost«-biblioteker.

ECMWF er European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (det europæiske center for vejrudsigter på mellemlangt sigt).

The Interpolation library (EMOSLIB) includes Interpolation software and GRIB, BUFR, CREX encoding/decoding routines. It is used by the ECMWF meteorological archival and retrieval system (MARS) and also by the ECMWF graphics package MetView.

This package provide bufr-* and other tools

Dette er et værktøjssæt fra ECMWF, der gør, at ecKit kan operere med Fortran.

ECMWF er European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (det europæiske center for vejrudsigter på mellemlangt sigt).

Metkit er et værktøjssæt for ECMWF til at manipulere og beskrive meteorologiske objekter, der implementerer sproget MARS og associeret behandling og semantik.

Denne pakke indeholder værktøjet »parse-mars-reqeust«.

Magics++ er den seneste generation af ECMWF's meteorologiske plotprogram MAGICS. Selvom fuldstændig nydesignet i C++, er det meningen, at det skal være så bagudkompatibelt som muligt med Fortrangrænsefladen. Udover dets programmeringsgrænseflader (Fortran og C), tilbyder Magics++ MagML, et plotbeskrivelsessprog baseret på XML rettet mod automatisk netproduktion.

Denne pakke indholder MagcML-binære filer, som kan bruges med magics++.

MBDyn er det første frie og almene Multibody Dynamics-analyseprogram.

MBDyn har integreret multidisciplinary-simulering af multibody, multiphysics-systemer, inklusive ikkelineær mekanik for rigide og fleksible elementer (geometrisk præcis og komposit-klar bjælke og skalfinitte elementer, synteseelementer i komponenttilstand, klumpede elementer) underlagt kinematiske begrænsninger, sammen med smarte materialer, elektriske netværk, aktiv kontrol, hydrauliske netværk og essentiel fast-vinge og rotorkraft aerodynamik.

MBDyn simulerer opførelsen for heterogen mekaniske, aeroservoelastiske systemer baseret på første princips ligninger.

MBDyn kan nemt tilsluttes til eksterne løsere for samtidig simulering af problemer indenfor flerfysik, f.eks. beregningsmæssige væskedynamikker, terradynamikker, blokdiagramløsere såsom Scicos, Scicoslab og Simulink, via C, C++ eller Python peer-side API.

MBDyn er under aktiv udvikling og bruges indenfor felterne luftfart (fly, helikoptere, tiltrotorer, rumraketter), vindenergi (vindturbiner), biler (biler, lastbiler) og mekatronik (industrirobotter, parallelle robotter, små flyvende fartøjer) for analyse og simulering af dynamikkerne for komplekse systemer.

Metview er blevet designet som et fleksibelt, modulopbygget og udvideligt system, som kan omfavne behovene hos brugeren, mens de udvikler sig. Systemet er baseret på ECMWF-standarderne for grafik (Magics) og dataadgang (MARS), men kan også tilgå lokalt lagrede data. Brugergrænsefladen er baseret på Motif og Qt. Metview er et fuldt distribueret system, hvor moduler kan køre på forskellige arbejdsstationer og servere.

Metview er et samarbejdende projekt mellem ECMWF og INPE/CPTEC, Brasilien. ECMWF er også blevet assisteret af en ansat hos Météo-France.

NCAR Command Language (NCL) er et frit fortolket sprog designet specifikt for videnskabelig databehandling og visualisering. NCL har robust fil-inddata og -uddata. Kan læse og skrive netCDF-3, netCDF-4 klassik HDF4, HDF5, binær, og ASCII-data, og læst HDF-EOS2, GRIB1 og GRIB2. Grafikken er verdensklasse og kan tilpasses.

Programmet har en række nyttige kommandolinjeværktøjer:

• ncl_filedump - udskriver indholdet af understøttede filer netCDF, HDF, GRIB1, GRIB2, HDF-EOS2 og CCM History Tape)
• ncl_convert2nc - konverterer en eller flere GRIB1, GRIB2, HDF og/eller HDF-EOS-filer til netCDF-formaterede filer

NCO er et programpakke kendt som operatører. Operatørerne er uafhængige, kommandolinjeprogrammer der kan køres i en POSIX-skal. Operatører tager en eller flere netCDF-filer som inddata, udføre handlinger (f.eks. gennemsnit, hyperslabbing), og laver en netCDF-uddatafil. NCO blev oprindelig udviklet til at manipulere og analysere klimadata. Programmet virker dog på alle datasæt i netCDF-formatet.

Du kan bruge ncview til at få et hurtigt og nemt, trykknapsudseende af dine NetCDF-filer. Du kan vise simple film over dataene, se langs med forskellige dimensioner, tage et kig på de aktuelle dataværdier, ændre farvekort, vende dataene om og andre simple visuelle handlinger.

ODC er et program udviklet på ECMWF for kodning og behandling af observationsdata. Det indeholder en SQL-filtrerings- og statistisk motor, kommandolinjeværktøjer og API'er for C/C++ og Fortran.

Denne pakke tilbyder værktøjer til ODB-håndtering.

Climate Data Operators er en samling af kommandolinjeoperatører til at manipulere og analysere data for klimamodeller. Understøttede dataformater er GRIB, netCDF, SERVICE, EXTRA og IEG. Der er mere end 400 operatører tilgængelige. Denne pakke tilbyder et Python3-omslag for CDO.

This module provides a Python3 interface to map GRIB files to the NetCDF Common Data Model following the CF Conventions. The high level API is designed to support a GRIB backend for xarray and it is inspired by NetCDF-python and h5netcdf. Low level access and decoding is performed via the ECMWF ecCodes library.

Dette er en Python3-grænseflade til CMOR, Climate Model Output Rewriter.

CMIP5 er Climate Model Intercomparison Project5. Dette bibliotek understøtter oprettelsen af stier og filnavne svarende til version 0.28 for CMIP Data Reference Syntax. Biblioteket indeholder værktøjer til at konvertere fra tidligere CMIP3-former.

EcCodes er ECMWF-kodnings/afkodningsprogrammet for GRIB og BUFR. Dette er et Pythonomslag for eCCodes-biblioteket.

ECMWF er European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (det europæiske center for vejrudsigter på mellemlangt sigt).

Ferret is an interactive computer visualization and analysis environment designed to meet the needs of oceanographers and meteorologists analyzing large and complex gridded data sets. It can transparently access extensive remote Internet data bases using OPeNDAP (formerly known as DODS)

This is the Python3 wrapper for Ferret

Python 3 module for reading and writing GRIB (editions 1 and 2) files. GRIB is the World Meterological Organization standard for distributing gridded data. The module is a Python 3 interface to the GRIB API C library from the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (ECMWF).

This package also contains the cnvgrib1to2, grib_list, grib_repack, and cnvgrib2to1 scripts.

This package implements the TEOS-10 Equation of State for seawater. TEOS-10 is based on a Gibbs function formulation from which all thermodynamic properties of seawater (density, enthalpy, entropy sound speed, etc.) can be derived in a thermodynamically consistent manner. TEOS-10 was adopted by the Intergovernmental Oceanographic Commission at its 25th Assembly in June 2009 to replace EOS-80 as the official description of seawater and ice properties in marine science.

For further information, see http://www.teos-10.org/

Dette er en Python3-klasse til at modellere en tilstand for flydende vand eller damp med Industrial Formulation IAPWS-IF97.

Yderligere information om standarden er tilgængelig på http://www.iapws.org.

Magics++ er den seneste generation af ECMWF's meteorologiske plotprogram MAGICS. Selvom programmet er designet helt om i C++, er det stadig tænkt som værende baglæns kompatibelt med Fortrangrænsefladen.

Denne pakke tilbyder Python 3-understøttelse for biblioteket magics++.

Metaconfig er et bibliotek for centralisering af Pythons ConfigParser-filer. Det er inspireret af logningsmodulet, hvor det er utroligt nemt at starte på at skrive kode, der afhænger af logning, mens det udsætter hvordan logbeskeder vil blive håndteret indtil senere.

NetCDF version 4 har mange funktioner, som ikke blev fundet i tidligere versioner af biblioteket og som er implementeret oven på HDF5. Dette modul kan læse og skrive filer i både det nye netCDF 4 og det ældre netCDF3-format, og det kan oprette filer, som kan læses af HDF5-klienter. API'en er modelleret efter Scientific.IO.NetCDF, og bør være kendt af brugere af det modul.

De fleste nye funktioner for netCDF 4 er implementeret, såsom flere ubegrænsede dimensioner, grupper og zlib-datakomprimering. Alle de nye numeriske datatyper (såsom 64-bit og ej underskrevne heltalstyper) er implementeret. Sammensatte og variabellængdedatatyper (vlen) er understøttet, men enum- og uigennemsigtige datatyper er ikke. Blandinger af sammensætninger og vlen-datatyper (sammensatte typer indeholdende VLAN, og VLAN indeholdende sammensatte typer) understøttes ikke.

Denne pakke indeholder netCDF 4-mdoulet for Python 3.

Dette er en Python3-grænseflade til spherepack, et bibliotek for geofysiske processer.

Dette program, skrevet med Qt-værktøjssættet, aktiverer:

• Visualisering af meteodata fra filer i GRIB-format 1
• Automatisk hentning af GRIB-data
• Automatisk hentning fra IAC (fleetcode) Data

Gerris er et program til at løse partielle differentialligninger for væskestrømme.

Et kort referat af dets nuværende hovedfunktioner:

• Løser de tidsafhængige inkompressible Euler-, Stokes-

  eller Navier-Stokes-ligninger for variabel tæthed. * Adaptiv netfinhed: opløsningen tilpasses dynamisk

  strømmens egenskaber * Fuldautomatisk netgenerering for komplekse geometrier * Anden orden i rum og tid * Ubegrænset antal af passive advektions-/diffusionstracere * Fleksibel specifikation af yderligere kildetermer * Flytbar understøttelse af parallelitet med brug af MPI-biblioteket * Fluidvolumen-advektionsmetode (VOF) til grænsefladestrømme

Denne pakke har indbygget MPI-understøttelse.

GNU Data Language (DGL) er en fri IDL-kompatibel (Interactive Data Language) trinvis kompiler. Den har fuld syntakskompatibilitet med IDL 7.1. IDL er et registreret varemærke for ITT Visual Information Solutions. Fra IDL 8.0 er de følgende sprogelementer understøttet:

• FOREACH-loop
• negative tabelindekser
• affaldssamlingspegere og objekter
• kald-metoder på et objekt via ».« (f.eks. »object.aMemberProcedure,arg1«)

Filinddatasystemet er fuldt implementeret. GUI-understøttelse (kontroller) er officielt tilbudt, men ikke helt færdig endnu.

Denne pakke indeholder hovedbrugerfladen for kommandolinjen og fortolkeren.

Denne pakke tilbyder funktioner der virker med NetCDF-datafiler i Octave, et numerisk beregningsprogram. Denne pakke tilbyder en funktion (netcdf) som opretter og læser NetCDF-filer og skriver til en NetCDF-fil (ncdump) blandt andet.

Denne Octave-udvidelsespakke er en del af projektet Octave-Forge.

ParaView er et program til flere platforme, udviklet i åben kildekode og designet til at visualisere datasæt med en størrelse der varierer fra lille til meget stor.

• Udvikl et visualiseringsprogram i åben kildekode og til flere platforme
• Understøt distribuerede beregningsmodeller til behandling af store datasæt.
• Opret en åben, fleksibel og intuitiv brugergrænseflade.
• Udvikl en arkitektur, der kan udvides, baseret på åbne standarder.

ParaView kører på distribueret og delt hukommelse parallelt samt på systemer kun med en processor. Er blevet testet med succes på Windows, Mac OS X, Linux og diverse Unix-arbejdsstationer, klynger og supercomputere. Under motorhjelmen bruger ParaView visualiseringsværktøjssættet da databehandlings- og optegningsmotoren har en brugergrænseflade skrevet med Qt.

OpenTURNS er et funktionsrigt og generisk værktøj til at behandle og kvantificere usikkerheder i numeriske simuleringer i design, optimering og kontrol. Den tillader både undersøgelser for sensitivitet og pålidelighed:

• definering af resultaterne for rente- og beslutningskriterier
• kvantificere og modellere kilden for usikkerheder
• udbrede usikkerhed og/eller analysere følsomhed og
• ranger kilderne for usikkerhed

Målrettede brugere er ingeniører, der ønsker at introducere den probabilistiske dimension i deres indtil nu deterministiske studier.

 .
Denne pakke tilbyder Python 3-bindingerne til biblioteket.

R er et system til statistisk beregning og grafik. Det består af et sprog plus et afviklingsmiljø med grafik, et aflusningsredskab, adgang til særlige systemfunktioner, samt evnen til at køre programmer som er gemt som skriptfiler.

Designet af R er tungt påvirket af to eksisterende sprog: Becker, Chambers & Wilks' S og Sussman's Scheme. Hvor sprogudformningen i sin fremtræden i høj grad ligner S, så er den underliggende implementering og semantik afledt fra Scheme.

Kernen i R er et fortolket programmeringssprog som tillader forgrening og løkker, så vel som modulær programmering med brug af funktioner. De fleste funktioner som er synlige for brugeren i R er skrevet i R. Det er muligt for brugeren at tilgå procedurer skrevet i C, C++ eller FORTRAN sprogene for effektivitet, og mange af R's kernefunktioner gør dette. Distributionen R indeholder funktionalitet til et stort antal statistiske procedurer og underliggende anvendte matematiske beregninger. Der er også et stort sæt af funktioner, der tilbyder et grafisk miljø til oprettelse af adskillige slags datarepræsentationer.

Derudover er flere tusinde udvidelsespakker tilgængelige fra CRAN (Comprehensive R Archive Network), mange også som Debianpakker, der er navngivet »r-cran-«.

Disse pakker er en metapakke, som letter overgangen fra pre-1.5.0-pakkestrukturen med dennes store r-base-pakke. Så snart den er installeret, kan den uden videre fjernes og apt-get vil automatisk opgradere dens komponenter under fremtidige opgraderinger. Denne pakke gør det muligt for brugerne kun at installere r-base-core, hvis de ønsker det.

Network opensource is a standards based, Free and Open Source catalog application to manage spatially referenced resources through the web. It provides powerful metadata editing and search functions as well as an embedded interactive web map viewer. This website contains information related to the use of the software.