PAN Blend mx-dev packages

La suite di software CCP4 è basata su una libreria di procedure che coprono compiti comuni, come apertura di file, analisi di parole chiave nell'input, lettura e scrittura di formati di dati standard, applicazione di operazioni di simmetria, ecc. I programmi nella suite chiamano tali procedure che, oltre ad evitare un po' di sforzo al programmatore, assicurano che i vari programmi nella suite abbiano lo stesso aspetto e stile.

La libreria contiene diversi sottocomponenti:

• libreria CMTZ -- contiene svariate funzioni per manipolare la struttura di dati, per esempio aggiungere cristalli, insiemi di dati o colonne; si può fare il dump della struttura di dati in un file di output MTZ.

• libreria CMAP -- funzioni che definiscono l'API a livello del C per accedere a file mappa CCP4;

• libreria CSYM -- una raccolta di funzioni centrate intorno a un file syminfo.lib che è generato automaticamente da sgtbx (lo Space Group Toolbox di cctbx);

• libreria di utilità CCP4 -- molte funzioni di utilità che danno funzionalità specifiche di CCP4 o indipendenti dalla piattaforma;

• libreria CCP4 Parser -- fornisce un'analisi in stile CCP4, come usata per elaborare parole chiave dei programmi di CCP4, intestazioni di record MTZ, ecc.;

• array ridimensionabili di CCP4 -- definisce un oggetto e dei metodi che sembrano un semplice array del C, ma possono essere ridimensionati a piacimento senza incorrere in carichi eccessivi.

Lo scopo del progetto clipper è quello di produrre un insieme di librerie orientate agli oggetti per l'organizzazione di dati cristallografici e le prestazioni di calcoli cristallografici.

Questo pacchetto contiene l'ambiente di sviluppo per programmi che useranno le librerie clipper.

MMDB is designed to assist developers in working with macromolecular coordinate files. The library handles both PDB and mmCIF format files.

The Library also features an internal binary format, portable between different platforms. This is achieved at uniformity of the Library's interface functions, so there is no difference in handling different formats.

MMDB provides various high-level tools for working with coordinate files, including reading and writing, orthogonal-fractional transforms, generation of symmetry mates, editing the molecular structure and more.

This package contains library and header files needed for program development.

SSM is a macromolecular coordinate superposition library, written by Eugene Krissinel of the EBI.

The library implements the SSM algorithm of protein structure comparison in three dimensions, which includes an original procedure of matching graphs built on the protein's secondary-structure elements, followed by an iterative three-dimensional alignment of protein backbone Calpha atoms.

This package contains libraries and header files needed for program development.