PAN Blend xas packages

PyMca è un insieme di applicazioni e librerie Python per l'analisi di spettri di fluorescenza a raggi X.

Le applicazioni incluse in questo pacchetto sono:

• edfviewer - visualizzazione e ispezione di file di dati in ESRF Data Format;
• elementsinfo - visualizza dati di raggi X specifici di un elemento;
• mca2edf - converte un file dal formato SPEC MCA a EDF;
• peakidentifier - visualizza picchi di fluorescenza a raggi X in un dato intervallo di energia;
• pymcabatch - fitting non interattivo di spettri;
• pymcapostbatch - post-elaborazione dei risultati del fitting non interattivo;
• pymca - analisi interattiva dei dati;
• pymcaroitool - strumento per immagini Region-of-interest (ROI).

Il toolkit PyMca può leggere file di dati nei formati SPEC, ESRF data file (EDF), OMNIC, HDF5, AIFIRA e SupaVisio.

Questi sono gli script del pacchetto.

Quantum ESPRESSO (prima chiamato PWscf) è una suite integrata di sorgenti per calcoli di strutture elettroniche e modellazione di materiali alla nanoscala. È basato sulla teoria del funzionale densità, sulle onde piane e sui pseudopotenziali (sia a norma conservata, sia ultrasoft, sia PAW).

Tra le funzionalità vi sono:

• calcoli dello stato fondamentale e della struttura delle bande tramite sollecitazioni, forze ed energie totali autocoerenti di onde piane;
• pseudopotenziali a norma conservata e ultrasoft (Vanderbilt) separabili, PAW (Projector Augmented Waves);
• vari funzionali di scambio e correlazione, dalla LDA alle approssimazioni di gradiente generalizzato (PW91, PBE, B88-P86, BLYP) fino a funzionali meta-GGA, di scambio esatto (HF) e ibridi (PBE0, B3LYP, HSE);
• dinamica molecolare Car-Parrinello e Born-Oppenheimer;
• ottimizzazione strutturale che include stati di transizione e percorsi ad energia minima;
• magnetismo non collineare e accoppiamento spin-orbita;
• proprietà di risposta che includono frequenze di fononi e autovettori, cariche efficaci e tensori dielettrici, sezioni d'urto Raman ed infrarossi, spostamenti chimici EPR e NMR;
• proprietà spettroscopiche come l'eccitazione elettronica e le righe K ed L1 nello spettro di assorbimento ai raggi X (XAS, X-ray Absorption Spectra).

Larch is an open-source library and analysis toolkit for processing scientific data. Initially designed for x-ray spectroscopic and scattering data collected at modern synchrotrons and x-ray sources, Larch also provides many general-purpose processing and analysis tools for dealing with arrays of scientific data and organize complex data sets.

Larch is written in Python, making heavy use of the wonderful numpy, scipy, h5py, and matplotlib libraries, and can be used directly as a Python library or extended using Python. In addition, Larch provides a Python-like language (a macro language, or domain specific language) that is intended to be very easy to use for novices while also being complete enough for advanced data processing and analysis.

Larch has several related target application areas, including:

• XAFS analysis, becoming version 2 of the Ifeffit Package.
• Visualizing and analyzing micro-X-ray fluorescence maps.
• Quantitative X-ray fluorescence analysis.
• X-ray standing waves and surface scattering analysis.
• Data collection software for synchrotron data.

The essential idea is that having these different areas connected by a common macro language will strengthen the analysis tools available for all of them, and provide a very shallow barrier for those interested in scripting the manipulation and analysis of their data.

Currently, Larch provides a complete set of XAFS Analysis tools (replacing all of the Ifeffit package), has some support for visualizing and analyzing XRF maps and spectra, and has many extra tools for X-ray spectral analysis, data handling, and general-purpose data modeling.