PAN Blend Project
Summary
microscopy
microscopy IR

This metapackage will install all microscopy softwares.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for PAN Blend to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the PAN Blend mailing list

Links to other tasks

PAN Blend microscopy packages

Official Debian packages with high relevance

gwyddion
Værktøj til visualisering og analyse via Skanning Probe Mikroskopi
Versions of package gwyddion
ReleaseVersionArchitectures
sid2.64-1.1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
bullseye2.57-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm2.62-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie2.64-1.1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
jessie2.38-2amd64,armel,armhf,i386
stretch2.47-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster2.52-1amd64,arm64,armhf,i386
upstream2.65
Debtags of package gwyddion:
fieldphysics
interfacex11
roleprogram
sciencevisualisation
scopeapplication
uitoolkitgtk
useanalysing, viewing
works-withimage, image:raster
x11application
Popcon: 28 users (12 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

Gwyddion er et modulopbygget program for skanning (Skanning Probe Mikroskopi, SPM), samt visualisering og analyse af data. Det er primært beregnet til analyse af højdefeltdata indhentet via mikroskopiteknikker som

  • Atomar Force Mikroskopi (AFM),
  • Magnetisk Force Mikroskopi (MFM),
  • Skanning Tunneling Mikroskopi (STM),
  • Nær-felt Skanning Optisk Mikroskopi (SNOM eller NSOM) og andet. Det kan dog bruges til vilkårlige højdefelter og til billedanalyse.

Denne pakke indeholder det primære program og dets moduler. Den indeholder også en GNOME (og Xfce) miniaturefremstiller som opretter forhåndsvisninger af alle kendte filtyper til Gwyddion.

Please cite: David Nečas and Petr Klapetek: Gwyddion: an open-source software for SPM data analysis. (eprint) Central European Journal of Physics 10(1):181-188 (2012)
Registry entries: SciCrunch 
Screenshots of package gwyddion

Official Debian packages with lower relevance

threeb
3B Microscopy Analysis Software - kommandolinjeværktøj
Versions of package threeb
ReleaseVersionArchitectures
trixie0.0~git20220106110332.a3144e0-6amd64,i386,s390x
sid0.0~git20220106110332.a3144e0-6amd64,i386,riscv64,s390x
bookworm0.0~git20220106110332.a3144e0-5amd64,i386,mipsel,s390x
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Bayesiansk analyse af blinking og bleaching, eller 3B-mikroskopi, er en metode, som analyserer data, hvor mange overlappende fluoroforer der gennemgår bleaching- og blinking-hændelser, hvilket giver strukturen en forbedret opløsning. Ved at bruge en Hidden Markov Model (HMM) tillader det nyttig information, der kan hentes fra data, som ville være umulige at analysere med standardteknikker for lokaliseringsanalyse.

Denne pakke indeholder værktøjet for kommandolinjen.

*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 237471