Debian Med Psychology packages

Denne pakke installerer et udvidelsesmodul for Orthanc, det simple, RESTful Vendor Neutral Archive for medicinske billeder. Dette udvidelsesmodul tilføjer understøtter for neurobilleder i Orthanc, specielt for nemt at konvertere fra DICOM til NIfTI.

Ifølge programmets forfattere så udfører praat »fonetik via computeren«. Via sin grafiske grænseflade, flere funktioner for taleanalyse er tilgængelige: spektogrammer, cochleogrammer, og tonehøjde og formant- udtræk. Artikulær syntese samt syntese fra tonehøjde, formant og intensitet er også tilgængelig. Andre egenskaber indgår segmentering, brug af etiketter med brug af det fonetiske alfabet, samt beregning af statistikker. Praat er konfigurerbar og udvidelig gennem dets eget skriptsprog og har bestemmelser for kommunikation med andre programmer.

Psignifit tillader tilpasning af psykometriske funktioner til datasæt, mens der bevares fuld kontrol over et stort antal parametre. Data kan enten læses fra tekstfiler eller videresendes via en datakanal.

Psignifit udfører beregningen af konfidensintervaller samt goodness-of-fit test.

Dette er udgaven til kommandolinjen.

Bemærk: Dette er den forældede version 2.x af psignifit.

PsychoPy tilbyder et miljø for oprettelse af psykologiske stimuli, der bruger skriptsproget Python. Det kombinerer de grafiske fordele i OpenGL med nem Pythonsyntaks for at give psykofysik en fri og simpel stimulipræsentation og kontrolpakke.

Formålet er at tilbyde, for travle forskere, værktøjer til at kontrollere timing og vinduesopsætning og et simpelt sæt af på forhånd pakkede stimuli og metoder. PsychoPy indeholder.

• IDE GUI for kodning i et funktionsrigt skriptsprog (Python)
• Builder GUI for hurtig udvikling af stimuleringssekvenser
• Brug af udstyrsaccelereret grafik (OpenGL)
• Integration med Spectrascan PR650 for nem skærmkalibrering
• Simple rutiner for staircase og konstant stimulieksperimentelle metoder samt kurvetilpasning og bootstrapping
• Simple (eller komplekse) grafiske brugerflader via wxPython
• Nemme grænseflader til joystick, mus, lydkort etc. via PyGame
• Videoafspilning (MPG, DivX, AVI, QuickTime etc.) som stimuli

BioXTAS RAW er et Pythonprogram, baseret på en grafisk brugerflade, til reduktion og analyse af lille-vinkel røntgenplotdata (SAXS). Pakken er designet for biologiske SAXS-data.

BioXTAS RAW tilbyder et alternativ til lukkede kildeprogrammer såsom Primus og Scatter for primær dataanalyse. Da programmet kan kalibrere, maskere og integrere billeder, så er det også et alternativ til synchroton beamline-datakanaler, som videnskabsfolk kan installere på deres egen computer og bruge både hjemme og ved beamline.

Denne pakke tilbyder funktioner for læsning og skrivning af data lagret af statistiske pakker såsom Minitab, S, SAS, SPSS, Stata ...

Denne pakke er del af et sæt af pakker, som »anbefales« af R Core, og leveres med kildeudgivelser via opstrøm af R.

Denne pakke inkluderer flere procedurer brugt i psykometri og skalering, inklusive:

• Cohens Kappa og vægtet Kappa (two-rater agreement tests)
• Cronbachs Alfa (en element-troværdighed test)
• Focused Principal Components Analysis
• Intraclass correlation coefficients
• Lights Kappa (en N-rater aftaletest)
• Screeplots og grafiske repræsentationer af principielle komponenter

Denne GNU R-pakke tilbyder en generel værktøjskasse til personlighed, psykometrisk teori og eksperimentel psykologi. Funktioner er primært til multivariat analyse og skalakonstruktion ved hjælp af faktoranalyse, hovedkomponentanalyse, klyngeanalyse og pålidelighedsanalyse, selvom andre tilbyder grundlæggende beskrivende statistikker. Item Response Theory udføres ved hjælp af faktoranalyse af tetrakoriske og polykore sammenhænge. Funktioner til at analysere data på flere niveauer omfatter inden for og mellem grupper statistik, herunder korrelationer og faktoranalyse. Funktioner til simulering og afprøvning af bestemte emne- og teststrukturer er inkluderet. Flere funktioner fungerer som en nyttig brugerflade til strukturel ligningsmodellering. Grafiske visninger af stidiagrammer, faktoranalyse og strukturelle ligningsmodeller oprettes ved hjælpe af grundlæggende grafik. Nogle af funktionerne er skrevet til at understøtte en bog om psykometrisk teori samt publikationer i personlighedsforskning.

Denne pakke indeholder GNU R-funktioner til korrelationsteori, metaanalyse (validitet-oprettelse), troværdighed, elementanalyse, inter-rater troværdighed og klassisk udnyttelse.

Rekursiv partitionering baseret på psykometriske modeller, der anvender den generelle MOB-algoritmer (fra pakken partykit) for at opnå Bradley-Terry-træer, Rasch-træer, bedømmelsesskala og delvise kredittræer og MPT-træer.

En samling af funktioner der kan være nyttig til at analysere data fra pyskofysiske eksperimenter. Det inkluderer funktioner til at beregne d' fra flere forskellige eksperimentdesign, henvisninger for m-alternative tvunget valg-data (mafc) til brugs med den binomiale familie i glm (og muligvis andre kontekster) og self-Start-funktioner til at estimere gammaværdier for CRT-skærmkalibreringer.

PyEPL er et værktøjssæt for stimulilevering og svarregistrering, som skal bruges til oprettelse af psykologieksperimenter (samt neurovidenskab, markedsføringsforskning og andre).

Det tilbyder

• præsentation: Både visuelle og auditive stimuli
• svarregistrering: både manuel (tastatur/joystick) og lyd (mikrofon) tidsstemplet
• sync-pulserende: synkroniserer din adfærdsmæssige opgave med ekstern erhvervelsesudstyr
• fleksibilitet i kodningen af forskellige eksperimenter på grund af brugen af Python som en beskrivelsessprog
• Hurtig udførelse af kritiske punkter på grund af kaldene til lænkede og kompilerede biblioteker

Denne værktøjskasse er et alternativ til det vidt udbredte kommercielle produkt E'(E-Prime).

Denne pakke tilbyder PyEPL for understøttede versioner af Python.

Denne pakke indeholder et Pythonmodul til at validere BIDS-datasæt (Brain Imaging Data Structure). Det indeholder ikke det originale bids-validator-kommandolinjeværktøj (skrevet i JS).

Brain Modelling Toolkit er en programudviklingspakke til at bygge, simulere og analysere netværk i stor skala for forskellige niveauer af opløsning.

PyNWB is a Python package for working with NWB files. It provides a high-level API for efficiently working with Neurodata stored in the NWB format.

Neurodata Without Borders: Neurophysiology (NWB:N) is a project to develop a unified data format for cellular-based neurophysiology data, focused on the dynamics of groups of neurons measured under a large range of experimental conditions.

Denne metapakke vil installere Debianpakker, som kan være nyttige for udførsel af eksperimenter relateret til fysisk stimuli og deres fysiologiske effekter.

Udvalget af pakker er målrettet programmer for stimuli. For yderligere programmer relateret til analyse af de indhentede data se science-neuroscience-cognitive, med-imaging afhængig af domænanvendelsen. Kig derudover i science-bci da disse pakker ofte tilbyder en fuldstændig ramme inklusiv stimulilevering.