Debian Med Project
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Summary
Psychology
pacchetti Debian Med per la psicologia

Questo metapacchetto contiene le dipendenze per una raccolta di software che potrebbe essere utile per ricerche in campo psicologico.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for Debian Med to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the Debian Med mailing list

Links to other tasks

Debian Med Psychology packages

Official Debian packages with high relevance

orthanc-neuro
plugin per neuroimmagini per Orthanc
Versions of package orthanc-neuro
ReleaseVersionArchitectures
sid1.0-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
trixie1.0-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
bookworm1.0-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Popcon: 7 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Questo pacchetto installa un plugin per Orthanc, un archivio per immagini medicali leggero e indipendente dal venditore basato su REST. Questo plugin aggiunge la gestione di neuroimmagini in Orthanc, in particolare per convertire facilmente da DICOM a NIfTI.

Please cite: Sebastien Jodogne: The Orthanc Ecosystem for Medical Imaging. J Digit Imaging (2018)
praat
programma per l'analisi e la sintesi del linguaggio
Versions of package praat
ReleaseVersionArchitectures
bookworm6.3.07-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye6.1.38-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster6.0.48-1amd64,arm64,i386,mips64el,ppc64el,s390x
jessie5.4.0-1amd64,armel,armhf,i386
stretch6.0.23-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
sid6.4.07+dfsg-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64
trixie6.4.05+dfsg-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el
Debtags of package praat:
fieldlinguistics
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitmotif
works-withaudio
x11application
Popcon: 18 users (13 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Secondo i suoi autori, praat è "fonetica tramite il computer". Molteplici funzionalità di analisi del linguaggio sono disponibili tramite la sua interfaccia grafica: spettrogrammi, cocleogrammi, estrazione del tono e della formante. Sono altresì disponibili sintesi articolatorie, dal tono, dalla formante e dall'intensità. Fra le altre funzionalità si segnalano segmentazione, etichettatura con uso dell'alfabeto fonetico e computazione statistica. Praat è configurabile ed estensibile attraverso il suo linguaggio di script ed è inoltre predisposto per poter comunicare con altri programmi.

Please cite: Paul Boersma: Praat, a system for doing phonetics by computer. Glot International 5(9/10):341-345 (2001)
Screenshots of package praat
psignifit
interpolazione e test delle ipotesi di funzioni psicometriche
Versions of package psignifit
ReleaseVersionArchitectures
jessie2.5.6-3amd64,armel,armhf,i386
sid2.5.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
trixie2.5.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
bookworm2.5.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye2.5.6-7amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster2.5.6-5amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
stretch2.5.6-3.1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package psignifit:
fieldstatistics
interfacecommandline
roleprogram
Popcon: 5 users (3 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Psignifit permette l'adattamento di funzioni psicometriche a insiemi di dati mantenendo il controllo completo su un gran numero di parametri. I dati possono essere letti da file di testo o passati tramite una pipe.

Psignifit effettua il calcolo degli intervalli di fiducia ma anche dei test della bontà dell'adattamento.

Questa è la versione a riga di comando.

Notare che questa è la versione obsoleta 2.x di psignifit.

Screenshots of package psignifit
psychopy
ambiente per la creazione in Python di stimoli psicologici
Versions of package psychopy
ReleaseVersionArchitectures
bullseye2020.2.10+dfsg-2all
trixie2023.2.4+dfsg-3all
sid2023.2.4+dfsg-3all
stretch1.83.04.dfsg-2all
upstream2024.1.0
Popcon: 2 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

PsychoPy fornisce un ambiente per la creazione di stimoli psicologici usando il linguaggio di scripting Python. Combina la forza grafica di OpenGL con la facile sintassi di Python, offrendo un pacchetto libero e semplice per il controllo e la rappresentazione di stimoli psicofisici.

L'obiettivo è fornire, agli scienziati indaffarati, strumenti per il controllo della tempistica e della visualizzazione oltre ad un semplice set di stimoli e metodi già pronti. Le caratteristiche principali di PsychoPy sono:

  • GUI dell'IDE per scrivere codice con un linguaggio di script potente (Python);
  • GUI Builder per uno sviluppo rapido delle sequenze di stimolazione;
  • uso di grafica con accelerazione hardware (OpenGL);
  • integrazione con Spectrascan PR650 per una facile calibrazione del monitor;
  • semplici routine per metodi sperimentali con stimoli a livelli variabili e costanti oltre a curve di interpolazione e metodo bootstrap;
  • interfacce grafiche semplici (o più elaborate) attraverso wxPython;
  • semplici interfacce per joystick, mouse, schede sonore, ecc. con PyGame;
  • riproduzione di video (MPG, DivX, AVI, QuickTime, ecc.) come stimoli.
The package is enhanced by the following packages: python-pyoptical
Please cite: Jonathan W.Peirce: PsychoPy—Psychophysics software in Python. Journal of Neuroscience Methods 162(1-2):8-13 (2007)
Screenshots of package psychopy
python3-bioxtasraw
process biological small angle scattering data
Versions of package python3-bioxtasraw
ReleaseVersionArchitectures
bookworm2.1.1-4amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el
sid2.2.1-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el
upstream2.2.2
Popcon: 0 users (1 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

BioXTAS RAW is a GUI based, Python program for reduction and analysis of small-angle X-ray solution scattering (SAXS) data. The package is designed for biological SAXS data.

BioXTAS RAW provides an alternative to closed source programs such as Primus and Scatter for primary data analysis. Because it can calibrate, mask, and integrate images it also provides an alternative to synchrotron beamline pipelines that scientists can install on their own computers and use both at home and at the beamline.

r-cran-foreign
pacchetto GNU R per leggere/scrivere dati da altri sistemi statistici
Maintainer: Dirk Eddelbuettel
Versions of package r-cran-foreign
ReleaseVersionArchitectures
bullseye0.8.81-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
stretch0.8.67-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm0.8.84-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie0.8.86-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
sid0.8.86-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
jessie0.8.61-1amd64,armel,armhf,i386
buster0.8.71-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package r-cran-foreign:
devellang:r, library
fieldstatistics
roleapp-data
suitegnu
useconverting
Popcon: 756 users (468 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Questo pacchetto fornisce funzioni per leggere e scrivere dati archiviati da pacchetti statistici come Minitab, S, SAS, SPSS, Stata, ...

Questo pacchetto fa parte dell'insieme di pacchetti "raccomandati" da R Core e forniti con i rilasci originali dei sorgenti di R stesso.

r-cran-psy
funzioni GNU R per psicometria
Versions of package r-cran-psy
ReleaseVersionArchitectures
bullseye1.1-5all
bookworm1.2-1all
trixie1.2-1all
sid1.2-1all
stretch1.1-2all
buster1.1-4all
jessie1.1-1all
Debtags of package r-cran-psy:
devellang:r, library
fieldmedicine, statistics
interfacecommandline
roleshared-lib
scopeutility
useanalysing, viewing
Popcon: 16 users (5 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Questo pacchetto include svariate procedure usate in psicometria e per scalare, incluse:

  • K e K pesato di Cohen (testi di accordo tra 2 osservatori);
  • Alpha di Cronbach (un test di attendibilità di un elemento);
  • analisi dei componenti principali con focus;
  • coefficienti di correlazione intra-classe;
  • K di Light (un test di accordo tra N osservatori);
  • grafico degli autovalori e rappresentazioni grafiche dei componenti principali.
Remark of Debian Med team: r-cran-psy is orphaned upstream.

Hint to users of statistical psychological software. This package seems to be orphaned upstream. There are several related packages at CRAN for instance. See the list of prospective packages below and drop the Debian Med team a note if you are interested in one of them.

r-cran-psych
GNU R procedures for psychological, psychometric, and personality research
Versions of package r-cran-psych
ReleaseVersionArchitectures
bookworm2.2.9-1all
bullseye2.0.12-1all
stretch-backports1.8.12-1~bpo9+1all
buster1.8.12-1all
trixie2.4.1-1all
sid2.4.1-1all
upstream2.4.3
Popcon: 54 users (44 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

This GNU R package provides a general purpose toolbox for personality, psychometric theory and experimental psychology. Functions are primarily for multivariate analysis and scale construction using factor analysis, principal component analysis, cluster analysis and reliability analysis, although others provide basic descriptive statistics. Item Response Theory is done using factor analysis of tetrachoric and polychoric correlations. Functions for analyzing data at multiple levels include within and between group statistics, including correlations and factor analysis. Functions for simulating and testing particular item and test structures are included. Several functions serve as a useful front end for structural equation modeling. Graphical displays of path diagrams, factor analysis and structural equation models are created using basic graphics. Some of the functions are written to support a book on psychometric theory as well as publications in personality research.

r-cran-psychometric
GNU R applied psychometric theory
Versions of package r-cran-psychometric
ReleaseVersionArchitectures
bookworm2.3-1all
sid2.4-1all
bullseye2.2-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie2.4-1all
Popcon: 6 users (4 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Contains GNU R functions useful for correlation theory, meta-analysis (validity-generalization), reliability, item analysis, inter-rater reliability, and classical utility.

r-cran-psychotree
GNU R recursive partitioning based on psychometric models
Versions of package r-cran-psychotree
ReleaseVersionArchitectures
bullseye0.15-3-2all
sid0.16-0-1all
trixie0.16-0-1all
bookworm0.16-0-1all
Popcon: 7 users (4 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Recursive partitioning based on psychometric models, employing the general MOB algorithm (from package partykit) to obtain Bradley-Terry trees, Rasch trees, rating scale and partial credit trees, and MPT trees.

r-cran-psyphy
functions for analyzing psychophysical data in GNU R
Versions of package r-cran-psyphy
ReleaseVersionArchitectures
sid0.3-1all
bookworm0.2-3-1all
trixie0.3-1all
bullseye0.2-2-1all
Popcon: 3 users (4 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

An assortment of functions that could be useful in analyzing data from psychophysical experiments. It includes functions for calculating d' from several different experimental designs, links for m-alternative forced- choice (mafc) data to be used with the binomial family in glm (and possibly other contexts) and self-Start functions for estimating gamma values for CRT screen calibrations.

Official Debian packages with lower relevance

python-pyepl
modulo per codificare esperimenti psicologici in Python
Versions of package python-pyepl
ReleaseVersionArchitectures
buster1.1.0+git12-g365f8e3-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
jessie1.1.0+git12-g365f8e3-2amd64,armel,armhf,i386
Debtags of package python-pyepl:
devellang:python
hardwareinput, input:keyboard, input:mouse, video
interfacecommandline, x11
officepresentation
roledevel-lib, program
scopesuite
soundplayer
usemonitor, playing, viewing
works-withpeople
x11application
Popcon: 1 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

PyEPL è un toolkit per somministrazione di stimoli e registrazione di risposte che può essere usato per generare esperimenti psicologici (oltre che per neuroscienze, ricerche di marketing e altro).

Fornisce:

  • somministrazione: stimoli sia visivi sia sonori;
  • registrazione delle risposte: sia manuale (tastiera/joystick) sia sonora (microfono) e con data e orario;
  • impulsi sincronizzati: sincronizzazione dei compiti comportamentali con hardware di acquisizione esterno;
  • flessibilità nella codifica di vari esperimenti grazie all'uso di Python come linguaggio di descrizione;
  • veloce esecuzione di punti critici grazie alle chiamate a librerie collegate in fase di compilazione.

Questo insieme di strumenti ha lo scopo di essere un'alternativa al prodotto commerciale E'(E-Prime) ampiamente usato.

Questo pacchetto fornisce PyEPL per le versioni gestite di Python.

The package is enhanced by the following packages: python-pyoptical
python3-bids-validator
validatore per insiemi di dati BIDS (Brain Imaging Data Structure)
Versions of package python3-bids-validator
ReleaseVersionArchitectures
bookworm1.9.9-1all
bullseye1.6.0-1all
trixie1.14.4-1all
sid1.14.4-1all
Popcon: users ( upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Questo pacchetto contiene un modulo Python per validare insiemi di dati BIDS (Brain Imaging Data Structure). Non contiene lo strumento a riga di comando originale bids-validator (scritto in JS).

python3-bmtk
pacchetto di sviluppo per costruire, simulare e analizzare reti su vasta scala
Versions of package python3-bmtk
ReleaseVersionArchitectures
bookworm1.0.6+ds-1amd64
bullseye0.0+git20210109.8572664+ds-1amd64
trixie1.0.8+ds-2amd64
sid1.0.8+ds-3amd64
Popcon: 1 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Il Brain Modelling Toolkit è un pacchetto di sviluppo software per costruire, simulare e analizzare reti su vasta scala a differenti livelli di risoluzione.

python3-pynwb
Python library for working with Neurodata in the NWB format
Versions of package python3-pynwb
ReleaseVersionArchitectures
trixie2.5.0-1all
buster0.5.1-1all
sid2.5.0-1all
upstream2.6.0
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

PyNWB is a Python package for working with NWB files. It provides a high-level API for efficiently working with Neurodata stored in the NWB format.

Neurodata Without Borders: Neurophysiology (NWB:N) is a project to develop a unified data format for cellular-based neurophysiology data, focused on the dynamics of groups of neurons measured under a large range of experimental conditions.

science-psychophysics
pacchetti Debian Science per la psicofisica
Versions of package science-psychophysics
ReleaseVersionArchitectures
bookworm1.14.5all
trixie1.14.5all
bullseye1.14.2all
sid1.14.5all
buster1.10all
stretch1.7all
jessie1.4all
Debtags of package science-psychophysics:
rolemetapackage
suitedebian
Popcon: 1 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Questo metapacchetto installa i pacchetti Debian che possono essere utili per effettuare qualsiasi esperimento relativo a stimoli fisici e ai loro effetti psicologici.

La selezione dei pacchetti è focalizzata su software per la somministrazione di stimoli. Per software aggiuntivo relativo all'analisi dei dati acquisiti guardare science-neuroscience-cognitive e med-imaging, a seconda del campo di applicazione. In aggiunta guardare science-bci dato che quei pacchetti spesso forniscono infrastrutture per il ciclo completo di lavoro compresa la somministrazione degli stimoli.

*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 236867