Debian Med Psychology packages

This package installs a plugin for Orthanc, the lightweight, RESTful Vendor Neutral Archive for medical imaging. This plugin adds support for neuroimaging in Orthanc, notably to easily convert from DICOM to NIfTI.

Według autorów, praat służy do obsługiwania komputerowej fonetyki. Za pośrednictwem interfejsu graficznego można uzyskać dostęp do różnych funkcji analizy mowy, dostępne są: spektrogramy, kochleogramy, wydobywanie intensywności i formatu dźwięku. Program umożliwia również syntezę artykulacji, intensywności, formatu oraz intonacji. Pozostałe funkcje to: segmentacja, znakowanie z wykorzystaniem alfabetu fonetycznego i obliczanie statystyk. Praat jest konfigurowalny i rozszerzalny poprzez własny język skryptowy, a ponadto potrafi komunikować się z innymi programami.

Psignifit allows fitting of psychometric functions to datasets while maintaining full control over a large number of parameters. Data can either be read from text files or passed through a pipe.

Psignifit performs the calculation of confidence intervals as well as goodness-of-fit tests.

This is the command line version.

Please note: This is the legacy version 2.x of psignifit.

PsychoPy provides an environment for creating psychology stimuli using Python scripting language. It combines the graphical strengths of OpenGL with easy Python syntax to give psychophysics a free and simple stimulus presentation and control package.

The goal is to provide, for the busy scientist, tools to control timing and windowing and a simple set of pre-packaged stimuli and methods. PsychoPy features

• IDE GUI for coding in a powerful scripting language (Python)
• Builder GUI for rapid development of stimulation sequences
• Use of hardware-accelerated graphics (OpenGL)
• Integration with Spectrascan PR650 for easy monitor calibration
• Simple routines for staircase and constant stimuli experimental methods as well as curve-fitting and bootstrapping
• Simple (or complex) GUIs via wxPython
• Easy interfaces to joysticks, mice, sound cards etc. via PyGame
• Video playback (MPG, DivX, AVI, QuickTime, etc.) as stimuli

BioXTAS RAW is a GUI based, Python program for reduction and analysis of small-angle X-ray solution scattering (SAXS) data. The package is designed for biological SAXS data.

BioXTAS RAW provides an alternative to closed source programs such as Primus and Scatter for primary data analysis. Because it can calibrate, mask, and integrate images it also provides an alternative to synchrotron beamline pipelines that scientists can install on their own computers and use both at home and at the beamline.

This package provides functions for reading and writing data stored by statistical packages such as Minitab, S, SAS, SPSS, Stata, ...

This package is part of the set of packages that are 'recommended' by R Core and shipped with upstream source releases of R itself.

This package includes several procedures used in psychometrics and scaling, including:

• Cohen's Kappa and weighted Kappa (two-rater agreement tests)
• Cronbach's Alpha (an item-reliability test)
• Focused Principal Components Analysis
• Intraclass correlation coefficients
• Light's Kappa (an N-rater agreement test)
• Screeplots and graphical representations of principal components

This GNU R package provides a general purpose toolbox for personality, psychometric theory and experimental psychology. Functions are primarily for multivariate analysis and scale construction using factor analysis, principal component analysis, cluster analysis and reliability analysis, although others provide basic descriptive statistics. Item Response Theory is done using factor analysis of tetrachoric and polychoric correlations. Functions for analyzing data at multiple levels include within and between group statistics, including correlations and factor analysis. Functions for simulating and testing particular item and test structures are included. Several functions serve as a useful front end for structural equation modeling. Graphical displays of path diagrams, factor analysis and structural equation models are created using basic graphics. Some of the functions are written to support a book on psychometric theory as well as publications in personality research.

Contains GNU R functions useful for correlation theory, meta-analysis (validity-generalization), reliability, item analysis, inter-rater reliability, and classical utility.

Recursive partitioning based on psychometric models, employing the general MOB algorithm (from package partykit) to obtain Bradley-Terry trees, Rasch trees, rating scale and partial credit trees, and MPT trees.

An assortment of functions that could be useful in analyzing data from psychophysical experiments. It includes functions for calculating d' from several different experimental designs, links for m-alternative forced- choice (mafc) data to be used with the binomial family in glm (and possibly other contexts) and self-Start functions for estimating gamma values for CRT screen calibrations.

PyEPL jest zestawem narzędzi do przesyłania bodźców i rejestrowania reakcji, który może być używany do tworzenia psychologicznych eksperymentów (a także do neurologii, badań marketingowych, i innych).

Zapewnia:

• prezentacje: zarówno bodźców wzrokowych jak i słuchowych;
• rejestrowanie reakcji: zarówno manualnej (klawiatura/joystick) jak i dźwiękowej (mikrofon) z sygnaturą czasową;
• synchronizację impulsową: synchronizowanie behawioralnych zadań z zewnętrznego sprzętu rejestrującego;
• elastyczność kodowania najróżniejszych eksperymentów ze względu na użycie Pythona jako języka opisującego;
• szybka realizacja krytycznych punktów z powodu wywołań do połączonych skompilowanych bibliotek.

Celem tego zestawu narzędzi jest ustanowienie alternatywy dla powszechnie stosowanego komercyjnego programu E (E-Prime).

Pakiet zawiera PyEPL do obsługiwanych wersji Pythona.

This package contains a Python module to validate BIDS (Brain Imaging Data Structure) datasets. It does not contain original bids-validator command line tool (written in JS).

The brain modelling toolkit is a software development package for building, simulating and analysing large-scale networks of different levels of resolution.

Ten metapakiet instaluje pakiety Debiana, które mogą być przydatne do przeprowadzania dowolnego eksperymentu związanego z bodźcami fizycznymi i ich skutkami psychologicznymi.

Dobór pakietów został ukierunkowany na oprogramowanie do dostarczania bodźców. Dodatkowe oprogramowanie związane z analizą pozyskanych danych odnosi się do nauki-neurologii-poznawczej, obrazowania medycznego w zależności od dziedziny zastosowania. Dodatkowo warto zapoznać się z science-bci, ponieważ często zapewnia kompletne struktury pętli, łącznie z dostarczaniem bodźców.