Summary
Physics
pacchetti Debian Med per fisici medici
Questo metapacchetto contiene dipendenze per una raccolta di software e
documentazione che sono utili per i fisici medici che lavorano nella
radiologia oncologica, la diagnostica per immagini e i campi collegati.
Description
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for Debian Med
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the Debian Med mailing list
Links to other tasks
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Debian Med Physics packages
Official Debian packages with high relevance
biosig-tools
strumenti di conversione di formato per formati di dati biomedici
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Versions of package biosig-tools |
Release | Version | Architectures |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
Debtags of package biosig-tools: |
interface | commandline |
role | program |
use | converting |
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License: DFSG free
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Questo pacchetto, basato sulla libreria BioSig, fornisce strumenti a riga
di comando, come:
- save2gdf: converte tra diversi formati di file inclusi, ma non limitati
a, SCP-ECG(EN1064), HL7aECG (FDA-XML), GDF, EDF, BDF, CWFB;
- biosig2gdf: converte file di dati biosig in GDF, per semplificare
l'analisi e il caricamento da parte di linguaggi di scripting
(es. loadgdf.{py,r});
- rec2bin, bin2rec, heka2itx, save2aecg, save2scp: diversi strumenti di
conversione basati su save2gdf;
- biosig_fhir: impacchetta dati biosignal in file modello HL7/FHIR binari;
- physicalunits: convertitore per codifica e decodifica di unità di misura
fisiche secondo la ISO 11073-10101.
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gdf-tools
libreria di IO per GDF - strumenti ausiliari
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Versions of package gdf-tools |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 0.1.3-8 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
stretch | 0.1.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 0.1.2-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 0.1.2-2.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bookworm | 0.1.3-11 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 0.1.3-11.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 0.1.3-11.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
Debtags of package gdf-tools: |
role | program |
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License: DFSG free
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GDF (General Dataformat for Biosignals, formato di dati generico per
biosegnali) è pensato per fornire un'archiviazione generica per segnali
biologici come EEG, ECG, MEG, ecc.
Questo pacchetto fornisce lo strumento incluso con la libreria (gdf_merger).
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octave
linguaggio GNU Octave per il calcolo numerico
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Versions of package octave |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 6.2.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 9.2.0-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
trixie | 9.2.0-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 7.3.0-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster-backports | 5.2.0-3~bpo10+1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 4.4.1-5 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch-backports | 4.4.1-4~bpo9+1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el |
stretch-backports | 4.4.0-3~bpo9+1 | s390x |
stretch | 4.0.3-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 3.8.2-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package octave: |
field | mathematics |
role | program |
suite | gnu |
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License: DFSG free
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Octave è un linguaggio di alto livello (per la maggior parte compatibile
con Matlab®) orientato principalmente al calcolo numerico. Fornisce una
comoda interfaccia a riga di comando per risolvere numericamente problemi
lineari e non.
Octave può essere esteso dinamicamente con file C++ forniti dall'utente.
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paw
Physics Analysis Workstation - un programma di analisi grafica
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Versions of package paw |
Release | Version | Architectures |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package paw: |
field | physics |
interface | x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | xlib |
use | viewing |
x11 | application |
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License: DFSG free
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CERNLIB è una suite di strumenti e librerie per l'analisi dati,
pensati per l'uso in sperimentazioni di fisica ma applicabili anche ad altri
campi come ad esempio le scienze biologiche.
PAW è un programma interattivo che fornisce strumenti per presentazioni
grafiche interattive e per analisi matematiche e statistiche. È progettato
per lavorare su oggetti familiari per i fisici, come istogrammi, file
evento (n-tuple), vettori, ecc.
Il programma, per funzionare in modo corretto su architetture a 64 bit,
include le librerie CERN
statiche poiché il modo in cui è stato
progettato non è totalmente compatibile con tale architettura.
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paw++
Physics Analysis Workstation (versione migliorata con Lesstif)
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Versions of package paw++ |
Release | Version | Architectures |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package paw++: |
field | physics |
interface | x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | motif |
use | viewing |
x11 | application |
|
License: DFSG free
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CERNLIB è una suite di strumenti e librerie per l'analisi dati,
pensati per l'uso in sperimentazioni fisiche ma applicabili anche ad altri
campi come ad esempio le scienze biologiche.
Questo pacchetto include Paw++, un programma interattivo per l'uso nelle
analisi e nelle presentazioni grafiche. Paw++ è lo stesso programma di PAW
(nel pacchetto "paw"), ma con un'interfaccia grafica più gradevole, basata
su Motif, compilata con Lesstif in Debian.
Il programma è staticamente collegato alle librerie CERN su architetture a
64 bit per poter funzionare correttamente, poiché il suo disegno non è
propriamente un 64 bit pulito.
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r-base
sistema per calcoli e grafici statistici GNU R
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Versions of package r-base |
Release | Version | Architectures |
buster | 3.5.2-1 | all |
stretch | 3.3.3-1 | all |
bullseye | 4.0.4-1 | all |
bookworm | 4.2.2.20221110-2 | all |
trixie | 4.4.1-3 | all |
sid | 4.4.1-3 | all |
jessie | 3.1.1-1+deb8u1 | all |
jessie-security | 3.1.1-1+deb8u1 | all |
Debtags of package r-base: |
devel | lang:r |
field | statistics |
role | dummy, metapackage |
suite | gnu |
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License: DFSG free
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R è un sistema per il calcolo statistico e per la grafica. Consiste di un
linguaggio e di un ambiente eseguibile con grafica, un debugger, l'accesso
a certe funzioni di sistema e la capacità di eseguire programmi memorizzati
in file script.
La progettazione di R è stata pesantemente influenzata da due linguaggi
già esistenti: S di Becker, Chambers e Wilks e Scheme di Sussman. Di
conseguenza il linguaggio risulta avere un aspetto molto simile a S e
l'implementazione e la semantica sottostanti sono derivate da Scheme.
Il cuore di R è un linguaggio interpretato che permette salti e cicli ma
anche la programmazione modulare tramite le funzioni. La maggior parte
delle funzioni visibili all'utente sono scritte in R. L'utente può
interfacciarsi con procedure scritte in C, C++ o FORTRAN per l'efficienza,
come fanno molte delle funzioni principali di R. La distribuzione di R
contiene funzionalità per un gran numero di procedure statistiche e per i
calcoli matematici applicati sottostanti. C'è anche un ampio insieme di
funzioni che forniscono un ambiente grafico flessibile per la creazione di
diversi tipi di rappresentazione dei dati.
Inoltre, diverse migliaia di "pacchetti" d'estensione sono disponibili dal
CRAN, Comprehensive R Archive Network, molti dei quali sono disponibili
come pacchetti Debian con nome "r-cran-".
Questo è un metapacchetto che facilita la transizione dall'organizzazione
dei pacchetti pre-1.5.0 con il pacchetto r-base più grande. Una volta
installato, questo pacchetto può essere tranquillamente rimosso e apt-get
aggiornerà automaticamente i suoi componenti in futuro. Questo pacchetto è
fornito per dare la possibilità agli utenti di installare poi solo
r-base-core se preferiscono così.
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Official Debian packages with lower relevance
libbiosig-dev
libreria di I/O per dati biomedici - file di sviluppo
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Versions of package libbiosig-dev |
Release | Version | Architectures |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package libbiosig-dev: |
devel | examples, library |
role | devel-lib |
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License: DFSG free
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BioSig è una libreria per accedere a file in svariati formati di dati
biomedici (inclusi EDF, BDF, GDF, BrainVision, BCI2000, CFWB, HL7aECG,
SCP_ECG (EN1064), MFER, ACQ, CNT(Neuroscan), DEMG, EGI, EEG1100,
FAMOS, SigmaPLpro, TMS32). L'elenco completo dei formati di file gestiti è
disponibile all'indirizzo http://pub.ist.ac.at/~schloegl/biosig/TESTED .
Questo pacchetto fornisce i file header e la libreria statica.
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octave-biosig
collegamenti Octave per la libreria BioSig
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Versions of package octave-biosig |
Release | Version | Architectures |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 1.3.0-2.2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.3.0-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
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License: DFSG free
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Questo pacchetto contiene i collegamenti Octave per la libreria BioSig. Il
suo scopo principale è un'interfaccia di I/O per svariati formati di file
biomedici compresi, ma non limitati a, SCP-ECG(EN1064), HL7aECG (FDA-XML),
GDF, EDF.
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paw-demos
Physics Analysis Workstation - esempi e test
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Versions of package paw-demos |
Release | Version | Architectures |
jessie | 2.14.04.dfsg.2-9 | all |
stretch | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | all |
buster | 2.14.04.dfsg.2-9.1 | all |
Debtags of package paw-demos: |
devel | examples, testing-qa |
field | physics |
interface | commandline, x11 |
role | program |
x11 | application |
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License: DFSG free
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CERNLIB è una suite di strumenti e librerie per l'analisi dati,
pensati per l'uso in sperimentazioni fisiche ma applicabili anche ad altri
campi come ad esempio le scienze biologiche.
Questo pacchetto include script d'esempio da usare con PAW o Paw++ e
script test per assicurarsi che i programmi PAW o Paw++ funzionino
correttamente. Si possono eseguire gli esempi e i test con il programma
incluso paw-demos.
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python3-biosig
collegamenti Python 3 per la libreria BioSig
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Versions of package python3-biosig |
Release | Version | Architectures |
sid | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 2.5.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 2.1.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.9.3-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
trixie | 2.6.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
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License: DFSG free
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Questo pacchetto fornisce i collegamenti Python 3 per la libreria BioSig.
L'obiettivo principale consiste in un'interfaccia di I/O ad una varietà di
formati di file biomedici che include, ma non si limita a, SCP-ECG(EN1064),
HL7aECG (FDA-XML), GDF e EDF.
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python3-multipletau
algoritmo multiple-tau per Python3/NumPy
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Versions of package python3-multipletau |
Release | Version | Architectures |
sid | 0.4.1+ds-1 | all |
trixie | 0.4.1+ds-1 | all |
bookworm | 0.3.3+ds-4 | all |
jessie | 0.1.4-1 | all |
stretch | 0.1.7+ds-1 | all |
bullseye | 0.3.3+ds-3 | all |
buster | 0.3.3+ds-1 | all |
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License: DFSG free
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La correlazione multiple-tau è calcolata su scala logaritmica (vengono
calcolati meno punti dati) ed è perciò molto più veloce della correlazione
convenzionale su scala lineare come "numpy.correlate".
Un riferimento online è disponibile su
http://paulmueller.github.io/multipletau
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No known packages available but some record of interest (WNPP bug)
Geant4 Application for Emission Tomography
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License: LGPL
Debian package not available
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GATE incorporates the Geant4 libraries in a modular, versatile, and
scripted simulation toolkit which is adapted to the field of nuclear
medicine both in PET (Positron Emission Tomography) and SPECT (Single
Photon Emission Computer Tomography). It allows the accurate description
of time-dependent phenomena such as source or detector movement and
source decay kinetics. The ability to synchronize all time-dependent
components allows a coherent description of the acquisition process. It
makes it possible to perform realistic simulations of data acquisitions
in time.
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platform for the design, test and use of BCI
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License: LGPL
Debian package not available
Language: C++
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OpenViBE enables to design, test and use Brain-Computer Interfaces (BCI).
OpenViBE is a software for real-time neurosciences (that is, for
real-time processing of brain signals). It can be used to acquire, filter,
process, classify and visualize brain signals in real time.
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