PAN Blend tomography packages

The UFO data processing framework is a C library suited to build general purpose streams data processing on heterogeneous architectures such as CPUs, GPUs or clusters. It is extensively used at the Karlsruhe Institute of Technology for Ultra-fast X-ray Imaging (radiography, tomography and laminography).

A gobject-instrospection binding is also provided to write scripts or user interfaces.

This package contains binaries to run JSON descriptions of task graphs.

MayaVi2 est un outil multiplateformes de visualisation de donnée scientifiques 2D et 3D. Ses fonctionnalités incluent :

• Visualisation de données scalaires, en vecteur et de tenseur en 2 et 3 dimensions
• Scriptabilité simple en Python
• Extensitivé simple via des sources personnalisée, des modules et des filtres de données
• lecture de divers formats de fichiers : VTK (de base et XML), PLOT3D, etc.
• Enregistrement des visualisations
• Enregistrement des visualisations affichées dans divers formats d'image.

MayaVi2 a été conçu pour être scriptable et extensible. Si vous pouvez utiliser l'application mayavi2 elle-même, vous pouvez l'utiliser comme greffon Envisage, ce qui vous permet de l'embarquer nativement dans des applications utilisateur. Vous pouvez aussi l'utiliser comme un moteur de

 visualisation pour une application.

Ce paquet fournit également TVTK, qui englobe des objets VTK pour offrir une API pratique et en Python, tout en supportant les attributs Traits et les palettes NumPy/SciPy. TVTK est en général implémenté en pur Python, sauf pour un petit module complémentaire.

ParaView est une application multi-plateforme au code source ouvert conçue pour visualiser des ensembles de données allant du plus petit au plus grand. Les buts du projet ParaView incluent les éléments suivants :

 – développer une application de visualisation, multi-plateforme et au code
   source ouvert ;
 – prendre en charge les modèles de calcul distribué pour traiter de grands
   ensembles de données ;
 – créer une interface pour l’utilisateur libre, adaptable et intuitive ;
 – développer une architecture extensible basée sur les normes ouvertes.

ParaView s’exécute aussi bien sur des systèmes distribués avec partage de mémoire que sur des systèmes avec processeur unique, et a été testé avec succès sur Windows, Mac OS X, Linux et sur diverses stations de travail Unix, des grappes et des supercalculateurs. Sous le capot, ParaView utilise la boîte à outils de visualisation « Visualization Toolkit » pour le traitement des données et le moteur de rendu et possède une interface écrite en Qt.

scikit-image is a collection of image processing algorithms for Python. It performs tasks such as image loading, filtering, morphology, segmentation, color conversions, and transformations.

This package provides the Python 3 module.

The UFO data processing framework is a C library suited to build general purpose streams data processing on heterogeneous architectures such as CPUs, GPUs or clusters. It is extensively used at the Karlsruhe Institute of Technology for Ultra-fast X-ray Imaging (radiography, tomography and laminography).

This package contains average',backproject', bin',blur', buffer',calculate', camera',clip', contrast',crop', denoise',duplicate', fftmult',fft', filter',flatten', flip',forwardproject', gemm',ifft', interpolate',loop', measure',merge', metaballs',monitor', null',opencl', ordfilt',pad', read',reduce', refeed',replicate', rescale',ringwriter', sleep',slice', stack',stdin', stdout',subtract', transpose',write' and `zeropad' plugins

PyHST is a Python program for Tomographic data reconstruction based on direct filtered back-projection algorithm

This is the CUDA version

The PyASTRAToolbox is a Python interface to the ASTRA Toolbox, a tomography toolbox based on high-performance GPU primitives for 2D and 3D tomography.

The Python interface aims to expose all features of the ASTRA toolbox to Python, providing a high-performance tomography toolbox for Python users.

RabbitCT provides an open platform for worldwide performance-comparison of backprojection implementations on different architectures using one specific, clinical, high resolution C-arm CT dataset of a rabbit. This includes a sophisticated benchmark interface, a prototype implementation in C++, and image quality measures.

provided prior to the tomography experiment.

TomoPy is a Python toolbox to perform tomographic data processing and image reconstruction tasks at the Advanced Photon Sourc