PAN Blend tomography packages

The UFO data processing framework is a C library suited to build general purpose streams data processing on heterogeneous architectures such as CPUs, GPUs or clusters. It is extensively used at the Karlsruhe Institute of Technology for Ultra-fast X-ray Imaging (radiography, tomography and laminography).

A gobject-instrospection binding is also provided to write scripts or user interfaces.

This package contains binaries to run JSON descriptions of task graphs.

MayaVi2 — багатоплатформовий інструмент для візуалізації наукових даних у 2-D та 3-D. Серед його можливостей:

• візуалізація скалярних, векторних і тензорних даних у 2-х та 3-х вимірах;

• просте використання сценаріїв за допомогою Python;

• легка розширюваність за допомогою додаткових джерел користувача, модулів та фільтрів даних;

• читання кількох форматів: VTK (старий та XML), PLOT3D і т.д.;

• збереження візуалізації;
• збереження візуалізацій в різних графічних форматах.

MayaVi2 був створений з думкою про розширюваність та використання сценаріїв. Але MayaVi2 є корисним застосунком сам по собі, він також може бути використаний як Передбачальний (Envisage) втулок, який дозволяє вбудовувати MayaVi2 безпосередньо у застосунки користувача. Крім того, він може бути використаний в якості рушія візуалізації для будь-якого застосунка.

Цей пакунок також впроваджує TVTK, який обертає об’єкти VTK для забезпечення зручності використання, API для мови Python, підтримуючи при цьому атрибути Traits та масиви NumPy/SciPy. TVTK реалізується в основному на чистому Python, за винятком невеликих модулів розширення.

ParaView — багатоплатформний застосунок з відкритими джерельними кодами, розроблений для візуалізації наборів даних як великих розмірів так і малих. Метою проекту ParaView є:

• розробка застосунку для візуалізації, багатоплатформного з відкритими джерельними кодами

• підтримка розподіленої моделі обчислень, що оперують великими обсягами даних

• створення відкритого, гнучкого та інтуїтивно зрозумілого інтерфейсу користувача

• розробка гнучкої архітектури на основі відкритих стандартів

ParaView працює на системах із розділюваною та спільною пам’яттю, а також на однопроцесорних системах, її також було успішно протестовано у Windows, Linux, MacOS та різних робочих станціях Unix, а також кластерах й суперкомп’ютерах. ParaView використовує Visualization Toolkit в якості рушія для обробки та візуалізації даних; інтерфейс користувача написаний з використанням бібліотеки Qt.

scikit-image is a collection of image processing algorithms for Python. It performs tasks such as image loading, filtering, morphology, segmentation, color conversions, and transformations.

This package provides the Python 3 module.

The UFO data processing framework is a C library suited to build general purpose streams data processing on heterogeneous architectures such as CPUs, GPUs or clusters. It is extensively used at the Karlsruhe Institute of Technology for Ultra-fast X-ray Imaging (radiography, tomography and laminography).

This package contains average',backproject', bin',blur', buffer',calculate', camera',clip', contrast',crop', denoise',duplicate', fftmult',fft', filter',flatten', flip',forwardproject', gemm',ifft', interpolate',loop', measure',merge', metaballs',monitor', null',opencl', ordfilt',pad', read',reduce', refeed',replicate', rescale',ringwriter', sleep',slice', stack',stdin', stdout',subtract', transpose',write' and `zeropad' plugins

PyHST is a Python program for Tomographic data reconstruction based on direct filtered back-projection algorithm

This is the CUDA version

The PyASTRAToolbox is a Python interface to the ASTRA Toolbox, a tomography toolbox based on high-performance GPU primitives for 2D and 3D tomography.

The Python interface aims to expose all features of the ASTRA toolbox to Python, providing a high-performance tomography toolbox for Python users.

RabbitCT provides an open platform for worldwide performance-comparison of backprojection implementations on different architectures using one specific, clinical, high resolution C-arm CT dataset of a rabbit. This includes a sophisticated benchmark interface, a prototype implementation in C++, and image quality measures.

provided prior to the tomography experiment.

TomoPy is a Python toolbox to perform tomographic data processing and image reconstruction tasks at the Advanced Photon Sourc