PAN Blend tomography packages

The UFO data processing framework is a C library suited to build general purpose streams data processing on heterogeneous architectures such as CPUs, GPUs or clusters. It is extensively used at the Karlsruhe Institute of Technology for Ultra-fast X-ray Imaging (radiography, tomography and laminography).

A gobject-instrospection binding is also provided to write scripts or user interfaces.

This package contains binaries to run JSON descriptions of task graphs.

MayaVi2 — багатоплатформовий інструмент для візуалізації наукових даних у 2-D та 3-D. Серед його можливостей:

• візуалізація скалярних, векторних і тензорних даних у 2-х та 3-х вимірах;

• просте використання сценаріїв за допомогою Python;

• легка розширюваність за допомогою додаткових джерел користувача, модулів та фільтрів даних;

• читання кількох форматів: VTK (старий та XML), PLOT3D і т.д.;

• збереження візуалізації;
• збереження візуалізацій в різних графічних форматах.

MayaVi2 був створений з думкою про розширюваність та використання сценаріїв. Але MayaVi2 є корисним застосунком сам по собі, він також може бути використаний як Передбачальний (Envisage) втулок, який дозволяє вбудовувати MayaVi2 безпосередньо у застосунки користувача. Крім того, він може бути використаний в якості рушія візуалізації для будь-якого застосунка.

Цей пакунок також впроваджує TVTK, який обертає об’єкти VTK для забезпечення зручності використання, API для мови Python, підтримуючи при цьому атрибути Traits та масиви NumPy/SciPy. TVTK реалізується в основному на чистому Python, за винятком невеликих модулів розширення.

ParaView — багатоплатформний застосунок з відкритими джерельними кодами, розроблений для візуалізації наборів даних як великих розмірів так і малих. Метою проекту ParaView є:

• розробка застосунку для візуалізації, багатоплатформного з відкритими джерельними кодами

• підтримка розподіленої моделі обчислень, що оперують великими обсягами даних

• створення відкритого, гнучкого та інтуїтивно зрозумілого інтерфейсу користувача

• розробка гнучкої архітектури на основі відкритих стандартів

ParaView працює на системах із розділюваною та спільною пам’яттю, а також на однопроцесорних системах, її також було успішно протестовано у Windows, Linux, MacOS та різних робочих станціях Unix, а також кластерах й суперкомп’ютерах. ParaView використовує Visualization Toolkit в якості рушія для обробки та візуалізації даних; інтерфейс користувача написаний з використанням бібліотеки Qt.

scikit-image is a collection of image processing algorithms for Python. It performs tasks such as image loading, filtering, morphology, segmentation, color conversions, and transformations.

This package provides the Python 3 module.

PyHST is a Python program for Tomographic data reconstruction based on direct filtered back-projection algorithm

This is the CUDA version

The PyASTRAToolbox is a Python interface to the ASTRA Toolbox, a tomography toolbox based on high-performance GPU primitives for 2D and 3D tomography.

The Python interface aims to expose all features of the ASTRA toolbox to Python, providing a high-performance tomography toolbox for Python users.

RabbitCT provides an open platform for worldwide performance-comparison of backprojection implementations on different architectures using one specific, clinical, high resolution C-arm CT dataset of a rabbit. This includes a sophisticated benchmark interface, a prototype implementation in C++, and image quality measures.

provided prior to the tomography experiment.

TomoPy is a Python toolbox to perform tomographic data processing and image reconstruction tasks at the Advanced Photon Sourc