PAN Blend Project
Summary
tomography
tomografia PAN (fotoni e neutroni) Blend

Questo metapacchetto installa tutti i pacchetti per tomografia di PAN Blend per raggi X e fotoni e neutroni.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for PAN Blend to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the PAN Blend mailing list

Links to other tasks

PAN Blend tomography packages

Official Debian packages with high relevance

libufo-bin
libreria per calcolo ad alte prestazioni basato su GPU - strumenti
Versions of package libufo-bin
ReleaseVersionArchitectures
bullseye0.16.0.52.gbd831ab-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
stretch0.13.0-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie0.16.0.52.gbd831ab-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
sid0.16.0.52.gbd831ab-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
buster0.15.1-1amd64,arm64,armhf,i386
bookworm0.16.0.52.gbd831ab-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Popcon: 3 users (1 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

L'infrastruttura UFO per elaborazione dati è una libreria C fornita per creare elaborazioni di dati di flusso di scopo generico su piattaforme eterogenee quali CPU, GPU o cluster. Viene utilizzata in modo estensivo dall'Istituto di Tecnologia di Karlsruhe per immagini ultra veloci ai raggi X (radiografia, tomografia e laminografia).

Viene fornito anche un collegamento a gobject-introspection per scrivere script o interfacce utente.

Questo pacchetto contiene i binari per eseguire descrizioni JSON di grafi di attività.

mayavi2
pacchetto scientifico di visualizzazione di dati 2D e 3D
Versions of package mayavi2
ReleaseVersionArchitectures
bookworm4.8.0-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye4.7.1-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie4.8.1-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
sid4.8.1-4amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
stretch4.5.0-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster4.5.0-1amd64,arm64,armhf,i386
jessie4.3.1-3.1amd64,armel,armhf,i386
Debtags of package mayavi2:
develexamples, lang:python
roleprogram
useviewing
Popcon: 31 users (12 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

MayaVi2 è uno strumento multipiattaforma per la visualizzazione di dati scientifici 2D e 3D. Le sue caratteristiche includono:

  • visualizzazione di dati scalari, vettori e tensori in 2 e 3 dimensioni;
  • facile creazione di script usando Python;
  • facile estensibilità grazie a fonti, moduli e filtri dati personalizzati;
  • lettura di svariati formati di file: VTK (vecchi e XML), PLOT3D, ecc.;
  • salvataggio delle visualizzazioni;
  • salvataggio del rendering delle visualizzazioni in svariati formati immagine.

MayaVi2 è stato progettato pensando alla possibilità di creare script e alla estensibilità. Benché l'applicazione mayavi2 sia usabile di per sé, può essere usata come plugin Envisage che permette di incorporarla in modo nativo in applicazioni utente. In alternativa può essere usato come motore di visualizzazione per qualunque applicazione.

Questo pacchetto fornisce anche TVTK che fa da wrapper per oggetti VTK in modo da fornire una comoda API Pythonica, gestendo al contempo gli attributi Traits e gli array NumPy/SciPy. TVTK è implementato per la maggior parte in Python puro, tranne che per un piccolo modulo di estensione.

Screenshots of package mayavi2
paraview
applicazione per visualizzazione parallela
Versions of package paraview
ReleaseVersionArchitectures
jessie4.1.0+dfsg+1-1amd64,armel,armhf,i386
stretch5.1.2+dfsg1-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster5.4.1+dfsg4-3.1amd64,arm64,armhf,i386
sid5.11.2+dfsg-6amd64,arm64,i386,ppc64el,riscv64,s390x
bookworm5.11.0+dfsg-1amd64,arm64,i386,ppc64el,s390x
bullseye5.9.0-2amd64,arm64,i386,mips64el,ppc64el,s390x
upstream5.12.0
Debtags of package paraview:
roleprogram
uitoolkitqt
useviewing
Popcon: 154 users (161 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

ParaView è un'applicazione multipiattaforma e open source progettata per visualizzare insiemi di dati di dimensioni variabili da piccole a molto grandi. Tra gli scopi del progetto ParaView sono inclusi i seguenti:

  • sviluppare un'applicazione di visualizzazione open source e multipiattaforma;
  • gestire modelli di calcolo distribuito per elaborare grandi insiemi di dati;
  • creare un'interfaccia utente aperta, flessibile e intuitiva;
  • sviluppare un'architettura estensibile basata su standard aperti.

ParaView gira su sistemi paralleli a memoria distribuita e condivisa così come con processori singoli ed è stata testata con successo su Windows, Mac OS X, Linux e varie workstation Unix, cluster e supercomputer. Sotto il cofano, ParaView usa il Visualization Toolkit come motore di elaborazione e rendering dei dati ed ha un'interfaccia utente scritta usando Qt.

python3-skimage
moduli Python 3 per l'elaborazione di immagini
Versions of package python3-skimage
ReleaseVersionArchitectures
sid0.23.1-3all
stretch0.12.3-8all
buster0.14.2-2all
bullseye0.18.1-2all
bookworm0.19.3-8all
trixie0.22.0-3all
jessie0.10.1-2all
experimental0.23.2~rc1-1all
sid0.23.2-1all
Popcon: 79 users (187 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

scikit-image è una raccolta di algoritmi per l'elaborazione di immagini per Python. Esegue compiti come: caricamento, filtraggio, morfologia, segmentazione, conversione di colori e trasformazioni di immagini.

Questo pacchetto fornisce il modulo Python 3.

Please cite: Stéfan van der Walt, Johannes L. Schönberger, Juan Nunez-Iglesias, François Boulogne, Joshua D. Warner, Neil Yager, Emmanuelle Gouillart, Tony Yu and the scikit-image contributors: scikit-image: Image processing in Python (eprint) PeerJ 2:e453 (2014)
ufo-filters
insieme di plugin per ufo-core - runtime
Versions of package ufo-filters
ReleaseVersionArchitectures
sid0.16.0.159.g483ce16-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
trixie0.16.0.159.g483ce16-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x
bookworm0.16.0.159.g483ce16-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye0.16.0.159.g483ce16-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster0.14.1+dfsg1-2amd64,arm64,armhf,i386
stretch0.13.0+dfsg1-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
upstream0.16.0.172.g6f43afc
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

L'infrastruttura UFO per elaborazione dati è una libreria C fornita per creare elaborazioni di dati di flusso di scopo generico su piattaforme eterogenee quali CPU, GPU o cluster. Viene utilizzata in modo estensivo dall'Istituto di Tecnologia di Karlsruhe per immagini ultra veloci ai raggi X (radiografia, tomografia e laminografia).

Questo pacchetto contiene i plugin "average", "backproject", "bin", "blur", "buffer", "calculate", "camera", "clip", "contrast", "crop", "denoise", "duplicate", "fftmult", "fft", "filter", "flatten", "flip", "forwardproject", "gemm", "ifft", "interpolate", "loop", "measure", "merge", "metaballs", "monitor", "null", "opencl", "ordfilt", "pad", "read", "reduce", "refeed", "replicate", "rescale", "ringwriter", "sleep", "slice", "stack", "stdin", "stdout", "subtract", "transpose", "write" e "zeropad".

Debian packages in contrib or non-free

python3-pyhst2-cuda
Python High Speed Tomographic reconstruction
Versions of package python3-pyhst2-cuda
ReleaseVersionArchitectures
bookworm2020c-7 (contrib)amd64
sid2020c-7 (contrib)amd64
bullseye2020c-1 (contrib)amd64
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free, but needs non-free components
Git

PyHST is a Python program for Tomographic data reconstruction based on direct filtered back-projection algorithm

This is the CUDA version

No known packages available

astra-toolbox
A high-performance GPU MATLAB toolbox for 2D and 3D tomography
License: GPL-3
Debian package not available
freeart
SART reconstruction algorithm
License: LGPL
Debian package not available
imagej-pluggins-tomo
?
License: ?
Debian package not available
pyastra-toolbox
python binding for the astra-toolbox
License: GPL-3
Debian package not available

The PyASTRAToolbox is a Python interface to the ASTRA Toolbox, a tomography toolbox based on high-performance GPU primitives for 2D and 3D tomography.

The Python interface aims to expose all features of the ASTRA toolbox to Python, providing a high-performance tomography toolbox for Python users.

rabbitct
backprojection performance-comparison
License: GPL2+
Debian package not available

RabbitCT provides an open platform for worldwide performance-comparison of backprojection implementations on different architectures using one specific, clinical, high resolution C-arm CT dataset of a rabbit. This includes a sophisticated benchmark interface, a prototype implementation in C++, and image quality measures.

tomographie-preexperiment-data-collector
gather all information from the user that can be
License: GPL2+
Debian package not available

provided prior to the tomography experiment.

tomopy
tomographic data processing and image reconstruction toolbox
License: BSD-3
Debian package not available

TomoPy is a Python toolbox to perform tomographic data processing and image reconstruction tasks at the Advanced Photon Sourc

*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 237085