Debian Science Physics-dev packages

FEniCS er en samling af frie programmer til automatisk, effektiv løsning af differentialligninger.

FEniCS har en omfattende liste over funktioner, inklusive automatiserede løsning af variationsproblemer, automatiseret fejlkontrol og tilpasning, et omfattende bibliotek for begrænsede elementer, højtydende lineær algebra og meget mere.

FEniCS er organiseret som en samling af komponenter, der fungerer sammen, inklusive problemløsningsmiljøet DOLFIN, formularkompileren FFC, den begrænsede elementtabulator FIAT, just-in-time-kompileren Instant, grænseflade for kodeoprettelse UFC, formularsproget UFL og en række yderligere komponenter.

Dette er en metapakke, der afhænger af alle FEniCS-komponter.

Dette er den forældede version af FEniCS. Du kan eventuelt overveje at installere næste generation FEniCS-X (pakken fenicx).

Dette bibliotek beregner FFT'er i en eller flere dimensioner. Den er ekstremt hurtig. Denne pakke indeholder det statistiske lænkede bibliotek og hovedfilerne.

The Advanced Simulation Library (ASL) is a free and open source hardware accelerated multiphysics simulation platform (and an extensible general purpose tool for solving Partial Differential Equations).

Its computational engine is written in OpenCL and utilizes matrix-free solution techniques which enable extraordinarily high performance, memory efficiency and deployability on a variety of massively parallel architectures, ranging from inexpensive FPGAs, DSPs and GPUs up to heterogeneous clusters and supercomputers. The engine is hidden entirely behind simple C++ classes, so that no OpenCL knowledge is required from application programmers. Mesh-free, immersed boundary approach allows one to move from CAD directly to simulation drastically reducing pre-processing efforts and amount of potential errors.

ASL can be used to model various coupled physical and chemical phenomena and employed in a multitude of fields: computational fluid dynamics, virtual sensing, industrial process data validation and reconciliation, image-guided surgery, computer-aided engineering, design space exploration, crystallography, etc...

This package contains the development files.

Denne pakke beregner FE-basisfunktioner og afledninger for de følgende elementer:

• Lagrange (interval, triangle, tetrahedron, prism, pyramid, quadrilateral, hexahedron)
• Nédélec (triangle, tetrahedron)
• Nédélec Second Kind (triangle, tetrahedron)
• Raviart-Thomas (triangle, tetrahedron)
• Regge (triangle, tetrahedron)
• Crouzeix-Raviart (triangle, tetrahedron)

Beregner quadrature-regler på forskellige celletyper

Tilbyder referencetopologi og geometri for referenceceller af hver type.

Pythonomslag tilbudt med pybind11.

Denne pakke installerer udviklingsfilerne for det delte bibliotek.

deal.II is a C++ program library targeted at the computational solution of partial differential equations using adaptive finite elements. It uses state-of-the-art programming techniques to offer you a modern interface to the complex data structures and algorithms required.

This package contains the development files.

DOLFIN er Python- og C++-grænsefladen for FEniCS-projektet for den automatiserede løsning for differentialligninger, der tilbyder et konsistent PSE (Problem Solving Environment) for løsning af ordinære og delvise differentialligninger. De vigtigste funktioner er en simpel, konsistent og intuitiv objektorienteret API; automatisk og effektiv evaluering af sæsonformer; automatisk og effektiv samling af lineære systemer; og understøttelse af generelle familier af finitte elementer.

Denne pakke indeholder de gængse udviklingsfiler og afhænger af udviklingspakkerne real eller complex.

Dette er næste-generation versionen af libdolfinx-dev (DOLFIN-X). Den forældede version af DOLFIN tilbydes af libdolfin-dev.

fclib is an open source collection of Frictional Contact (FC) problems stored in a specific HDF5 format, and an open source light implementation of Input/Output functions in C Language to read and write problems.

The goal of this work is to set up a collection of 2D and 3D Frictional Contact (FC) problems in order to set up a list of benchmarks; provide a standard framework for testing available and new algorithms; and share common formulations of problems in order to exchange data.

Fclib is an open-source scientific software primarily targeted at modeling and simulating nonsmooth dynamical systems

This package includes the libfclib development headers.

FFTW-biblioteket beregner Fast Fourier Transforms (FFT) i en eller flere dimensioner. Den er ekstrem hurtig. Denne pakke indeholder det statistisk lænkede bibliotek, hovedfiler og testprogrammer.

Denne pakke indeholder teksthovedfiler og statiske biblioteker. For dokumentation se libfftw3-doc.

NFFT3 is a software library written in C for computing nonequispaced fast Fourier and related transformations. In detail, NFFT3 implements:

1) The nonequispaced fast Fourier transform (NFFT)

• the forward transform (NFFT)
• the adjoint transform (adjoint NFFT)

2) Generalisations of the NFFT

• to arbitrary knots in time and frequency domain (NNFFT)
• to the sphere S^2 (NFSFT)
• to the hyperbolic cross (NSFFT)
• to real-valued data, i.e. (co)sine transforms, (NFCT, NFST)
• to the rotation group (NFSOFT)

3) Generalised inverses based on iterative methods, e.g. CGNR, CGNE

4) Applications in

• medical imaging (i) magnetic resonance imaging (ii) computerised tomography
• summation schemes (i) fast Gauss transform (FGT) (ii) singular kernels (iii) zonal kernels
• polar FFT, discrete Radon transform, ridgelet transform

This package provides the development files for the NFFT library.

OpenCTM - Open Compressed Triangle Mesh-filformatet - er et filformat, et programbibliotek og et værktøjssæt for komprimering af 3D-trekantsmesher. Geometrien er komprimeret til en fraktion af sammenlignelige filformater, og formater kan nemt tilgås via en simpel, flytbar API.

Denne pakke indeholder udviklingsfilerne krævet for kompilering af programmer, der bruger OpenCTM.

Programbiblioteket p4est aktiverer den dynamiske håndtering af en samling af adaptive octrees, praktisk kaldt for en en skov af octrees. P4est er designet til at fungere parallelt og skalere til hundredvis eller tusindvis af processorkerner.

Denne pakke indeholder udviklingsfilerne.

A software tool for classical CFD, particle-based models and complex physical interaction, Palabos offers a powerful environment for your fluid flow simulations.

Through the innovative matrix-based interface, setting up a massively parallel simulation or developing a new physical model has become simpler than ever. The package contains development files.

SpFFT was originally intended for transforms of data with spherical cutoff in frequency domain, as required by some computational material science codes. For distributed computations, SpFFT uses a slab decomposition in space domain and pencil decomposition in frequency domain (all sparse data within a pencil must be on one rank). If desired, the library can be compiled without any parallelization (MPI, OpenMP, CUDA / ROCm).

This package contains development files.

Xray::Absorption supports access to X-ray absorption data. It is designed to be a transparent interface to absorption data from a variety of sources. Currently, the only sources of data are the 1969 McMaster tables, the 1999 Elam tables, the 1993 Henke tables, and the 1995 Chantler tables. The Brennan-Cowen implementation of the Cromer-Liberman tables is available as a drop-on-top addition to this package. More resources can be added easily.

Xray::Scattering supports access to X-ray scattering data for atoms and ions. It is designed to be a transparent interface to scattering data from a variety of sources. Currently, the only sources of data are the Cromer-Mann tables from the International Tables of Crystallography and the 1995 Waasmaier-Kirfel tables. More resources can be added easily.

Xray::SpaceGroup tilbyder en objektorienteret grænseflade til en database for rumgruppesymmetrier transskriberet fra bind A i »International Tables of Crystallography«.

PyFAI er et Pythonbibliotek for azimuthal integration; biblioteket giver mulighed for konvertering af diffraktionsbilleder taget med 2D-detektorer såsom CCD-kameraer til X-røntgen pulverbilleder, som kan bruges af andre programmer såsom Rietvelds forfiningsværktøjer (dvs. FullPorf), faseanalyse eller teksturanalyse.

Da PyFAI er et bibliotek, dets hovedformål er at være integreret i andre værktøjer såsom PyMca, LiMa eller EDNA. For at udføre dataanalyse på nettet skal den præcise beskrivelse af den eksperimentelle opsætning være kendt. Dette er årsagen til, at PyFAI inkluderer optimeringskode for geometri der arbejder på »powder rings« fra referenceprøver. Alternativt kan PyFAI også importere geometrier tilpasset med andre værktøjer såsom Fit2D.

PyFAI er blevet designet til at fungere med enhver slags detektor med enhver geometri (transmission, reflektion, off-axis ...). Den bruger Pythonbiblioteket FabIO til at læse de fleste billeder taget af diffractometer.

Denne pakke beregner FE-basisfunktioner og afledninger for de følgende elementer:

• Lagrange (interval, triangle, tetrahedron, prism, pyramid, quadrilateral, hexahedron)
• Nédélec (triangle, tetrahedron)
• Nédélec Second Kind (triangle, tetrahedron)
• Raviart-Thomas (triangle, tetrahedron)
• Regge (triangle, tetrahedron)
• Crouzeix-Raviart (triangle, tetrahedron)

Beregner quadrature-regler på forskellige celletyper

Tilbyder referencetopologi og geometri for referenceceller af hver type.

Pythonomslag tilbudt med pybind11.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

dmsh: "The worst mesh generator you'll ever use."

Inspired by distmesh, dmsh is slow, requires a lot of memory, and isn't terribly robust either.

On the plus side, it's got a usable interface, is pure Python (and hence easily installable on any system), and if it works, it produces pretty high-quality meshes.

Combined with optimesh, dmsh produces the highest-quality 2D meshes in the west.

Example capabilities:

• Primitives
• circle, rectangle, polygon
• halfspace
• Combinations
• difference
• nonconstant edge length
• union
• intersection
• Transformations
• rotation, translation, scaling
• Local refinement

DOLFIN er Python- og C++-grænsefladen for FEniCS-projektet for den automatiserede løsning for differentialligninger, der tilbyder et konsistent PSE (Problem Solving Environment) for løsning af ordinære og delvise differentialligninger. De vigtigste funktioner er en simpel, konsistent og intuitiv objektorienteret API; automatisk og effektiv evaluering af sæsonformer; automatisk og effektiv samling af lineære systemer; og understøttelse af generelle familier af finitte elementer.

Dette er den grundlæggende pakke, der afhænger af specifikke dolfin-kompileringer. Som standard bygges versionen mod den foretrukne version af PETSc i /usr/lib/petsc (med 32-bit indeksering, men den alternative version (64-bit PETSc) kan vælges ved at angive miljøvariablen PETSC_DIR.

Dette er den forældede version af DOLFIN, du kan eventuelt installere næste generation python3-dolfinx (DOLFIN-X) i stedet for.

DOLFIN er Python- og C++-grænsefladen for FEniCS-projektet for den automatiserede løsning for differentialligninger, der tilbyder et konsistent PSE (Problem Solving Environment) for løsning af ordinære og delvise differentialligninger. De vigtigste funktioner er en simpel, konsistent og intuitiv objektorienteret API; automatisk og effektiv evaluering af sæsonformer; automatisk og effektiv samling af lineære systemer; og understøttelse af generelle familier af finitte elementer.

Dette er næste generations version af libdolfinx-dev (DOLFIN-X). Den forældede version af DOLFIN tilbydes af python3-dolfin.

Dette er en grundlægende pakke, der afhænger af dolfinx-pakkerne med reelle eller komplekse tal-understøttelse. Som standard vælges versionen bygget mod den foretrukne version af PETSc i /usr/lib/petsc, men den alternative version kan vælges ved at angive miljøvariablen PETSC_DIR.

FEniCS Form Compiler FFC tilbyder moderne, automatisk og effektiv evaluering af generelle flerlineære former (variationsformuleringer) for FEnicS. FFC fungerer som formevalueringssystem for DOLFIN, men kan også bruges til at kompilere forme for andres systemer.

FFC fungerer som en kompiler for flerlineære forme ved at oprette kode (C eller C++) til at evaluere af en flerlineær form givet i matematisk notation. Denne nye fremgangsmåde til at forme evaluering gør det muligt at kombinere generelle forhold med effektivitet; formen kan gives i matematisk notation og den oprettede kode er lige så effektiv som håndoptimeret kode.

Denne pakke installerer next-generation FFC-X-biblioteket for Python 3.

Dette Pythonomslag er designet til tæt integration med PyOpenCL. Det består af et Cython-baseret omslag på lavt niveau med en grænseflade svarende til det underliggende C-bibliotek. Oven på dette tilbydes en grænseflade på højt niveau til arbejde på data indeholdt i instanser af pyopencl.array.Array, en numpy arbejdslignende tabelklasse for GPU-beregninger. Grænsefladen har fået lidt inspiration fra pyFFTW. For detaljer om grænsefladen se fft.py.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Pakken ltfatpy er en delvis Pythonport af Large Time/Frequency Analysis Toolbox (LTFAT), en MATLAB®/Octave-værktøjskasse for arbejde med tid-frekvens analyse og syntese.

Pakken bruges både til undervisning og beregning.

Pakken tilbyder en stort antal lineære transformeringer inklusive Gabor-transformeringer sammen med rutiner til at konstruere vinduer (filterprototyper) og rutiner for manipulering af koefficienter.

Denne pakke tilbyder modulerne for Python 3.

Beregn alle slags interessante punkter, områder og diskenheder i triangulære og tetraedriske mesher, med fokus på effektivitet. Nyttig i mange kontekster, f.eks. i beregningerne finite-element og finite-volume.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Når der oprettes mesh'er for FEM/FVM-beregninger, så er din geometri nogle gange så simpel, så du ikke skal bruge en kompleks mesh-opretter (som pygmsh, MeshPy, mshr, pygalmesh, dmsh), men noget simpelt og hurtigt, der gør brug af strukturen for domænet.

Eksempler: Triangle, Rectangle, Regular polygon, Disk, Möbius strip, Sphere (overflade), Ball (fast), Tube, Cube.

Denne pakke installerer modulet for Python 3.

Multiple-tau correlation is computed on a logarithmic scale (less data points are computed) and is thus much faster than conventional correlation on a linear scale such as numpy.correlate

An online reference is available at http://paulmueller.github.io/multipletau

Pythonic wrapper around FFTW, the speedy FFT library. The ultimate aim is to present a unified interface for all the possible transforms that FFTW can perform.

Both the complex DFT and the real DFT are supported, as well as arbitrary axes of abitrary shaped and strided arrays, which makes it almost feature equivalent to standard and real FFT functions of numpy.fft (indeed, it supports the clongdouble dtype which numpy.fft does not).

pyFFTW is BSD-licensed and should not be confused with python-fftw, a GPL-licensed python module with the same aim of providing python bindings to FFTW3. Or python3-gpyfft, which provides bindings to the OpenCL FFT library clFFT.

This package provides the Python 3 bindings.

pygalmesh makes it easy to create high-quality 3D volume and surface meshes.

CGAL offers two different approaches for mesh generation:

• Meshes defined implicitly by level sets of functions.
• Meshes defined by a set of bounding planes.

pygalmesh provides a front-end to the first approach, which has the following advantages and disadvantages:

• All boundary points are guaranteed to be in the level set within any specified residual. This results in smooth curved surfaces.
• Sharp intersections of subdomains (e.g., in unions or differences of sets) need to be specified manually (via feature edges, see below), which can be tedious.

On the other hand, the bounding-plane approach (realized by mshr), has the following properties:

• Smooth, curved domains are approximated by a set of bounding planes, resulting in more of less visible edges.
• Intersections of domains can be computed automatically, so domain unions etc. have sharp edges where they belong.

pygalmesh and mshr are therefore complementary.

pygalmesh also interfaces CGAL's 3D periodic mesh generation.

This package installs the pygalmesh module for Python 3.

It also provides the utility scripts pygalmesh-from-inr and pygalmesh-volume-from-surface for generating volume meshes from INR or surface meshes.

Denne pakke tilbyder Pythonbindingerne til NFFT-biblioteket, nyttig til udførelse af Fouriertranformeringer på ikke-ensartede samplede data med effektiv hastighed. Bindingerne blev oprettet via Cython og fjerner oprettelsen og kørslen af NFFT-planer via brug af klasser.

Denne pakke tilbyder Python 3-versionen af bindingerne.

PyODE er et sæt af Pythonbindinger for Open Dynamics Engine, en fysikmotor udviklet i åben kildekode. PyODE indeholder også en XODE-fortolker.

Denne pakke tilbyder PyODE for understøttede versioner af Python.

Quantities is designed to handle arithmetic and conversions of physical quantities, which have a magnitude, dimensionality specified by various units, and possibly an uncertainty. Quantities builds on the popular numpy library and is designed to work with numpy ufuncs, many of which are already supported.

Dette bibliotek beregner FFT'er i en eller flere dimensioner. Den er ekstremt hurtig. Denne pakke indeholder det statistiske lænkede bibliotek og hovedfilerne.

Trilinosprojektet er en indsats til at udvikle algoritmer og aktivere teknologier i en objektorienteret programramme til løsning af komplekse flerfysik ingeniør- og videnskabelige problemer i stor skala. En unik designfunktion hos Trilios er dets fokus på pakker.

Denne pakke afhænger af alle udviklingspakkerne for Trilinos.

Open Porous Media-programpakken (OPM) tilbyder biblioteker og værktøjer for modelopbygning og simulering af porøse medieprocesser, specielt simulering af CO2-sekvestrering og forbedret olieoptagelse.

Denne pakke indeholder det delte byggesystem for alle OPM-moduler, teksthoveder for data, fortolkning og resultatfiler i Eclipse-formatet, et format bredt anvendt i reservoir-simuleringsfællesskabet samt generiske redskaber brugt i andre OPM-moduler.

The Open Porous Media (OPM) software suite provides libraries and tools for modeling and simulation of porous media processes, especially for simulating CO2 sequestration and improved and enhanced oil recovery.

opm-grid provides implementations of grids for reservoir simulation, corner point or more general pillar grids, following the DUNE grid interface: CpGrid, a parallel corner point grid, and PolyhedralGrid a more general serial grid implementation of an unstructured, legacy, grid.

A standard grid type in the petroleum industry, corner-point grids fills the domain with a relatively low number of cells while still providing sufficient flexibility to model faults, fractures and erosion. The grid format was originally designed with an eye towards geological modeling rather than numerical simulation, but is still suitable for e.g. low order finite volume discretizations.

This package provides the development files for the grid implementations, i.e. the headers and shared library links.

Dette er en overgangspakke. Den kan fjernes igen.

Open Porous Media-programpakken (OPM) tilbyder biblioteker og værktøjer for modelopbygning og simulering af porøse medieprocesser, specielt simulering af CO2-sekvestrering og forbedret olieoptagelse.

Opm-simulators tilbyder en forskning (ebos) og en produktion (flow) med fuld implicit sort-olie simulatorer, der understøtter en til tre faser og understøtter solvent- og polymer-indstillinger. Bruger cellecentrerede finitte volumeskemaer med to punkts flux-tilpasning og automatisk differentiering for diskretisering og bruger en tilstand af arten lineær og ikkelineær løsere. Understøtter standard- og multisegment samt modeller og læsning og skrivning af fil i formatet Eclipse, et meget udbredt format i fællesskabet for oliereservoirsimulering.

Denne pakke tilbyder udviklingsfilerne (teksthoveder og delte bibliotekshenvisninger).

Open Porous Media-programpakken (OPM) tilbyder biblioteker og værktøjer for modelopbygning og simulering af porøse medieprocesser, specielt simulering af CO2-sekvestrering og forbedret olieoptagelse.

Opm-upscaling tilbyder værktøjer for enkle fase og relative permeabilitetsopskalering. Under opskalering beregnes effektive parametre (som porøsitet, permeabilitet og kapillartryk) til en simulering på en grovere skala ud fra egenskaber af en simulering i en fin skala.

Denne pakke tilbyder udviklingsfilerne (teksthoveder og delte bibliotekshenvisninger).

Programpakken Open Porous Media (OPM) tilbyder biblioteker og værktøjer til at modellere og simulere porøse medieprocesser, specielt for CO2-sekvestrering og forbedret olieindvinding.

Denne pakke indeholder Pythonomslag til at læse, fortolke og skrive filer i Eclipse-formatet, et format bredt anvendt i fællesskabet for reservoirsimulering.

Open Porous Media-programpakken (OPM) tilbyder biblioteker og værktøjer for modelopbygning og simulering af porøse medieprocesser, specielt simulering af CO2-sekvestrering og forbedret olieoptagelse.

Opm-simulators tilbyder en forskning (ebos) og en produktion (flow) med fuld implicit sort-olie simulatorer, der understøtter en til tre faser og understøtter solvent- og polymer-indstillinger. Bruger cellecentrerede finitte volumeskemaer med to punkts flux-tilpasning og automatisk differentiering for diskretisering og bruger en tilstand af arten lineær og ikkelineær løsere. Understøtter standard- og multisegment samt modeller og læsning og skrivning af fil i formatet Eclipse, et meget udbredt format i fællesskabet for oliereservoirsimulering.

Pakken tilbyder Pythonomslag for simulatorerne.

Triangle is a library/program for meshing 2-D surfaces and manifolds.

This package contains its static library, headers, and shared library symbolic link, which are needed to compile programs using the triangle library.