Debian Science Viewing packages

Ce programme fournit une interface graphique pour l'analyse scientifique de données de point de valeurs réelles (valeurs x, y, z). Il a pour cible principalement les applications de sondes atomiques tomographiques mais peut être utile à d'autres applications.

camv-rnd is a modular EDA (mainly PCB) CAM file format viewer that supports gerber, excellon and g-code. The GUI features zoom, pan and measurements on multiple layers from multiple files.

Ctioga2 est un programme de tracé dans l’esprit de gnuplot. Il peut être utilisé soit directement en ligne de commande, ou en écrivant un fichier de commandes (ou un mélange des deux). Il produit des fichiers PDF de qualité professionnelle. Il est basé sur la bibliothèque de tracé Tioga.

Ctioga2 est une complète réécriture de ctioga et est conçu pour le remplacer dans un avenir pas si lointain.

Il s’agit d’un frontal en ligne de commande, adaptable pour Gnuplot. Il crée des tracés à partir de données fournies sur l’entrée standard ou par un nom de fichier indiqué sur la ligne de commande. Différentes représentations des données sont prises en charge, ainsi que l’impression de la sortie ou l’affichage du flux de données en temps réel.

Fityk est un programme flexible et portable pour la régression non linéaire de fonctions analytiques (spécialement celles en forme de pic) pour des données (habituellement des données expérimentales) – en d’autres mots pour le tri et l’analyse non linéaire.

Il a été développé pour l’analyse de modèles de diffraction, mais peut être aussi utilisé dans d’autres domaines, car les opérations et les concepts particuliers à la cristallographie sont séparés du reste du programme.

Fityk propose diverses méthodes de régression non linéaire, détection d’arrière-plan, calibration de données, positionnement aisé des pics et modifications de leurs paramètres, automatisation des tâches courantes avec des scripts et bien d’autres choses encore. Le principal avantage de ce programme est sa souplesse – les paramètres des pics peuvent être de manière arbitraire reliés les uns aux autres, par exemple, la largeur d’un pic peut être une variable indépendante, la même que celle d’un autre pic ou peut être donnée par une formule compliquée commune à tous les pics.

Libjs-sphinxdoc est nécessaire pour les éléments en Javascript dans la documentation.

g3data est utilisé pour extraire des données de graphiques. Par exemple, des graphiques sont généralement publiés dans des journaux scientifiques sans les tables de données. g3data effectue la tâche d'extraire ces données facilement.

geg est un utilitaire très simple pour analyser et représenter graphiquement des fonctions 2D comme par exemple f(x) = 3 + sin(x), ou évidemment des fonctions bien plus complexes. Il est écrit avec Gtk+ et propose une interface utilisateur soignée et personnalisable.

Gerris est un système pour résoudre des équations différentielles partielles décrivant un écoulement de fluide.

GfsView affiche le résultat de simulations avec Gerris en 2D et 3D. Bref résumé de ses caractéristiques principales :

 — sections scalaires et vectorielles ;
 — isosurfaces ;
 — lignes de courant ;
 — fonctions personnalisées ;
 — affichage adaptatif rapide (en utilisant la représentation de données
   multi-résolution de Gerris) ;
 — « scriptabilité »;
 — génération autonome d’image ;
 — sorties de qualité PostScript, PDF et matricielle.

Giza is a lightweight scientific plotting library built on top of cairo that provides uniform output to multiple devices. Giza also provides a drop-in, modern replacement for the PGPLOT graphics library.

This package contains the development files.

GLE est un langage de script pour graphiques conçu pour la création de figures telles que tableaux, tracés, graphiques, et diagrammes d'un niveau de qualité digne de publication. Il prend en charge divers types de tableaux (y compris tracé de fonction, histogramme, graphique à barres, diagramme de dispersion, tracé de contours, carte couleur et tracé de surfaces) à l'aide d'une simple mais flexible ensemble de commandes de dessin. Des sorties plus complexes peuvent être créées en s'appuyant sur son langage de script, très complet avec ses sous-routines, variables et contrôle logique.

GLE s'appuie sur LaTeX pour les sorties texte et prend en charge les formules mathématiques dans les graphiques et tableaux. Les formats de sortie incluent (E)PS, PDF, JPEG et PNG.

Gmsh est un générateur de grille 3D d'éléments finis, muni d'un moteur de CAD intégré et d’un post-processeur. Il a été conçu pour fournir un outil de maillage, rapide léger et facile à utiliser avec des entrées paramétriques et des capacités avancées de visualisation. Gmsh est construit autour de quatre modules : géométrie, maillage, solveur et post-processeur. La spécification d'une donnée à ces modules est faite soit de manière interactive en utilisant l'interface utilisateur graphique, soit dans des fichiers texte en ASCII utilisant le langage de script propre à Gmsh.

Consultez le manuel de référence de Gmsh pour une vue d'ensemble plus complète des possibilités offertes par Gmsh.

GNU Data Language (GDL) est un compilateur incrémental libre compatible avec IDL (Interactive Data Language). Sa syntaxe est entièrement compatible avec IDL 7.1. IDL est une marque déposée d’ITT Visual Information Solutions. À partir de IDL 8.0, les éléments de langage suivants sont pris en charge :

 — boucle FOREACH ;
 — indices de tableau négatifs ;
 — ramasse-miettes pour les pointeurs et objets ;
 — méthodes d’appel sur des objets en utilisant « . » (par exemple,
   `object.aMemberProcedure,arg1`).

Le système d’entrée et sortie de fichiers est complètement implémenté. La prise en charge de l’interface graphique (composants graphiques) est officiellement fournie, mais pas encore finie.

Ce paquet fournit le frontal de l’interpréteur en ligne de commande.

Gnuplot est un utilitaire de tracé de données et de fonctions en ligne de commande qui prend en charge de nombreux formats de sortie, dont les pilotes pour de nombreuses imprimantes, (La)Tex, (x)fig, Postscript, etc. La version X11 est empaquetée dans gnuplot-x11.

Les fichiers de données et les fonctions définies par l'utilisateur peuvent être manipulés avec le langage interne de gnuplot (type langage C). Gnuplot peut effectuer des lissages, des régressions linéaires ou non linéaires (par splines notamment) et peut travailler avec les nombres complexes.

Ce métapaquet permet d’installer gnuplot avec toutes ses possibilités (-qt, -x11 ou -nox).

Grace est un outil de pointage-cliquage permettant à l’utilisateur de dessiner des graphiques X-Y. Il s’agit du programme précédemment connu comme Xmgr.

Quelques-unes de ses caractéristiques sont : mise à l’échelle définie par l’utilisateur, marques de graduation, étiquettes, symboles, styles de ligne, couleurs, régression polynomiale, cerces (spline), moyenne mobile, transformation de Fourier discrète et rapide, corrélation croisée ou automatique, traitement par lots pour un tracé automatique et prise en charge de l’impression pour PostScript, FrameMaker et plusieurs formats d’image.

Le dessin de graphes aborde le problème de la visualisation d'informations structurées par la construction de représentations géométriques de schémas abstraits et de réseaux. La génération automatique de graphes a d'importantes applications dans certaines technologies clés comme la conception de base de données, l'ingénierie logicielle, la conception VLSI et réseau ou encore les interfaces graphiques, dans d'autres domaines. Les situations dans lesquelles ces outils peuvent être particulièrement utiles sont :

- Vous voulez restructurer un programme, mais vous devez d'abord comprendre les relations entre types, procédures et fichiers source ; - Vous devez identifier les goulets d'étranglement dans une dorsale Internet - les liens individuels et leurs relations ; - Vous devez déboguer un protocole ou une micro-architecture représentée par une machine à états finis et vous avez besoin de comprendre comment certains états d'erreur se produisent ; - Vous voulez naviguer dans un schéma de base de données, une base de connaissances, ou un programme distribué représentés graphiquement ; - Vous voulez avoir une représentation graphique d'un ensemble de documents liés ; - Vous voulez découvrir des types et des centres d'intérêts communs dans une base de données d'appels téléphoniques ou de messages électroniques.

Ce paquet contient les outils en ligne de commande.

Gri est un langage libre pour la programmation de graphiques scientifiques. Il est piloté en ligne de commande, à l’opposé du pointer/cliquer. Certains utilisateurs considèrent que Gri est similaire à LaTeX puisque les deux sont extrêmement puissants, et récompensent le fait d’endurer une phase d'apprentissage. La sortie est conforme au standard PostScript professionnel et adaptée pour l'inclusion dans d'autres documents.

Gri peut générer des graphiques x-y, des tracés ou des images. Un contrôle fin est fourni sur tous les aspects du dessin, par exemple les largeurs de ligne, les couleurs, les fontes, etc. Les lettres grecques et les symboles mathématiques sont disponibles en utilisant une syntaxe qui ressemble à celle de TeX.

Ceux qui écrivent des scripts Gri de 1000 lignes commencent habituellement avec quelque chose d'aussi simple que :

 open file.dat       # ouverture d’un fichier
 read columns x * y  # lecture de 1ère colonne en tant que x et la 3ème en
                     # tant que y
 draw curve          # tracé des données et mise à l’échelle automatique
                     # des axes

Un manuel complet est disponible au format HTML (paquet gri-html-doc), au format PDF adéquat pour l'impression (paquet gri-pdf-doc) et sur le web en suivant les liens à la page d’accueil de Gri : http://gri.sourceforge.net/

Gwyddion est un programme modulaire pour la visualisation et l’analyse des données de microscopie à sonde locale (SPM – Scanning Probe Microscopy). Il est principalement conçu pour l’analyse des données du champ de hauteur obtenues par des techniques telles que (entre autres) :

 – le microscope à force atomique (AFM – Atomic Force Microscopy) ;
 – le microscope à force magnétique (MFM – Magnetic Force Microscopy) ;
 – le microscope à effet tunnel (STM – Scanning Tunneling Microscopy) ;
 – le microscope optique en champ proche (SNOM ou NSOM – Near-field
   Scanning Optical Microscopy).
Il peut aussi être utilisé pour n’importe quelle analyse de champ de

hauteur et d’image.

Ce paquet fournit l'application principale et ses modules. Il contient également un générateur d'aperçu pour GNOME (et Xfce) permettant de créer des aperçus pour tous les types de fichier pris en charge par Gwyddion.

IFRIT (Ionization FRont Interactive Tool, outil interactif pour front d’ionisation) tire ses origines (et donc son nom) d’un utilitaire spécialement conçu pour visualiser les fronts d’ionisation dans les simulations numériques cosmologiques. IFRIT a depuis outrepassé son but originel et peut maintenant visualiser des ensembles divers de données.

IFRIT est écrit en C++ et utilise deux boîtes à outils performantes : VTK (boîte à outils pour visualisation) et Qt (boîte à outils pour interface graphique).

Imview est une application qui :

• affiche un grand nombre de formats d'images ;
• affiche des images 2D ou 3D (en tranches) avec une fonctionalité de zoom ;
• fonctionne pour des documents multi-spectre, animés ou multi-pages (par exemple : images satellites, piles TIFF, GIFs animés et fichiers multi-composants hétérogènes) ;
• affiche tous les types de pixels (données entières ou en virgule flottante, codées sur 1 à 64 bits) ;
• permet d'afficher des profils 1D quelconques d'images 2D (ou des tranches 2D d'images 3D) ;
• supporte des cartes de couleurs quelconques pour tous types de pixels (i.e. : affichage en fausses couleurs) ;
• fournit les outils classiques de manipulation d'images (luminosité/contraste, correction gamma, zoom, retaillage, rotation, etc.) ;
• peut être contrôlé à distance à travers des sockets ou des commandes texte (ce qui permet de l'intégrer facilement dans différents systèmes d'analyse d'images) ;
• peut charger les images depuis une socket ou un espace de mémoire partagée ;
• et bien plus encore !

Kst est un outil de tracé et de visualisation, rapide et en temps réel, de grands ensembles de données. Il possède les fonctionnalités basiques d’analyse de données, beaucoup de fonctions internes puissantes et est extensible avec des greffons ou des extensions.

LabPlot fournit un moyen de créer, gérer et d’éditer des tracés de données. Il permet de produire des tracés à partir de données de feuille de calcul ou importées de fichiers externes. Les tracés peuvent être exportés dans plusieurs formats de graphismes matriciels ou vectoriels.

 .
Ses fonctionnalités incluent :
 – gestion des données par projet ;
 – explorateur de projet pour la gestion et l’organisation des objets créés
   dans différents dossiers ou sous-dossiers ;
 – feuille de calcul avec les fonctions de base pour la saisie manuelle des
   données ou pour la génération de nombres aléatoires uniformes ou non ;
 – importation de données ASCII externes dans le projet pour une édition et
   visualisation ultérieures ;
 – exportation de feuille de calcul dans un fichier ASCII ;
 – feuille de travail comme objet parent principal pour des tracés, des
   étiquettes, etc., prise en charge de différentes mises en page et de
   fonctions d’agrandissement ;
 – export de feuille de travail dans différents formats (PDF, EPS, PNG
   et SVG) ;
 – grande variété de possibilités d’édition des propriétés de feuille de
   travail et d’objet ;
 – tracés cartésiens créés soit à partir de données importées ou créées
   manuellement, soit à l’aide d’équations mathématiques ;
 – définition de formule mathématique gérée par coloration
   syntaxique et complétion, et par la liste, groupées par thème, de
   constantes et fonctions mathématiques et physiques ;
 – analyse des tracés prise en charge par de nombreuses fonctions de zoom
   et navigation ;
 – ajustements aux données linéaires ou non, plusieurs modèles
   d’ajustements prédéfinis et possibilité de modèles usuels avec un nombre
   arbitraire de paramètres.

This interface allows gnuplot to be controlled from C++ and is designed to be the lowest hanging fruit. In other words, if you know how gnuplot works it should only take 30 seconds to learn this library. Basically it is just an iostream pipe to gnuplot with some extra functions for pushing data arrays and getting mouse clicks. Data sources include STL containers (eg. vector or map) and one or two dimensional Blitz++ arrays (of scalars or TinyVectors). Support for other data sources should be easy to add.

Basically there are two functions defined: send() sends arrays of data values (it is overloaded to do the right thing based upon what type of variable you pass) and getMouse() gets the position of a mouse click. Everything else is accomplished by sending commands manually to gnuplot via the iostream interface.

libqglviewer (also known as libQGLViewer) is a free C++ library based on Qt that enables the quick creation of OpenGL 3D viewers. It features a powerful camera trackball and simple applications simply require an implementation of the draw() function. It is a tool of choice for OpenGL beginners and assignements. It provides screenshot saving, mouse manipulated frames, stereo display, interpolated keyFrames, object selection, and much more. It is fully customizable and easy to extend to create complex applications, with a possible Qt GUI.

This package contains the shared library needed to run programs using QGLViewer. This package contains QGLViewer linked with Qt version 4.

Lybniz est un traceur de fonction avec une interface graphique simple. Il peut actuellement tracer trois fonctions et permet de naviguer dans le tracé. Les fonctions sont entrées en notation Python ou de type C.

Il s’agit d’une bibliothèque, libre et multi-plateforme, de routines C++ rapides pour un tracé de données jusqu’en trois dimensions. Elle peut exporter les graphiques dans des fichiers matriciels ou vectoriels EPS, SVG ou IDTF. Ces routines sont de simples interfaces graphiques basées sur GLUT, FLTK ou Qt. MathGL peut être aussi utilisé en console. Il existe des interfaces pour quelques langages comme C, Fortran, Pascal, Forth, Python ou Octave.

Ce paquet fournit des utilitaires et des exemples de MathGL.

matlab2tikz est un script d’Octave pour convertir des figures d’Octave en figures natives de TikZ/Pgfplots pouvant être facilement incorporées dans des documents en LaTeX. Il gère la conversion de la plupart des figures d’Octave, y compris les tracés en 2D et 3D.

Ce paquet est aussi compatible avec le logiciel MATLAB (non libre).

MayaVi2 est un outil multiplateformes de visualisation de donnée scientifiques 2D et 3D. Ses fonctionnalités incluent :

• Visualisation de données scalaires, en vecteur et de tenseur en 2 et 3 dimensions
• Scriptabilité simple en Python
• Extensitivé simple via des sources personnalisée, des modules et des filtres de données
• lecture de divers formats de fichiers : VTK (de base et XML), PLOT3D, etc.
• Enregistrement des visualisations
• Enregistrement des visualisations affichées dans divers formats d'image.

MayaVi2 a été conçu pour être scriptable et extensible. Si vous pouvez utiliser l'application mayavi2 elle-même, vous pouvez l'utiliser comme greffon Envisage, ce qui vous permet de l'embarquer nativement dans des applications utilisateur. Vous pouvez aussi l'utiliser comme un moteur de

 visualisation pour une application.

Ce paquet fournit également TVTK, qui englobe des objets VTK pour offrir une API pratique et en Python, tout en supportant les attributs Traits et les palettes NumPy/SciPy. TVTK est en général implémenté en pur Python, sauf pour un petit module complémentaire.

Open3D is an open-source library that supports rapid development of software that deals with 3D data. The Open3D frontend exposes a set of carefully selected data structures and algorithms in both C++ and Python. The backend is highly optimized and is set up for parallelization.

This package provides the stand-alone viewer for data visualization.

Open3D is an open-source library that supports rapid development of software that deals with 3D data. The Open3D frontend exposes a set of carefully selected data structures and algorithms in both C++ and Python. The backend is highly optimized and is set up for parallelization.

This package provides additional tools for data processing.

OVITO is a visualization and analysis software for atomistic simulation data. Being a single integrated application it covers both the analysis and the visualization of large-scale atomistic datasets produced by molecular dynamics/statics and Monte-Carlo simulation codes. Its name is an acronym for Open Visualization Tool, emphasizing that the software has been designed with flexibility and extensibility in mind.

ParaView est une application multi-plateforme au code source ouvert conçue pour visualiser des ensembles de données allant du plus petit au plus grand. Les buts du projet ParaView incluent les éléments suivants :

 – développer une application de visualisation, multi-plateforme et au code
   source ouvert ;
 – prendre en charge les modèles de calcul distribué pour traiter de grands
   ensembles de données ;
 – créer une interface pour l’utilisateur libre, adaptable et intuitive ;
 – développer une architecture extensible basée sur les normes ouvertes.

ParaView s’exécute aussi bien sur des systèmes distribués avec partage de mémoire que sur des systèmes avec processeur unique, et a été testé avec succès sur Windows, Mac OS X, Linux et sur diverses stations de travail Unix, des grappes et des supercalculateurs. Sous le capot, ParaView utilise la boîte à outils de visualisation « Visualization Toolkit » pour le traitement des données et le moteur de rendu et possède une interface écrite en Qt.

PDL (Perl Data Language — « langage de données Perl ») donne au Perl standard la possibilité de stocker d'une manière COMPACTE et de manipuler RAPIDEMENT des grands tableaux de données à N dimensions qui sont les bases du calcul scientifique. L'idée est de faire de Perl un langage de calcul numérique, libre, orienté sur les tableaux de la même manière que les paquets commerciaux comme IDL et MatLab. Il est possible d'écrire des expressions en Perl simples pour manipuler des tableaux numériques complets en une fois. Par exemple, en utilisant PDL, la variable de Perl $a peut contenir une image 1024x1024 en virgule flottante, en ne prenant que 4 Mo de mémoire et des expressions comme $a=sqrt($a)+2 manipulent l'image en quelques secondes.

Un interpréteur de commandes interactif simple (perldl) est fourni pour une utilisation en ligne de commande ainsi qu'un module (PDL) pour l'utilisation dans les scripts en Perl.

PlotDrop est conçu pour la visualisation simple et rapide de séries de données 2D. Il est destiné à être utilisé en tandem avec un explorateur de fichiers externe comme Nautilus de GNOME ou Konqueror de KDE. Les fichiers contenant des données sont ajoutés à la liste de fichiers en les glissant depuis l'explorateur.

Gnuplot.py est un module Python qui s'interface avec Gnuplot, le programme de tracé de courbes populaire. Il vous permet d'utiliser gnuplot depuis Python sur des tableaux de données situés en mémoire, des fichiers de données ou des fonctions mathématiques. Si vous utilisez Python pour effectuer des calculs ou comme « colle » pour les programmes numériques, vous pouvez utiliser ce module pour dessiner des données au fur et à mesure de leur calcul. Et la combinaison avec Python rend facile l'automatisation des choses, y compris la création « d'animations » brutes en dessinant les différents jeux de données les uns après les autres.

The guiqwt Python library provides efficient 2D data-plotting features (curve/image visualization and related tools) for signal/image processing application development and interactive computing. It's based on the scientific modules NumPy and SciPy, and the PyQwt plotting widgets for PyQt4 graphical user interfaces.

This is the Python 3 version of the package.

PyQtGraph is a pure-python graphics and GUI library built on PyQt4 and numpy. It is intended for use in mathematics / scientific / engineering applications. Despite being written entirely in Python, the library is very fast due to its heavy leverage of numpy for number crunching and Qt's GraphicsView framework for fast display.

This is the Python 3 version of the package.

Seaborn is a library for making attractive and informative statistical graphics in Python. It is built on top of matplotlib and tightly integrated with the PyData stack, including support for numpy and pandas data structures and statistical routines from scipy and statsmodels.

Some of the features that seaborn offers are

• Several built-in themes that improve on the default matplotlib aesthetics
• Tools for choosing color palettes to make beautiful plots that reveal patterns in your data
• Functions for visualizing univariate and bivariate distributions or for comparing them between subsets of data
• Tools that fit and visualize linear regression models for different kinds of independent and dependent variables
• A function to plot statistical timeseries data with flexible estimation and representation of uncertainty around the estimate
• High-level abstractions for structuring grids of plots that let you easily build complex visualizations

This is the Python 3 version of the package.

Pyxplot est un paquet contenant un outil polyvalent de traçage de graphes, un langage de script pour scientifique, une suite pour graphisme vectoriel et un traitement de données. L’interface est conçue pour que les tâches courantes – par exemple, le traçage de graphes étiquetés de données – soient réalisables à l’aide de commandes courtes, simples et intuitives.

Pyxplot produit des figures de qualité professionnelle. À cette fin, les textes sont créés avec toute la beauté et flexibilité de l’environnement de composition LaTex.

Une documentation complète et des exemples sont disponibles dans le paquet pyxplot-doc. Une galerie d’exemples de traçage est disponible sur le site web du projet.

Qtiplot est un grapheur complet similaire à Origin d'OriginLab (plus d'informations à propos d'Origin sur http://www.originlab.com).

Il peut tracer des données en deux et trois dimensions en qualité publication, aussi bien à partir de jeux de données que de fonctions. Il peut faire de la régression non linéaire et du multi-pic.

Quelques fonctionnalités :

 –⋅multi-plateforme⋅: fonctionne nativement sur les systèmes Windows, Mac
OS⋅X et Linux/Unix⋅;
 –⋅compatibilité complète aux scripts Python⋅;
 –⋅graphes 3D basés sur OpenGL⋅;
 –⋅graphes en qualité publication et export aisé dans divers formats
d'image (EMF, EPS, PS, PDF, SVG, BMP, JPG, PNG, TIFF, etc.)⋅;
 –⋅intégration facile au système de composition LaTeX⋅;
 –⋅feuilles de calculs puissantes et souples avec calculs avec une logique
en colonnes et import et export de fichiers multiples⋅;
 –⋅accès en un clic à des routines variées d'analyses de données internes⋅;
 –⋅analyses statistiques avancées⋅: test de Student, analyse de la
variance, test de variance du χ², test de normalité (Shapiro-Wilk)⋅;
 –⋅régressions en courbe linéaires ou non linéaires avec pondération et
estimation des erreurs statistiques des paramètres de régressions⋅;
 –⋅régression multi-pic⋅;
 –⋅outils d'analyse d'image⋅;
 –⋅prise en charge de modèles⋅: tous les réglages pour les graphes, les
tables et les matrices peuvent être sauvegardés et restaurés ultérieurement

dans un processus d'édition rapide⋅;

 –⋅fichiers de projets fondées sur les répertoires, un explorateur de
projets puissant avec des fonctionnalités internes de glisser/déposer et

outils de recherche⋅;

 –⋅importation complète de classeurs Excel et de tableurs au format Open
Document, de bases de données dBase, SQLite et Access Microsoft.

Collection of plotting and table output functions for data visualization. Results of various statistical analyses (that are commonly used in social sciences) can be visualized using this package, including simple and cross tabulated frequencies, histograms, box plots, (generalized) linear models, mixed effects models, principal component analysis and correlation matrices, cluster analyses, scatter plots, stacked scales, effects plots of regression models (including interaction terms) and much more. This package supports labelled data.

RLPlot est un programme graphique pour afficher des données scientifiques dans des formats standards. Il possède une prise en charge complète pour tous les types error-bar et possède une plus grande flexibilité que gnuplot pour afficher des couleurs et des textures dans des tableaux (des graphiques à barres pleines sont possibles sans programmes supplémentaires). La sortie est générée sur l'affichage X où des changements supplémentaires peuvent être apportés au graphique en utilisant la souris. Les images peuvent être exportées aux formats SVG, mais également EPS, WMF et TIFF.

SciDAVis is a free interactive application aimed at data analysis and publication-quality plotting. It combines a shallow learning curve and an intuitive, easy-to-use graphical user interface with powerful features such as scriptability and extensibility.

SciDAVis is similar in its field of application to proprietary Windows applications like Origin and SigmaPlot as well as free applications like QtiPlot, Labplot and Gnuplot.

What sets SciDAVis apart from the above is its emphasis on providing a friendly and open environment for new and experienced users alike.

SolveSpace est un programme de CAO paramétrique pour la 2D et 3D. Applications incluses :

 – modélisation en 3D : dessin avec des opérations d’extrusion, de
   révolution et booléennes (union, différence ou intersection) ;
 – modélisation en 2D : dessin de pièces en vue simple et exportation en
   DXF, PDF ou SVG, utilisation de l’assemblage en 3D pour vérifier la
   concordance ;
 – impression en 3D : exportation du STL ou autre maillage triangulaire
   attendu par la plupart des imprimantes en 3D ;
 – préparation des données CAM : exportation du dessin vectoriel en 2D pour
   un découpage au jet d’eau ou par laser, ou génération de STEP ou STL
   pour importation dans un logiciel CAM tiers pour usinage ;
 – conception de mécanisme : utilisation du solveur de contraintes pour
   simuler les couplages planaires ou spatiaux avec des tourillons, des
   billes ou des articulations en glissière ;
 – géométrie en deux ou trois dimensions : remplacement de la trigonométrie
   et des feuilles de calcul à la main avec le dessin aux dimensions en
   direct.

Trend est un graphe de tendance, efficace et d’usage général, pour des données « live ». Les données sont lues sous forme ASCII à partir d’un fichier ou continûment à partir d’une file d’attente (FIFO), et affichées en temps réel en une tendance multi-passe (comme un écran d’oscilloscope). Trend peut être utilisé comme outil rapide d’analyse pour des séries de données progressives ou fonction du temps, de concert avec une écriture de script triviale.

Tulip est un environnement applicatif pour la représentation d’informations, dédié à l’analyse et la représentation de données relationnelles. Son but est de fournir au développeur une bibliothèque complète, intégrant la conception d’applications de représentation d’informations interactives pour les données relationnelles, qui peut être adaptée aux problèmes traités.

Les caractéristiques suivantes sont incluses :

 – représentations 3D ;
 – modifications 3D ;
 – prise en charge de greffons pour une évolution facile ;
 – constructions de grappes (clusters) et internavigation ;
 – dessin automatique des graphiques ;
 – utilisation automatique de grappe pour les graphiques ;
 – sélection automatique des éléments ;
 – réglage automatique de la couleur des graphiques.

Il s’agit d’une bibliothèque, libre et multi-plateforme, de routines C++ rapides pour un tracé de données jusqu’en trois dimensions. Elle peut exporter les graphiques dans des fichiers matriciels ou vectoriels EPS, SVG ou IDTF. Ces routines sont de simples interfaces graphiques basées sur GLUT, FLTK ou Qt. MathGL peut être aussi utilisé en console. Il existe des interfaces pour quelques langages comme C, Fortran, Pascal, Forth, Python ou Octave.

Ce paquet fournit l’environnement graphique basée sur mathgl.

Veusz est un paquet de préparation et de dessin scientifique 2D et 3D, conçu pour produire des fichiers PDF, des SVG, des Postscript et bitmap prêts à être publiés. Veusz fournit une interface graphique, en ligne de commandes et pour scripter (sur une base sur Python) avec ses fonctions de préparation. Les éléments sont construits en utilisant un système objet pour offrir une interface cohérente.

Ce paquet inclut l'exécutable principal, la documentation et les exemples.

VisTrails est un système, à source ouvert, de gestion de provenance et de flux de travail scientifique développé à l’université d’Utah, fournissant une prise en charge de l’exploration et de la visualisation de données. Tandis que les flux de travail ont été traditionnellement utilisés pour automatiser les tâches répétitives, pour les applications exploratoires par nature, telles les simulations, l’analyse de données et leur visualisation, il y a peu de répétitions – le changement est la norme. De la manière dont un ingénieur ou un scientifique font et évaluent des hypothèses sur des données d’étude, une série de différents, quoique liés, flux de travail est créée pendant l’ajustement d’un flux lors d’un processus interactif. VisTrails a été conçu pour gérer ces flux évoluant rapidement.

Yorick est un langage de programmation interprété pour :

• les simulations scientifiques et les calculs ;
• le post-traitement ou le guidage de grands codes de simulation ;
• les graphiques scientifiques interactifs ;
• la lecture, l'écriture et la traduction de grands fichiers de nombres.

Le langage fournit une syntaxe compacte pour plusieurs opérations habituelles sur les tableaux et donc travaille rapidement et efficacement sur de grands tableaux de nombres. Le code yorick ressemble superficiellement à du C mais les variables de yorick ne sont jamais explicitement déclarées et elles ont un champ dynamique similaire aux dialectes Lisp. Le langage yorick est conçu pour être saisi interactivement au clavier, ainsi que pour être stocké dans des fichiers pour une utilisation ultérieure.

Ce paquet inclut un environnement de développement basé sur emacs, que vous pouvez lancer en saisissant M-x yorick dans emacs.

De nombreux modules et greffons sont disponibles pour Yorick (paquets yorick-*). Le méta-paquet yorick-full dépend de la majorité d'entre-eux.

Circos affiche les données dans un graphe circulaire, de manière idéale pour étudier les relations entre objets ou positions et créer des graphiques hautement informatifs et de qualité publiable.

Ce paquet fournit le moteur de dessin de graphiques Circos qui se pilote à la ligne de commande (comme gnuplot) et est entièrement scriptable.

Circos affiche les données dans un graphe circulaire, de manière idéale pour étudier les relations entre objets ou positions et créer des graphiques hautement instructifs et dignes de publication.

Ce paquet fournit un ensemble d’outils permettant de traiter des données : binlinks, bundlelinks, categoryviewer, colorinterpolate, filterlinks, maketutorialimages, orderchr, randomlinks, resample et tableviewer.

Findimagedupes est un utilitaire en ligne de commande réalisant un « diff » visuel grossier entre deux images. Cela permet de comparer deux images ou un arbre complet d’images, et déterminer s’il existe des images identiques ou similaires. Avec des types d’images ordinaires, la précision de findimagedupes serait autour de 98 %.

JEuclid is a complete MathML rendering solution, consisting of:

• A MathViewer application
• Command line converters from MathML to other formats
• An ant task for automated conversion
• Display components for AWT and Swing
• A component for Apache Cocoon

This package contains the Swing MathViewer application.

Coin is an OpenGL-based, retain-mode 3D graphics library that implements the Open Inventor 2.1 API. It also includes support for VRML97 and 3D audio.

Grits is a "Virtual Globe" library which uses OpenGL to render an image of the earth using satellite and terrain data from publicly accessible servers. This is similar in concept to Google Earth and NASA World Wind, except implemented as a library.

This package contains the header files and libraries which are needed for developing programs that use grits.

GtkMathView is a C++ rendering engine for MathML documents. It provides an interactive view that can be used for browsing and editing MathML markup.

GtkMathView reads MathML documents by means of a frontend whose purpose is to traverse the MathML document (or part of it) and to appropriately instantiate GtkMathView's internal data structures that are suitable for rendering it. Currently the following frontends are supported: libxml2 (tree view using libxml2 API), libxml2 reader (event view using libxml2 reader API), GMetaDOM (tree view using DOM API), custom (application-specific view with application-provided callbacks).

GtkMathView renders MathML documents through a backend whose purpose is to provide an interface between the portable rendering engine and the platform-specific capabilities (like retrieving fonts, drawing on the screen, and so on). Currently the following backends are provided: GTK+, GTK+ widget, PostScript, SVG, AbiWord.

This package includes utilities to view and render MathML documents.

La bibliothèque GTS est prévue pour fournir un ensemble de fonctions utiles pour traiter des surfaces en 3D maillées avec des triangles interconnectés.

Ce paquet fournit des binaires d’utilitaires.

La bibliothèque Puzzle est conçue pour trouver rapidement des images visuellement similaires (GIF, PNG, JPG), même si elles ont été redimensionnées, recompressées, recolorisées ou modifiées légèrement.

Ce paquet fournit l’outil en ligne de commande : puzzle-diff.

libqglviewer (also known as libQGLViewer) is a free C++ library based on Qt that enables the quick creation of OpenGL 3D viewers. It features a powerful camera trackball and simple applications simply require an implementation of the draw() function. It is a tool of choice for OpenGL beginners and assignements. It provides screenshot saving, mouse manipulated frames, stereo display, interpolated keyFrames, object selection, and much more. It is fully customizable and easy to extend to create complex applications, with a possible Qt GUI.

This package contains the files needed to develop and compile programs using QGLViewer linked with Qt version 4.

SoQt is a Qt GUI component toolkit library for Coin, based on the API of the InventorXt GUI component toolkit. SoQt is also compatible with OpenInventor of SGI and TGS.

SoQt provides a class-hierarchy of viewer classes that ranges from a simple render canvas (the SoQtRenderArea), providing only the basic synchronization and device input conversion routines between Qt and Coin, up to 3 different full-featured viewer classes (SoQtExaminerViewer, SoQtPlaneViewer and SoQtFlyViewer) with input device handling logic and user interfaces to let the application programmer do Rapid Application Development.

This library is linked against Qt version 5.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the VTK header files required to compile C++ programs that use VTK to do 3D visualisation.

The Visualization Toolkit (VTK) is an object oriented, high level library that allows one to easily write C++ programs, Tcl, Python and Java scripts that do 3D visualization.

This package provides the VTK Java language support.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the VTK header files required to compile C++ programs that use VTK to do 3D visualisation. Qt files

Ce métapaquet installera les paquets Debian qui peuvent être utiles dans le cadre du traitement et de la visualisation d'images médicales.

D’une part, il installe plusieurs paquets prenant en charge divers formats de fichier d’image, comme DICOM (« Digital Imaging and Communications in Medecine ») qui est le standard de facto pour la gestion d'images médicales, ou NIFTI. D’autre part, il fournit divers paquets logiciels pouvant être utilisés pour la visualisation et le traitement d’images, soit à partir d’une interface graphique, de la ligne de commande ou implantées dans un flux de travail.

Matplotlib est une bibliothèque de traçage en Python pur conçue pour apporter à Python des capacités de traçage d'une qualité adaptée à la publication, avec une syntaxe familière aux utilisateurs de Matlab. L'accès à toutes les commandes de traçage, dans l'interface pylab, est possible soit à travers une interface fonctionnelle familière aux utilisateurs de Matlab, soit à travers une interface orientée objet familière à ceux de Python.

Ce paquet fournit la version Python⋅3 de matplotlib.

Pivy is a Coin binding for Python. Coin is a high-level 3D graphics library with a C++ API. Coin uses scene-graph data structures to render real-time graphics suitable for mostly all kinds of scientific and engineering visualization applications. Pivy allows:

• Development of Coin applications and extensions in Python
• Interactive modification of Coin programs from within the Python interpreter at runtime
• Incorporation of Scripting Nodes into the scene graph which are capable of executing Python code and callbacks
• Use of Coin within PyQt4 applications with the quarter module

This package contains the Python 3 bindings.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the python3 bindings for VTK.

This GNU R package provided a set of functions for drawing some special plots:

• stem.leaf plots a stem and leaf plot,
• stem.leaf.backback plots back-to-back versions of stem and leafs,
• bagplot plots a bagplot,
• skyline.hist plots several histgramm in one plot of a one dimensional data set,
• plotsummary plots a graphical summary of a data set with one or more variables,
• plothulls plots sequentially hulls of a bivariate data set,
• faces plots chernoff faces,
• spin3R for an inspection of a 3-dim point cloud,
• slider functions for interactive graphics.

Carries out mapping between assorted color spaces including RGB, HSV, HLS, CIEXYZ, CIELUV, HCL (polar CIELUV), CIELAB and polar CIELAB. Qualitative, sequential, and diverging color palettes based on HCL colors are provided.

ggplot2 combines the advantages of both base and lattice graphics. Conditioning and shared axes are handled automatically, and you can still build up a plot step by step from multiple data sources. It also implements a sophisticated multidimensional conditioning system and a consistent interface to map data to aesthetic attributes.

This system extends Wilkinsons optimization-based labeling approach to create a more robust, full-featured axis labeler.

Ce paquet R fournit de nombreux tracés, ainsi que diverses étiquettes, axes et fonctions d'échelle de couleur.

arctext : affiche un texte sur un arc circulaire ; barhier : affiche un jeu de variables associées hiérarchiquement ; barp : une routine de traçage en barre ; bin.wind.records : classe les enregistrements de direction et de vitesse de vent ; centipede.plot : affiche un traçé de millième ; clock24.plot : valeurs de point sur une horloge (« clockface ») de 24 heures ; color.legend : légende qui fait correspondre des catégories ou valeurs à des couleurs.; dotplot.mtb : traçé point par point dans le style de Minitab ; gantt.chart : affiche un diagramme de Gantt ; intersectDiagram : affiche des séries d'intersections ; multhist : traçe un histogramme multiple dans un diagramme en barre ; polar.plot : traçe des valeurs sur une grille circulaire de 0 à 360 degrés ; vectorField : affiche les vecteurs de magnitude ou direction ; weighted.hist : affiche un histogramme pondéré.

et bien d'autre encore. Pour en savoir plus, veuillez consulter la page http://cran.r-project.org/web/packages/plotrix/plotrix.pdf

qqman is an add-on package for the R statistical environment. This package provides functions for visualizing Genome-Wide Association Studies (GWAS) results using Manhattan plots and Quantile-Quantile plots.

Graphical scales map data to aesthetics, and provide methods for automatically determining breaks and labels for axes and legends.

Scatterplot3d est un paquet de GNU R pour la visualisation de données à plusieurs variables dans un espace tridimensionnel. À la base, scatterplot3d génère un tracé de nuage de points dans l’espace en 3D en utilisant une projection parallèle. De plus hautes dimensions (quatre, cinq, etc.) peuvent être affichées dans une certaine mesure en utilisant des couleurs, des types de symbole ou des tailles de symboles différents.

This GNU R package provides functions for plotting graphical shapes such as ellipses, circles, cylinders, arrows, ...