Debian Science Data acquisition packages

csvkit is a suite of command-line tools for converting to and working with CSV, the king of tabular file formats.

It is inspired by pdftk, gdal and the original csvcut tool by Joe Germuska and Aaron Bycoffe.

If you need to do more complex data analysis than csvkit can handle, use agate.

This package provides the command-line tools.

Engauge Digitizer ist ein Werkzeug, das beim Extrahieren von Zahlen aus Diagrammen unterstützt. Vom Konzept her ist es das Gegenteil eines Visualisierungsprogramms, das Grafiken aus Daten erzeugt. Es bietet Unterstützung beim Verbessern der Bildqualität und beim Erfassen der Koordinaten. Engauge Digitizer wird von Studenten und Forschern ebenso wie von großen Unternehmen und Behörden eingesetzt. Es kann einzelne Dateien, aber auch Datenbanken mit tausenden von Bilddateien verarbeiten.

Merkmale sind u.a.:

* Automatisches Entfernen von Gitternetzlinien
* Automatischer Abgleich von Punkten und Achsen
* Folgt Kurven automatisch
* Bildbearbeitung trennt wichtige Details vom Hintergrund der Grafik
* Ein Assistent hilft beim Erlernen der ersten Schritte
* Im Expertenmodus können auch mehrere Koordinatensysteme in einem Bild    digitalisiert werden
* Kubische Spline-Interpolation ermöglicht genauere Kurven aus weniger Datenpunkten
* Verarbeitet cartesische, polare, lineare und logarithmische Diagramme
* Unterstützt drag-and-drop und copy-and-paste
* Kontextabhängige Hilfe, Nutzerhandbuch und Tutorials erklären alle Leistungsmerkmale
* Vorschaufenster für unmittelbare Rückmeldung während der Modifikation von Einstellungen
* Automatisierte Linien- und Punkterkennung für schnelles Digitalisieren.

g3data wird zum Extrahieren von Daten aus Graphen benutzt. Graphen werden typischerweise in wissenschaftlichen Journalen ohne Tabellen mit den aktuellen Werten publiziert; g3data erleichtert den Prozess zum Extrahieren dieser Daten.

The hkl library is a framework for diffraction computation and diffractometer control, heavily used at the SOLEIL synchrotron. It supports various types of diffractometer geometry: Eulerian 4-circle, Eulerian 6-circle, kappa 4-circle, kappa 6-circle, and z-axis geometry. For each of these it provides several numerically computed modes, such as bisector and constant psi.

This package provides a gui on top of the hkl library.

Jaaa (JACK and ALSA Audio Analyser) ist ein Tongenerator und Spektrumanalysator, der für präzise Messungen entworfen wurde.

Jaaa erlaubt es einen der vier Eingänge zu wählen, und mit »Min« und »Max« die niedrigste und die höchste Frequenz anzuzeigen. Es können bis zu zwei Marker genutzt werden, um die genauen Werte im Display abzulesen..

libfreenect ist eine plattformübergreifende Schnittstellenbibliothek für die Kinect-Hardware. Mit libfreenect können sie die Hardware initialisieren und aktivieren sowie Daten kommunizieren. Derzeit unterstützt die Bibliothek den Zugriff auf RGB- und »depth«-Videostreams, Motoren, Beschleunigungsmesser und LEDs. Darüber hinaus stellt sie einige Sprachanbindungen bereit (C++, Python, …).

Diese Bibliothek ist die vom Projekt OpenKinect entwickelte systemnahe Komponente. Das Projekt ist eine offene Gemeinschaft von Menschen, die sich für die Nutzung der Xbox-Kinect-Hardware mit PCs und anderen Geräten interessieren.

Dies ist das Entwicklungspaket. Es enthält die Bibliotheken und Header für Softwareentwicklung mit libfreenect.

The GetData Project is the reference implementation of the Dirfile Standards, a filesystem-based, column-oriented database format for time-ordered binary data. The Dirfile database format is designed to provide a fast, simple format for storing and reading data.

This package contains the "checkdirfile" and "dirfile2ascii" tools.

lxi-tools is collection of open source software tools that enables control of LXI-compatible instruments such as modern oscilloscopes, power supplies, spectrum analyzers etc.

Dieses Paket enthält die Programme ncdump und ncgen, die NetCDF-Dateien in ASCII und zurück konvertieren können. NetCDF (network Common Data Form) ist eine Schnittstelle für den Zugriff auf wissenschaftliche Daten und eine frei verfügbare Softwarebibliothek, welche eine Implementierung dieses Interfaces bietet. Die netCDF-Bibliothek definiert auch ein maschinenunabhängiges Format zur Repräsentation von wissenschaftlichen Daten. Die Schnittstelle, die Bibliothek und das Format unterstützen zusammen die Erzeugung, den Zugriff und die Verteilung von wissenschaftlichen Daten.

This package is a transitional dummy package and can be safely removed.

Open3D is an open-source library that supports rapid development of software that deals with 3D data. The Open3D frontend exposes a set of carefully selected data structures and algorithms in both C++ and Python. The backend is highly optimized and is set up for parallelization.

This package provides additional tools for data processing.

The VISA standard provides a common interface for communication with test and measurement equipment.

This package provides Python 3 bindings for VISA.

Sardana is a Supervision, Control And Data Acquisition (SCADA) system for scientific installations. It is written in Python and based on the TANGO library. The hardware control and data acquisition routines can be accessed via an IPython console and a generic graphical user interface (both of which are easily extensible by the user).

segyio is a fast and practical library for reading and writing seismic data in SEG-Y format. segyio is random access oriented for modern computers with simple read/write primitives on lines.

This package contains useful shell programs.

Vnlog is a trivially-simple log format consisting of an ASCII table with comments and labelled fields. This package provides tools to process and manipulate such logs. The tools are:

vnl-filter selects a subset of the rows/columns in a vnlog and/or to manipulates the contents. This is effectively an awk wrapper.

vnl-sort, vnl-uniq, vnl-join, vnl-tail and vnl-ts are wrappers around the corresponding commandline tools

vnl-align aligns vnlog columns for easy interpretation by humans

vnl-make-matrix converts a one-point-per-line vnlog to a matrix of data

xlsx files are zip archives where spreadsheet data is stored. In order to process a file, various bits inside the archive need to be located. This utility uses the Expat SAX parser to collect the strings into a simple dictionary, keyed by their relative position in the XML file. This makes it possible to process files of any size.

xyscan is a tool for the scientist in the need to extract data points, i.e. numeric values, from a plot. It allows you to scan the plots and extract data points including the size of the error bars (both in x and y). It can handle plots with linear and logarithmic scales. In fact xyscan can be used for extracting numeric values from any kind of 2D technical drawings.

BINoculars is a tool for data reduction and analysis of large sets of surface diffraction data that have been acquired with a two-dimensional X-ray detector. The intensity of each pixel of a two-dimensional detector is projected onto a three-dimensional grid in reciprocal-lattice coordinates using a binning algorithm. This allows for fast acquisition and processing of high-resolution data sets and results in a significant reduction of the size of the data set. The subsequent analysis then proceeds in reciprocal space. It has evolved from the specific needs of the ID03 beamline at the ESRF, but it has a modular design and can be easily adjusted and extended to work with data from other beamlines or from other measurement techniques.

GNU Data Language (GDL) is a free IDL (Interactive Data Language) compatible incremental compiler. It has full syntax compatibility with IDL 7.1. IDL is a registered trademark of ITT Visual Information Solutions. From IDL 8.0, the following language elements are supported:

• FOREACH loop
• negative array indices
• garbage collection pointers and objects
• call methods on an object using "." (e. g. object.aMemberProcedure,arg1)

The file input output system is fully implemented. GUI support (widgets) is officially provided, but it's not complete yet.

This package contains the main commandline and interpreter frontend.

Der Service-Daemon gpsd kann ein oder mehrere an einen Computer angeschlossene GPS-Geräte überwachen. Er stellt dabei alle Daten über Ort und Bewegungen der Sensoren für die Abfrage auf TCP-Port 2947 zur Verfügung.

Mit gpsd können mehrere GPS-Clientprogramme gemeinsam ohne Datenverlust auf Geräte zugreifen. Außerdem antwortet gpsd auf Abfragen in einem Format, das wesentlich einfacher auszuwerten ist als die verschiedenen von GPS-Geräten verwendeten Standards.

Dieses Paket umfasst auch die gängigen Werkzeuge ubxtool und gpsctl für die Gerätekonfiguration der lokalen Hardware sowie ntpshmmon zum Überprüfen der generierten Referenzoszillator-Daten.

This is a transitional package to ease upgrades to the python3-tango package. It can be safely removed.

It is simple to use in simple cases, but also supports complex pipelines that involve branching, joining, flow control, feedback, back pressure, and so on. Optionally, Streamz can also work with both Pandas and cuDF dataframes, to provide sensible streaming operations on continuous tabular data.

Taurus is a Python framework for control and data acquisition CLIs and GUIs in scientific/industrial environments. It supports multiple control systems or data sources: Tango, EPICS, ... New control system libraries can be integrated through plugins.

This is the Python 3 version of the package.

rt-tests contains a set of programs that test and measure various components of real-time kernel behavior, such as timer latency, signal latency and the functioning of priority-inheritance mutexes. Additionally it contains hackbench, a program to generate work for the scheduler.

TANGO ist ein objektorientiertes, verteiltes Steuerungssystem. Es ermöglicht die Kommunikation zwischen TANGO-Geräteprozessen, die auf demselben Computer laufen oder über das Netzwerk verteilt sind. Diese Prozesse können dem Steuerungssystem überall im Netzwerk Dienste wie Hardwaresteuerung oder Datenverarbeitung bereitstellen.

Dieses Paket stellt einen TANGO-Zugriffskontrollserver bereit. Es kann verwendet werden, um die Benutzer und IP-Adressen zu verwalten, die für den Zugriff auf TANGO-Geräte zugelassen sind.

TANGO ist ein objektorientiertes, verteiltes Steuerungssystem. Es ermöglicht die Kommunikation zwischen TANGO-Geräteprozessen, die auf demselben Computer laufen oder über das Netzwerk verteilt sind. Diese Prozesse können dem Steuerungssystem überall im Netzwerk Dienste wie Hardwaresteuerung oder Datenverarbeitung bereitstellen.

Dieses Paket stellt einen TANGO-Datenbankserver zur Verfügung, der MySQL/MariaDB verwendet.

TANGO ist ein objektorientiertes, verteiltes Steuerungssystem. Es ermöglicht die Kommunikation zwischen TANGO-Geräteprozessen, die auf demselben Computer laufen oder über das Netzwerk verteilt sind. Diese Prozesse können dem Steuerungssystem überall im Netzwerk Dienste wie Hardwaresteuerung oder Datenverarbeitung bereitstellen.

Dieses Paket stellt einen TANGO-Gerätesteuerungsserver zur Verfügung. Er kann andere TANGO-Komponenten starten, stoppen oder ihren Status melden.

A digital multimeter (DMM) attached to the serial port is presented under a Qt surface. The tool plots values over time, has a simple scheduler for delayed starts and logging after a threshold was reached. It supports spawning external applications, too.

EPICS is a set of Open Source software tools, libraries and applications developed collaboratively and used worldwide to create distributed soft real-time control systems for scientific instruments such as a particle accelerators, telescopes and other large scientific experiments.

The RT-Preempt (http://rt.wiki.kernel.org) project provides patches to make Linux kernel capable of fulfilling hard realtime requirements. The aim is to eliminate all preemptivity and reactivity problems in the kernel over the time by adding deterministic preemption points. The -rt patches are constantly being worked on for mainline by the community.

Pengutronix's Realtime Linux for Debian project provides builds of the stock Linux kernel with the RT-Preempt patch (but without Debian patches).

MX is a data acquisition and control system that is designed to serve several functions:

• As a portable toolkit for writing data acquisition and control programs.
• As a standalone system capable of controlling entire experiments.
• As a platform for building device control servers to be used by other applications.
• As a way of extending other control systems and of glueing disparate control systems together.

OPeNDAP is a framework that simplifies all aspects of scientific data networking.

OPeNDAP provides software which makes local data accessible to remote locations regardless of local storage format.

OPeNDAP also provides tools for transforming existing applications into OPeNDAP clients (i.e., enabling them to remotely access OPeNDAP served data).

 The HART (Hardware Access in Real-Time) Toolbox can be used to
 generate Scicos-blocks for hardware that have a C/C++ interface. The
 blocks can be used under Linux for soft and hard real time tasks
 (RTAI). Blocks are provided for DAQ (COMEDI)

An easy to use Java program that allows you to digitize data points off of scanned plots, scaled drawings, or orthographic photographs. Includes an automatic digitization feature that can automatically digitize many types of functional data.