Debian Science Data acquisition packages

ClickHouse è un sistema di gestione di database orientato alle colonne che permette la generazione in tempo reale di rapporti analitici di dati.

Questo pacchetto fornisce vari strumenti per ClickHouse:

• clickhouse-performance-test,
• clickhouse-benchmark,
• clickhouse-compressor,
• clickhouse-copier e alcuni altri.

csvkit è una suite di strumenti a riga di comando per convertire e lavorare con CSV, il re dei formati tabellari di file.

È ispirato da pdftk, da gdal e dallo strumento originale csvcut di Joe Germuska e Aaron Bycoffe.

Se si necessita di fare analisi di dati più complesse di quelle che csvkit è in grado di gestire, usare agate.

Questo pacchetto fornisce gli strumenti a riga di comando.

Lo strumento Engauge Digitizer assiste nella estrazione interattiva di numeri da immagini o grafici. Concettualmente è perciò l'opposto di uno strumento per tracciare grafici che converte punti dati in grafici. Assiste nel miglioramento della qualità dell'immagine e nella corrispondenza dei punti dati. Engauge Digitizer è utilizzato da persone quali studenti universitari e ricercatori, oltre che da ingegneri e impiegati di grandi organizzazioni commerciali o governative, per elaborare file singoli, ma anche per gestire database di migliaia di file immagine.

Tra le caratteristiche di Engauge Digitizer sono incluse:

• rimozione automatica delle linee della griglia;
• riconoscimento automatico dei punti e degli assi;
• tracciamento automatico di curve;
• elaborazione di immagini per separare i dettagli importanti dalle informazioni di fondo;
• procedura guidata che fornisce un tutorial interattivo per spiegare i passi base;
• sistemi di coordinate multipli nella stessa immagine possono essere digitalizzati in modalità avanzata;
• interpolazione spline cubica tra i punti dà curve più accurate con meno punti;
• gestione di grafici cartesiani, polari, lineari e logaritmici;
• gestione del trascinamento e del copia-e-incolla;
• aiuto contestuale, manuale utente e tutorial spiegano ogni funzionalità;
• la finestra di anteprima permette un controllo immediato mentre si modificano le impostazioni;
• estrazione automatica di linee e punti per una rapida digitalizzazione dei dati.

g3data è usato per estrarre dati da grafici. Per esempio, nelle riviste scientifiche i grafici sono solitamente pubblicati senza tabelle dei dati reali: g3data rende facile il processo di estrarre tali dati.

La libreria hkl è un'infrastruttura per calcolo di diffrazione e controllo del diffrattometro, pesantemente usata nel sincrotrone SOLEIL. Gestisce vari tipi di geometria del diffrattometro: Eulerian 4-circle, Eulerian 6-circle, kappa 4-circle, kappa 6-circle e geometria dell'asse z. Per ognuna di esse fornisce diversi modi calcolati numericamente, come bisettore e psi costante.

Questo pacchetto fornisce una GUI sopra alla libreria hkl.

Jaaa (JACK and ALSA Audio Analyser) è un generatore di segnali audio e un analizzatore di spettro progettato per fare misurazioni accurate.

Jaaa permette di selezionare uno dei quattro input, e "Min" e "Max": le frequenze minima e massima visualizzate. Possono esserci fino a due marcatori che contengono valori di lettura accurati nel display.

libfreenect è una libreria multipiattaforma che fornisce le interfacce necessarie per attivare, inizializzare e comunicare i dati con l'hardware Kinect. Attualmente la libreria gestisce l'accesso a flussi video RGB e profondità, motori, accelerometri e LED, e fornisce collegamenti nei diversi linguaggi (C++, Python, ...).

Questa libreria è il componente a basso livello del progetto OpenKinect che è una comunità aperta di persone interessate all'uso dell'hardware Kinect di Xbox con PC e altri dispositivi.

Questo è il pacchetto di sviluppo contenente le librerie e gli header per lo sviluppo di software con libfreenect.

Il progetto GetData è l'implementazione di riferimento degli standard Dirfile, un formato di database basato su file system e orientato alle colonne per dati binari cronologicamente ordinati. Il formato di database Dirfile è progettato per fornire un formato semplice e veloce per memorizzare e leggere i dati.

Questo pacchetto contiene gli strumenti "checkdirfile" e "dirfile2ascii".

lxi-tools è una raccolta di strumenti software open source che permette il controllo di strumenti compatibili con LXI come oscilloscopi moderni, alimentatori, analizzatori di spettro, ecc.

Contiene i programmi ncdump e ncgen che convertono rispettivamente file NetCDF in ASCII e viceversa. NetCDF (network Common Data Form) è un'interfaccia per l'acceso a dati scientifici e una libreria software liberamente distribuibile che fornisce un'implementazione dell'interfaccia. La libreria netCDF definisce anche un formato indipendente dall'architettura per rappresentare dati scientifici. Insieme, interfaccia, libreria e formato permettono la creazione, l'accesso e la condivisione di dati scientifici.

Questo è un pacchetto fittizio di transizione e può essere rimosso senza problemi.

Open3D è una libreria open source che supporta il rapido sviluppo di software che ha a che fare con dati 3D. Il frontend Open3D espone un insieme di strutture dati e algoritmi accuratamente selezionati, sia in C++ sia in Python. Il backend è altamente ottimizzato ed è configurato per la parallelizzazione.

Questo pacchetto fornisce strumenti aggiuntivi per elaborazione dati.

Lo standard VISA fornisce un'interfaccia comune per la comunicazione con apparecchiature di test e misura.

Questo pacchetto fornisce i collegamenti Python 3 per VISA.

Sardana è un sistema SCADA (Supervision, Control And Data Acquisition; supervisione, controllo e acquisizione di dati) per installazioni scientifiche. È scritto in Python ed è basato sulla libreria TANGO. Si può accedere alle routine di controllo dell'hardware e di acquisizione dei dati attraverso una console IPython e un'interfaccia utente grafica generica (entrambe facilmente estensibili dall'utente).

segyio è una libreria veloce e comoda per leggere e scrivere dati sismici in formato SEG-Y. segyio è orientato all'accesso casuale per computer moderni con semplici primitive di lettura/scrittura sulle linee.

Questo pacchetto contiene utili programmi della shell.

Vnlog è un formato per log semplice in modo banale che consiste in una tabella ASCII con commenti e campi con etichette. Questo pacchetto fornisce strumenti per elaborare e manipolare tali log. Gli strumenti sono:

vnl-filter seleziona un sottoinsieme di righe/colonne in un vnlog o manipola i contenuti. È di fatto un wrapper per awk.

vnl-sort, vnl-uniq, vnl-join, vnl-tail e vnl-ts sono wrapper per i corrispondenti strumenti a riga di comando.

vnl-align allinea colonne di vnlog per una facile interpretazione da parte delle persone.

vnl-make-matrix converte un vnlog un-punto-per-riga in una matrice di dati.

I file xlsx sono archivi zip in cui sono memorizzati i dati di fogli di calcolo. Per poter elaborare un file, devono essere localizzati vari bit all'interno dell'archivio. Questa utilità usa l'analizzatore SAX Expat per raccogliere le stringhe in un semplice dizionario, usando come chiave la loro posizione relativa nel file XML. Ciò rende possibile elaborare file di qualunque dimensione.

xyscan è uno strumento per scienziati che hanno bisogno di estrarre punti dati, cioè valori numerici, da un grafico. Permette di analizzare i grafici ed estrarre i punti dati, inclusa la dimensione delle barre di errore (sia sulle x sia sulle y). Può gestire grafici con scale lineari e logaritmiche. Di fatto xyscan può essere usato per estrarre valori numerici da qualsiasi tipo di disegno tecnico 2D.

BINoculars è uno strumento per la riduzione di dati e per l'analisi di grandi insiemi di dati diffrazione di superficie che sono stati acquisiti con un rilevatore bidimensionale di raggi X. L'intensità di ciascun pixel di un rilevatore bidimensionale è proiettata su una griglia tridimensionale in coordinate reciproche di griglia usando un algoritmo di classificazione. Ciò permette una veloce acquisizione ed elaborazione di insiemi di dati ad alta risoluzione e ha come risultato una significativa riduzione delle dimensioni dell'insieme di dati. L'analisi successiva procede poi nello spazio reciproco. È evoluto dalle necessità specifiche del beamline ID03 allo ESRF, ma è una progettazione modulare e può essere facilmente adattato ed esteso per funzionare con dati da altri beamline o da altre tecniche di misurazione.

GDL (GNU Data Language) è un compilatore incrementale compatibile IDL (Interactive Data Language) e libero. Possiede una completa compatibilità di sintassi con IDL 7.1. IDL è un marchio registrato di ITT Visual Information Solutions. A partire da IDL 8.0 sono gestiti i seguenti elementi del linguaggio:

• ciclo FOREACH;
• indici negativi per array;
• garbage collector per oggetti e puntatori;
• metodi di chiamata per un oggetto usando "." (es. object.aMemberProcedure,arg1).

Il sistema di input e output di file non è completamente implementato. Viene ufficialmente fornita la gestione della GUI (widget), ma non è ancora completa.

Questo pacchetto contiene il frontend principale a riga di comando e per interprete.

Il demone del servizio gpsd può monitorare uno o più dispositivi GPS connessi al computer, rendendo tutti i dati relativi alla posizione ed ai movimenti dei sensori disponibili ad essere interrogati tramite la porta TCP 2947.

Con gpsd, più applicazioni client GPS possono condividere l'accesso ai dispositivi senza contenderseli o perdere dati. Inoltre gpsd risponde alle interrogazioni usando un formato molto semplice da analizzare rispetto ai differenti standard emessi dai dispositivi GPS.

Include anche gli strumenti comuni ubxtool e gpsctl per la configurazione di dispositivi dell'hardware locale, così come un ntpshmmon per controllare i dati refclock generati.

Questo è un pacchetto fittizio di transizione per facilitare gli aggiornamenti al pacchetto python3-tango. Può essere rimosso senza problemi.

It is simple to use in simple cases, but also supports complex pipelines that involve branching, joining, flow control, feedback, back pressure, and so on. Optionally, Streamz can also work with both Pandas and cuDF dataframes, to provide sensible streaming operations on continuous tabular data.

Taurus è un'infrastruttura Python per le CLI e le GUI di controllo e acquisizione dati in ambienti scientifici/industriali. Gestisce diversi sistemi di controllo o sorgenti dati: Tango, EPICS, ... Le nuove librerie del sistema di controllo possono essere integrate mediante plugin.

Questa è la versione per Python 3 del pacchetto.

rt-tests contiene un insieme di programmi che testano e misurano varie componenti del comportamento dei kernel in tempo reale, come latenza dei timer, latenza dei segnali e il funzionamento dei mutex per l'ereditarietà della priorità. Inoltre contiene hackbench, un programma per generare lavoro per lo schedulatore.

TANGO è un sistema di controllo distribuito orientato agli oggetti. Permette la comunicazione tra processi di device TANGO in esecuzione sullo stesso computer o distribuiti in rete. Questi processi possono fornire servizi per il sistema di controllo in tutta la rete, come controllo hardware o elaborazione di dati.

Questo pacchetto fornisce un server accesscontrol per TANGO. Può essere utilizzato per gestire gli utenti e gli indirizzi IP che hanno il permesso di accedere a device TANGO.

TANGO è un sistema di controllo distribuito orientato agli oggetti. Permette la comunicazione tra processi di device TANGO in esecuzione sullo stesso computer o distribuiti in rete. Questi processi possono fornire servizi per il sistema di controllo in tutta la rete, come controllo hardware o elaborazione di dati.

Questo pacchetto fornisce un server di database per TANGO usando MySQL/MariaDB.

TANGO è un sistema di controllo distribuito orientato agli oggetti. Permette la comunicazione tra processi di device TANGO in esecuzione sullo stesso computer o distribuiti in rete. Questi processi possono fornire servizi per il sistema di controllo in tutta la rete, come controllo hardware o elaborazione di dati.

Questo pacchetto fornisce un server per il controllo dei device TANGO. Può avviare, fermare o riportare lo stato di altri componenti TANGO.

A digital multimeter (DMM) attached to the serial port is presented under a Qt surface. The tool plots values over time, has a simple scheduler for delayed starts and logging after a threshold was reached. It supports spawning external applications, too.

EPICS is a set of Open Source software tools, libraries and applications developed collaboratively and used worldwide to create distributed soft real-time control systems for scientific instruments such as a particle accelerators, telescopes and other large scientific experiments.

The RT-Preempt (http://rt.wiki.kernel.org) project provides patches to make Linux kernel capable of fulfilling hard realtime requirements. The aim is to eliminate all preemptivity and reactivity problems in the kernel over the time by adding deterministic preemption points. The -rt patches are constantly being worked on for mainline by the community.

Pengutronix's Realtime Linux for Debian project provides builds of the stock Linux kernel with the RT-Preempt patch (but without Debian patches).

MX is a data acquisition and control system that is designed to serve several functions:

• As a portable toolkit for writing data acquisition and control programs.
• As a standalone system capable of controlling entire experiments.
• As a platform for building device control servers to be used by other applications.
• As a way of extending other control systems and of glueing disparate control systems together.

OPeNDAP is a framework that simplifies all aspects of scientific data networking.

OPeNDAP provides software which makes local data accessible to remote locations regardless of local storage format.

OPeNDAP also provides tools for transforming existing applications into OPeNDAP clients (i.e., enabling them to remotely access OPeNDAP served data).

 The HART (Hardware Access in Real-Time) Toolbox can be used to
 generate Scicos-blocks for hardware that have a C/C++ interface. The
 blocks can be used under Linux for soft and hard real time tasks
 (RTAI). Blocks are provided for DAQ (COMEDI)

An easy to use Java program that allows you to digitize data points off of scanned plots, scaled drawings, or orthographic photographs. Includes an automatic digitization feature that can automatically digitize many types of functional data.