Debian Science Engineering packages

CalculiX est une application d'analyse d'éléments finis libre qui utilise un format d'entrée similaire à celui d'Abaqus. Il a un solveur implicite et explicite, un préprocesseur et un postprocesseur (CGX). Ce paquet fournit le solveur CalculiX CrunchiX (cxx).

CalculiX GraphiX (cgx) est un pré et postprocesseur tridimensionnel pour les éléments finis. Des modèles à éléments finis de CalculiX CrunchiX peuvent être compilés, calculés et post-traités. Le pré et postprocesseur est un outil 3D interactif utilisant l'API openGL.

En plus des fichiers de résultats de CalculiX CrunchiX, les résultats d'OpenFoam, Duns (2D et 3D), Isaac (2D et 3D) et Nastran (f06) peuvent être lus. Pour prétraiter le format natif Netgen, STEP et STL peuvent être importés.

Il s'agit d'un petit outil de résistance des matériaux pour calculer les efforts de section et les réactions d'appui d'une poutre continue. Une base de données de matériaux et de sections est incluse pour choisir le module d'élasticité et le moment d'inertie. Les conditions d'appui peuvent être fixées différemment pour chaque nœud.

Le système de notation générale CFD (CGNS) fournit un standard général, portable et extensible pour le stockage et la récupération de données d'analyse de mécanique des fluides numérique (CFD). Il consiste en un ensemble de conventions et de logiciels libres implémentant ces conventions. Il est autodescriptif, indépendant de la machine, bien documenté et administré par un comité de direction international. Il s'agit également d'une pratique recommandée de l'institut américain d'aéronautique et d'astronautique (AIAA).

Ce paquet fournit les outils adf2hdf et hdf2adf.

Code_Aster est un solveur à éléments finis pour les équations aux dérivées partielles utilisé par l'industrie nucléaire française. Code-aster-gui fournit un frontal Tcl pour ses systèmes de construction Python et de contrôle.

Ce paquet fournit le client code-aster-gui qui a besoin de se connecter à un serveur installé localement ou à distance (dans le paquet code-aster-run).

Le capacités de base de Code Saturne permettent de gérer des flux incompressibles ou expansibles avec ou sans transfert de chaleur et turbulence. Des modules dédiés sont disponibles pour des physiques particulières telles que le transfert de chaleur radiatif, la combustion (gaz, charbon, fioul lourd, etc.), la magnéto-hydrodynamique, les flux compressibles, les flux en deux phases (approche d'Euler-Lagrange avec couplage bidirectionnel), les extensions d'applications spécifiques (par exemple Mercure_Saturne pour l'environnement atmosphérique).

Il s'exécute en parallèle avec MPI sur des machines à mémoire distribuée. Développé depuis 1997 à EDF R&D, il est basé sur une approche à volumes finis co-localisés qui accepte les réseaux maillés de tout type de cellules (tétraédrique, hexaédrique, prismatique, pyramidal, polyédral, etc.) et tout type de structure de grille (non structuré, en bloc, hybride, avec des « nœuds suspendus » (hanging nodes), etc.).

Dime is a C++ class library for reading, constructing, manipulating, and writing DXF file data.

This package comes with the programs dxf2vrml, which converts dxf to VRML files and dxfsphere, which makes triangle mesh approximations of spheres.

FEniCS est une collection de logiciels libres pour la résolution automatique et rapide d’équations différentielles.

FEniCS possède une longue liste de fonctions, comprenant entre autres, la résolution automatique de problèmes variationnels, le contrôle automatique d’erreur, une bibliothèque complète d’éléments finis, une algèbre linéaire hautement performante.

FEniCS est organisée sous forme de collection de composants interopérables, comprenant l’environnement DOLFIN de résolution de problème, le compilateur de formes FFC, le « tabulateur » pour les éléments finis FIAT, le compilateur en temps réel Instant, l’interface de génération de code UFC, le langage de formes UFL et une variété de composants supplémentaires.

Il s’agit d’un métapaquet dépendant de tous les composants de FEniCS.

Il s’agit de la version historique de FEniCS. L’installation de la nouvelle génération, FEniCS-X (paquet fenicx), est à envisager.

Pour l’impression en 3D, l’usinage avec des machines à commande numérique par calculateur (CNC) ou l’assemblage manuel de constructions complexes, une spécification formelle des différentes parties, c’est-à-dire, leurs composantes et comment elles s’assemblent. La façon de le réaliser est appelée CAO (conception assistée par ordinateur). Le procédé de transformer un modèle de CAO en une série d’instructions pouvant être réalisées par une machine est appelé FAO (fabrication assistée par ordinateur). FreeCAD peut réaliser les deux fonctions, la première de façon encore un peu mieux que la dernière.

FreeCAD est un logiciel de modélisation au code source ouvert basé sur OpenCasCade, Qt et Python. Il présente quelques concepts clefs tels que l’enregistrement de macros, différents environnements de travail (workbench), la possibilité d’une exécution comme serveur et des extensions d’application chargeables dynamiquement. Il est conçu pour être indépendant de la plateforme.

Actuellement, FreeCAD peut importer et afficher les modèles de conception assistée par ordinateur aux formats IGES, STEP et BRep et de maillages aux formats STL, BMS, AST et OBJ de Wavefront. Les fonctions d’édition et de modèles sont actuellement quelque peu limitées.

Il s’agit d’un métapaquet pour les paquets de composant de FreeCAD.

Gerris est un système pour résoudre des équations différentielles partielles décrivant un écoulement de fluide.

Voici un bref résumé de ses propriétés principales (actuelles) :

 – résolution des équations d'Euler, Stokes ou Navier-Stokes pour
   des écoulements incompressibles en fonction de la densité et du temps ;
 – ajustement adaptatif de maillage : la résolution est adaptée
   dynamiquement aux caractéristiques du flux ;
 – génération entièrement automatique de maillage en géométrie complexe ;
 – second ordre dans le temps et l'espace ;
 – nombre illimité de traceurs passifs diffusés ou advectés ;
 – spécification flexible de termes source additionnels ;
 – gestion parallèle portable par la bibliothèque MPI ;
 – schéma d'advection de volume de fluide pour les flux interfaciaux.

Ce paquet fournit une prise en charge interne de MPI.

GetDP est un solveur général d’éléments finis utilisant des éléments mélangés pour rendre discrets des complexes différentiels de type De Rham en une, deux ou trois dimensions.

La principale caractéristique de GetDP est la proximité entre les données d’entrée définissant les problèmes d’éléments finis (écrites par l’utilisateur dans des fichiers de données en ASCII) et les expressions mathématiques symboliques de ces problèmes.

Consulter le manuel de référence de GetDP pour un aperçu plus approfondi des possibilités de GetDP : http://www.geuz.org/getdp

Gmsh est un générateur de grille 3D d'éléments finis, muni d'un moteur de CAD intégré et d’un post-processeur. Il a été conçu pour fournir un outil de maillage, rapide léger et facile à utiliser avec des entrées paramétriques et des capacités avancées de visualisation. Gmsh est construit autour de quatre modules : géométrie, maillage, solveur et post-processeur. La spécification d'une donnée à ces modules est faite soit de manière interactive en utilisant l'interface utilisateur graphique, soit dans des fichiers texte en ASCII utilisant le langage de script propre à Gmsh.

Consultez le manuel de référence de Gmsh pour une vue d'ensemble plus complète des possibilités offertes par Gmsh.

ADIOS (Adaptable IO System) fournit aux scientifiques un moyen simple et flexible pour décrire dans leur code les données qui doivent être écrites, lues ou traitées en dehors de la simulation d'exécution. En fournissant un fichier XML extérieur au code décrivant les divers éléments, leurs types et comment vous souhaitez les traiter à l'exécution, les routines du code hôte (soit en Fortran ou en C) peuvent modifier de façon transparente la façon dont elles traitent les données.

Ce paquet fournit les outils à utiliser avec ADIOS.

LibreCAD is an application for computer aided design (CAD) in two dimensions (2D). With LibreCAD you can create technical drawings such as plans for buildings, interiors, mechanical parts or schematics and diagrams.

This package contains a number of utilities for manipulating and viewing Silo files. Silo is a scientific data format library.

Silo supports gridless (point) meshes, structured meshes, unstructured-zoo and unstructured-arbitrary-polyhedral meshes, block structured AMR meshes, constructive solid geometry (CSG) meshes, piecewise-constant (e.g. zone-centered) and piecewise-linear (e.g. node-centered) variables defined on the node, edge, face or volume elements of meshes as well as the decomposition of meshes into arbitrary subset hierarchies including materials and mixing materials. In addition, Silo supports a wide variety of other useful objects to address various scientific computing application needs. Although the Silo library is a serial library, it has some key features which enable it to be applied quite effectively and scalable in parallel.

lxi-tools est une collection d’outils logiciels au code source ouvert qui permettent le contrôle d’instruments compatibles avec la norme LXI tels que les oscilloscopes modernes, les alimentations électriques, les analyseurs de spectre, etc.

NETGEN est un générateur automatique de maillage tétraédrique 3D. Il accepte en entrée les produits de la géométrie de construction de solides (CSG) ou de la modélisation surfacique (BRep) à partir de fichiers au format STL. NETGEN fournit des modules d'optimisation de maillage et d'affinage hiérarchique de maillage.

OpenFOAM is the free, open source CFD software released and developed primarily by OpenCFD Ltd since 2004. It has a large user base across most areas of engineering and science, from both commercial and academic organisations. OpenFOAM has an extensive range of features to solve anything from complex fluid flows involving chemical reactions, turbulence and heat transfer, to acoustics, solid mechanics and electromagnetics.

Package contains binaries.

Persalys est une interface graphique pour OpenTURNS qui se consacre au traitement d’incertitudes et la gestion de dispersions. Ce logiciel est un outil entre la simulation de calculs, l’analyse probabiliste et la science des données. Cette interface est disponible en français et anglais.

Persalys permet de :

 – créer des modèles mathématiques : calcul analytique, couplage avec des
   éléments externes (éléments finis…), FMU ;
 – analyse de la dispersion de paramètres grâce à de nombreuses méthodes
   et d’outils de visualisation ;
 – analyse statistique de données de mesure, inférence de distribution de probabilités
   ou création de métamodèles.

It lets you manipulate 3D models in binary or ASCII STL format and partially repair them if necessary.

This is the Python 3 version of the package.

DOLFIN is the Python and C++ interface of the FEniCS project for the automated solution of differential equations, providing a consistent PSE (Problem Solving Environment) for solving ordinary and partial differential equations. Key features include a simple, consistent and intuitive object-oriented API; automatic and efficient evaluation of variational forms; automatic and efficient assembly of linear systems; and support for general families of finite elements.

This is the base package depending on specific dolfin builds. By default the version built against the preferred version of PETSc in /usr/lib/petsc is selected (with 32-bit indexing, but the alternative version (64-bit PETSc) can be selected by setting the environment variable PETSC_DIR.

This is the legacy version of DOLFIN, you may want to install the next-generation python3-dolfinx (DOLFIN-X) instead.

Escript is a programming tool for implementing mathematical models in Python using the finite element method (FEM). Because users do not access the data structures it is very easy to use and scripts can run on desktop computers as well as highly parallel supercomputer without changes. Application areas for escript include earth mantle convection, geophysical inversion, earthquakes, porous media flow, reactive transport, plate subduction, erosion, and tsunamis.

Scripts can be executed in parallel (on varying numbers of threads or nodes) without any special modifications.

Escript now includes the esys.downunder module for 3D inversion of geophysical data sets. The current version supports gravity, magnetic and joint inversion.

This package contains the commands and libraries for Python3 with both OpenMP threading and MPI multiprocess support.

FIAT (FInite element Automatic Tabulator — tabulateur pour les éléments finis) gère la génération d'instances d’ordre arbitraire des éléments de Lagrange pour des lignes, des triangles et des tétraèdres. Parmi les autres éléments pris en charge, se trouvent les éléments de Raviart-Thomas d’ordre arbitraire, les éléments de Brezzi-Douglas-Marini et quelques autres.

Ce paquet installe la bibliothèque pour Python 3.

OpenTURNS is a powerful and generic tool to treat and quantify uncertainties in numerical simulations in design, optimization and control. It allows both sensitivity and reliability analysis studies:

• defining the outputs of interest and decision criterion;
• quantify and model the source of uncertainties;
• propagate uncertainties and/or analyse sensitivity and
• rank the sources of uncertainty

Targeted users are all engineers who want to introduce the probabilistic dimension in their so far deterministic studies.

This package provides the Python3 bindings to the library.

Persalys is a graphical user interface for OpenTURNS, dedicated to the treatment of uncertainty and the management of variabilities. The software is a tool between the computer simulation, probabilistic analyses and the data sciences. The interface is available in French or in English.

Persalys allows one to:

• create mathematical models: analytical, coupling with an external model (finite elements, ...), FMU;
• analyse the variability of one's parameters thanks to many methods and visualisation tools;
• statistically analyse one's measuring data, infer probability distributions or create metamodels.

This package contains the Python3 bindings.

This is a Python3 interface to SILO, a scientific I/O library.

Silo supports gridless (point) meshes, structured meshes, unstructured-zoo and unstructured-arbitrary-polyhedral meshes, block structured AMR meshes, constructive solid geometry (CSG) meshes, piecewise-constant (e.g. zone-centered) and piecewise-linear (e.g. node-centered) variables defined on the node, edge, face or volume elements of meshes as well as the decomposition of meshes into arbitrary subset hierarchies including materials and mixing materials. In addition, Silo supports a wide variety of other useful objects to address various scientific computing application needs. Although the Silo library is a serial library, it has some key features which enable it to be applied quite effectively and scalable in parallel.

Sailcut CAD est un logiciel de conception et de traçage de voile qui vous permet de concevoir et visualiser vos propres voiles et de transformer le développement précis de tous vos panneaux en patron. Vous pouvez exporter vos voiles en fichiers DXF, texte ou en fichier de traçage Carlson.

L'interface de Sailcut CAD est disponible en anglais, français, hollandais, allemand, italien, norvégien, portugais, danois et russe.

Il s’agit d’un outil d’analyse probabiliste de risque capable de réaliser des analyses d’arbre d’évènements, une analyse statique d’arbre de défauts, une analyse avec des modèles de panne courante, des calculs de probabilité avec analyse d’importance et une analyse d’incertitude avec des simulations de Monte Carlo.

SolveSpace est un programme de CAO paramétrique pour la 2D et 3D. Applications incluses :

 – modélisation en 3D : dessin avec des opérations d’extrusion, de
   révolution et booléennes (union, différence ou intersection) ;
 – modélisation en 2D : dessin de pièces en vue simple et exportation en
   DXF, PDF ou SVG, utilisation de l’assemblage en 3D pour vérifier la
   concordance ;
 – impression en 3D : exportation du STL ou autre maillage triangulaire
   attendu par la plupart des imprimantes en 3D ;
 – préparation des données CAM : exportation du dessin vectoriel en 2D pour
   un découpage au jet d’eau ou par laser, ou génération de STEP ou STL
   pour importation dans un logiciel CAM tiers pour usinage ;
 – conception de mécanisme : utilisation du solveur de contraintes pour
   simuler les couplages planaires ou spatiaux avec des tourillons, des
   billes ou des articulations en glissière ;
 – géométrie en deux ou trois dimensions : remplacement de la trigonométrie
   et des feuilles de calcul à la main avec le dessin aux dimensions en
   direct.

SYRTHES est un logiciel générique pour la thermique développé par EDF R&D, qui modélise les transferts de chaleur par conduction et radiation dans des géométries complexes.

SYRTHES peut être utilisé associé avec le logiciel de mécanique des fluides numérique, Code_Saturne.

TetGen crée une « tétraèdrisation » de Delaunay (tetrahedralization), un diagramme de Voronoï et une enveloppe convexe d’ensembles de points en trois dimensions, génère la « tétraèdrisation » de Delaunay restreinte et des maillages tétraédriques de qualité pour des domaines en trois dimensions avec des limites linéaires d’intervalle.

Z88 features 20 finite element types covering plane stress, plate bending, axial symmetric structures and spacial structures up to 20-node Serendipity hexahedrons. Z88 comes with a user-friendly interface, a powerful mesh generator, a DXF-converter, two plot programs and, of course, two powerful solvers. Import of COSMOS files from Pro/ENGINEER and Pro/MECHANICA is supported.

ANN est une bibliothèque écrite en C++ qui gère les structures de données et les algorithmes pour effectuer des recherches exactes ou approchées des plus proches voisins dans des dimensions arbitrairement élevées. ANN suppose que les distances sont mesurées en utilisant une classe de fonctions de distances appelées métriques de Minkowski. Cela inclut la bien connue distance euclidienne, la distance de Manhattan et la distance max. ANN est plutôt efficace pour les jeux de points allant de milliers à des centaines de milliers et ce, jusqu'à 20 dimensions.

Ce paquet fournit les programmes ann2fig (afficheur ANN au format fig) et ann_sample (un exemple de ficher ANN).

CalculiX est une application d'analyse d'éléments finis libre qui utilise un format d'entrée similaire à celui d'Abaqus. Il a un solveur implicite et explicite, un préprocesseur et un postprocesseur (CGX).

Ce paquet fournit les fichiers d'exemple pour CalculiX CrunchiX.

CalculiX GraphiX (cgx) est un pré et postprocesseur tridimensionnel pour les éléments finis. Des modèles à éléments finis de CalculiX CrunchiX peuvent être compilés, calculés et post-traités. Le pré et postprocesseur est un outil 3D interactif utilisant l'API openGL.

En plus des fichiers de résultats de CalculiX CrunchiX, les résultats d'OpenFoam, Duns (2D et 3D), Isaac (2D et 3D) et Nastran (f06) peuvent être lus. Pour prétraiter le format natif Netgen, STEP et STL peuvent être importés.

Ce paquet fournit les exemples.

La surveillance d’applications distribuées réparties dans un réseau n’est pas une tâche facile. Les informations issues de plusieurs sources doivent être rassemblées, filtrées et dirigées vers des outils de visualisation.

LogService est un système simplifiant cette tâche. Il agit sous forme de base commune entre les applications et les outils de visualisation. Il fournit aussi un mécanisme pour classer et filtrer les messages de façon générale. D’autres fonctions sont nécessaires pour suivre les applications distribuées.

Le service s’appelle LogCentral.

La surveillance d’applications distribuées réparties dans un réseau n’est pas une tâche facile. Les informations issues de plusieurs sources doivent être rassemblées, filtrées et dirigées vers des outils de visualisation.

LogService est un système simplifiant cette tâche. Il agit sous forme de base commune entre les applications et les outils de visualisation. Il fournit aussi un mécanisme pour classer et filtrer les messages de façon générale. D’autres fonctions sont nécessaires pour suivre les applications distribuées.

Le service s’appelle LogCentral.

Il s’agit d’une évaluation de cartes de contrôle au moyen de l’état zéro et d’ARL (Average Run Length – Période opérationnelle moyen) d’état stable, et de l’établissement de graphiques de contrôle pour un ARL donné et du tracé des courbes relatives. Les cartes de contrôle en considération sont des cartes EWMA (moyenne mobile exponentielle) et CUSUM (somme cumulative) unilatère ou bilatère pour superviser la moyenne de données indépendantes normalement distribuées. Désormais, le calcul d’ARL de cartes de contrôle EWMA-S^2 est ajoutée. D’autres cartes et d’autres paramètres sont en préparation. De futurs domaines de contrôle de maîtrise statistique des procédés seront aussi couverts (plans d’échantillonnage, indices d’aptitude…).

METIS: A Family of Multilevel Partitioning Algorithms

This is a collection of serial and parallel programs & libraries that can be used to partitioning unstructured graphs, finite element meshes, and hypergraphs, both on serial as well as on parallel computers.

Adaptation of METIS for Code_Aster purpose

BRL-CAD is a powerful combinatorial Constructive Solid Geometry solid modeling system that includes interactive 3D solid geometry editing, high-performance ray-tracing support for rendering and geometric analysis, network-distributed framebuffer support, image and signal-processing tools, path-tracing and photon mapping support for realistic image synthesis, a system performance analysis benchmark suite, an embedded scripting interface, and libraries for robust high-performance geometric representation and analysis.

BRL-CAD supports a great variety of geometric representations including an extensive set of traditional CSG primitive implicit solids such as boxes, ellipsoids, cones, and tori, as well as explicit solids made from closed collections of Uniform B-Spline Surfaces, Non-Uniform Rational B-Spline (NURBS) surfaces, n-Manifold Geometry (NMG), and purely faceted mesh geometry. All geometric objects may be combined using boolean set-theoretic CSG operations including union, intersection, and difference.

DIET (Distributed Interactive Engineering Toolbox) is a middleware designed for HPC (High Performance Computing) in heterogeneous and distributed environments (workstations, clusters, grids, clouds). DIET provides a standard-compliant implementation of OGF (Open Grid Forum) Grid RPC API. It works in a hierarchical fashion, clients requests computational resources to a hierarchy of agents which will choose the most adequate computational service (known as SeD or Server Daemon).

DIET is the core component of SysFera-DS HPC middleware (http://www.sysfera.com/SysFera-DS,10).

This package include agents necessary to run a DIET hierarchy.

The aim of openmeca is to provide a software for simulating mechanical systems easily. It provides a graphical application that build a 3D scheme, where the bonds are represented by symbols and gives a simple way to apply loadings, boundary conditions and manage contacts.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé GUI runtime binaries, private libraries, and python files comprising a basic Salomé GUI installation.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé JOBMANAGER module.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé core runtime binaries, private libraries, and python files comprising a basic Salomé installation.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé MED private libraries and python files.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé PARAVIS module, for visualization using paraview.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé SMESH module.

Salomé is a pre- and post-processor for numerical simulations. It can import CAD files in IGES and STEP formats, facilitates component integration in heterogeneous systems, and has a user-friendly GUI as well as a Python console with all of the platform functionality.

This package contains the Salomé YACS module. YACS stands for dYnamic pArallel Coupling System.

Tochnog is a program for finite element analysis. Multithreading and multiprocessor systems are supported. Here is a partial list of models supported:

• Differential equations (materials).
• Convection-diffusion equations,
• Stokes and Navier-Stokes,
• Elasticity (isotropy and transverse isotropy),
• Plasticity (Von-Mises, Mohr-Coulomb, Gurson, etc.; plasticity surfaces can be arbitrarily combined).

Residues in equations and error estimates for all data can be printed/plotted.

VARKON is a high level development tool for applications in the area of Engineering, Computer Aided Design and Product Modelling.

VARKON can be used as a traditional CAD-system with drafting, modelling and visualisation if you want to but the real power of VARKON is in parametric modelling and CAD applications development. VARKON includes interactive parametric modelling in 2D or 3D but also the unique MBS programming language integrated in the graphical environment.

AVL is a program for the aerodynamic and flight-dynamic analysis of rigid aircraft of arbitrary configuration. It employs an extended vortex lattice model for the lifting surfaces, together with a slender-body model for fuselages and nacelles. General nonlinear flight states can be specified. The flight dynamic analysis combines a full linearization of the aerodynamic model about any flight state, together with specified mass properties.

The package contains a wrapper on top of the ADF and MLL APIs, some tools, demos, tests, and examples taken from the CGNS tutorial.